MMP11 - MMP11

MMP11
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1HV5
Identifikatorlar
Taxalluslar	MMP11, SL-3, ST3, STMY3, matritsali metallopeptidaza 11
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 185261 MGI: 97008 HomoloGene: 38116 Generkartalar: MMP11
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	22-xromosoma (odam)
Oxiri	23,784,316 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 10 (sichqoncha)
Oxiri	75,936,496 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• rux ioni bilan bog'lash; • peptidaza faolligi; • metalloendopeptidaza faolligi; • gidrolaza faolligi; • metallopeptidaza faolligi; • metall ionlari bilan bog'lanish; • serin tipidagi endopeptidaza faolligi;
Uyali komponent	• Golgi lümeni; • hujayradan tashqari mintaqa; • hujayradan tashqari matritsa; • hujayradan tashqari;
Biologik jarayon	• kollagen katabolik jarayoni; • ko'p hujayrali organizm rivojlanishi; • yog 'hujayralari farqlanishining salbiy regulyatsiyasi; • hujayradan tashqari matritsani demontaj qilish; • proteoliz; • kollagen fibril tashkiloti; • bazal membranani tashkil etish; • hujayradan tashqari matritsani tashkil etish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	4320
	17385
	ENSG00000275365; ENSG00000099953
	ENSMUSG00000000901
	P24347
	Q02853
	NM_005940
	NM_008606; NM_001306184
	NP_005931; NP_005931.2
	NP_001293113; NP_032632
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Stromelizin-3 (SL-3) sifatida ham tanilgan matritsali metalloproteinaza-11 (MMP-11) an ferment odamlarda kodlanganligi MMP11 gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funktsiya

Matritsali metalloproteinaza oqsillari (MMP ) buzilishida oila ishtirok etadi hujayradan tashqari matritsa normal fiziologik jarayonlarda, masalan, embrional rivojlanish, ko'payish va to'qimalarni qayta qurish, shuningdek artrit va metastaz kabi kasallik jarayonlarida. Ko'pgina MMPlar hujayradan tashqaridagi proteinazalar bilan bo'linib faollashadigan harakatsiz proproteinlar sifatida ajralib chiqadi. Shu bilan birga, ushbu gen tomonidan kodlangan ferment hujayra ichidan faollashadi furin konstitutsiyaviy sekretor yo'lida. Boshqa MMPlardan farqli o'laroq, bu ferment parchalanadi alfa 1-proteinaz inhibitori ammo hujayradan tashqari matritsaning tarkibiy oqsillarini zaif darajada susaytiradi.^[8]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v ENSG00000099953 GRCh38: Ensembl chiqishi 89: ENSG00000275365, ENSG00000099953 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000000901 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Levy A, Zukman J, Delattre O, Mattei MG, Rio MC, Basset P (Avgust 1992). "22-xromosoma q11.2 mintaqasiga odamning stromelizin 3 (STMY3) genini tayinlash". Genomika. 13 (3): 881–3. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90175-R. PMID 1639418.
^ Anglard P, Melot T, Guerin E, Tomas G, Basset P (Okt 1995). "Odam stromelisin-3 genining tuzilishi va targ'ibotchi xarakteristikasi". J Biol Chem. 270 (35): 20337–44. doi:10.1074 / jbc.270.35.20337. PMID 7657606.
^ Luo D, Mari B, Stoll I, Anglard P (Iyul 2002). "Muqobil biriktirish va promotor yordamida to'g'ridan-to'g'ri faol matritsa metalloproteinaza sifatida tarjima qilingan hujayra ichidagi stromelizin 3 izoform hosil bo'ladi". J Biol Chem. 277 (28): 25527–36. doi:10.1074 / jbc.M202494200. PMID 12006591.
^ ^a ^b "Entrez Gen: MMP11 matritsasi metallopeptidaza 11 (stromelizin 3)".

Qo'shimcha o'qish

Nagase H, Woessner JF (1999). "Matritsali metalloproteinazalar". J. Biol. Kimyoviy. 274 (31): 21491–4. doi:10.1074 / jbc.274.31.21491. PMID 10419448.
Basset P, Bellocq JP, Wolf C va boshq. (1991). "Ko'krak karsinomalarining stromal hujayralarida maxsus ifoda etilgan yangi metalloproteinaz geni". Tabiat. 348 (6303): 699–704. doi:10.1038 / 348699a0. PMID 1701851.
Pei D, Majmudar G, Vayss SJ (1994). "Ko'krak karsinomasi hujayrasidan kelib chiqadigan serpinni odamning stromelisin-3 tomonidan gidroliz bilan inaktivatsiyasi". J. Biol. Kimyoviy. 269 (41): 25849–55. PMID 7523394.
Pei D, Vayss SJ (1995). "Furinga bog'liq bo'lgan odamning stromelisin-3 zimogenining hujayra ichidagi faollashishi" (PDF). Tabiat. 375 (6528): 244–7. doi:10.1038 / 375244a0. PMID 7746327.
Boulay A, Masson R, Chenard MP va boshqalar. (2001). "Sinogenli o'smalarda saraton hujayralarining yuqori darajada o'lishi, stromelizin-3 matritsasi metalloproteinaza uchun etishmaydigan sichqonlarda rivojlangan". Saraton kasalligi. 61 (5): 2189–93. PMID 11280785.
Perret AG, Dyutel R, Fotso MJ va boshq. (2002). "Stromelysin-3 agressiv meningioma bilan ifodalanadi". Saraton. 94 (3): 765–72. doi:10.1002 / cncr.10270. PMID 11857311.
Nakopoulou L, Panayotopoulou EG, Jannopoulou I va boshq. (2003). "Ko'krak qafasi invaziv saratonida Stromelysin-3 oqsil ekspressioni: ko'payish bilan bog'liqlik, hujayralardagi omon qolish va bemorlarning natijalari". Tartibni Pathol. 15 (11): 1154–61. doi:10.1097 / 01.MP.0000037317.84782.CD. PMID 12429794.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH va boshq. (2003). "15000 dan ortiq to'liq uzunlikdagi odam va sichqonchani cDNA sekanslarini yaratish va dastlabki tahlil qilish". Proc. Natl. Akad. Ilmiy ish. AQSH. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Vasenius VM, Hemmer S, Kettunen E va boshq. (2003). "Gepatotsitlar o'sish faktori retseptorlari, matritsali metalloproteinaz-11, metalloproteinaza-1 to'qimalarining inhibitori va fibronektin papiller tiroid karsinomasida yuqori darajada tartibga solinadi: cDNA va to'qima mikroarray tadqiqotlari". Klinika. Saraton kasalligi. 9 (1): 68–75. PMID 12538453.
Fromigué O, Lui K, Vu E va boshq. (2003). "Faol stromelizin-3 (MMP-11) p42 / p44 MAP-kinazni faollashtirish orqali uch o'lchovli Matrigel madaniyatida MCF-7 ning omon qolishini oshiradi". Int. J. Saraton. 106 (3): 355–63. doi:10.1002 / ijc.11232. PMID 12845673.
Skoglund J, Emterling A, Arbman G va boshq. (2004). "Kolorektal saraton kasalligida stromelizin-3 ekspresiyasining klinik-patologik ahamiyati". Onkologiya. 67 (1): 67–72. doi:10.1159/000080288. PMID 15459498.
Gerxard DS, Vagner L, Feingold EA va boshq. (2004). "NIH to'liq metrajli cDNA loyihasining holati, sifati va kengayishi: sutemizuvchilar genlari to'plami (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121-7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Louis K, Gérineau N, Fromigué O va boshq. (2005). "Stromalizin-3 stromal omilining o'sma hujayralari vositasida induktsiyasi, o'ziga xos protein kinaz S izoformalarining heterotipik hujayraning kontaktga bog'liq aktivatsiyasini talab qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 280 (2): 1272–83. doi:10.1074 / jbc.M405482200. PMID 15509588.
Deng X, Guo RF, Li VM va boshqalar. (2005). "Matritsali metalloproteinaza 11 ning kamayishi oshqozon saraton hujayralarida hujayralar ko'payishini inhibe qiladi". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 326 (2): 274–81. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.11.027. PMID 15582574.
Arora S, Kaur J, Sharma S va boshqalar. (2005). "Stromelysin 3, Ets-1 va tomirlar ichidagi endotelial o'sish omili ekspressioni saraton va saraton kasalliklarida: mikrovessel zichligi, progressiya va prognoz bilan o'zaro bog'liqlik". Klinika. Saraton kasalligi. 11 (6): 2272–84. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-04-0572. PMID 15788677.
Vazkes-Ortiz G, Pina-Sanches P, Vazkes K va boshq. (2006). "Bachadon bo'yni saratonida katepsin F, matritsali metalloproteinazalar 11 va 12 ning ortiqcha ekspressioni". BMC saratoni. 5: 68. doi:10.1186/1471-2407-5-68. PMC 1175083. PMID 15989693.

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 22 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v ENSG00000099953 GRCh38: Ensembl chiqishi 89: ENSG00000275365, ENSG00000099953 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000000901 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid1639418-5] Levy A, Zukman J, Delattre O, Mattei MG, Rio MC, Basset P (Avgust 1992). "22-xromosoma q11.2 mintaqasiga odamning stromelizin 3 (STMY3) genini tayinlash". Genomika. 13 (3): 881–3. doi:10.1016 / 0888-7543 (92) 90175-R. PMID 1639418.

[pmid7657606-6] Anglard P, Melot T, Guerin E, Tomas G, Basset P (Okt 1995). "Odam stromelisin-3 genining tuzilishi va targ'ibotchi xarakteristikasi". J Biol Chem. 270 (35): 20337–44. doi:10.1074 / jbc.270.35.20337. PMID 7657606.

[pmid12006591-7] Luo D, Mari B, Stoll I, Anglard P (Iyul 2002). "Muqobil biriktirish va promotor yordamida to'g'ridan-to'g'ri faol matritsa metalloproteinaza sifatida tarjima qilingan hujayra ichidagi stromelizin 3 izoform hosil bo'ladi". J Biol Chem. 277 (28): 25527–36. doi:10.1074 / jbc.M202494200. PMID 12006591.

[entrez-8] "Entrez Gen: MMP11 matritsasi metallopeptidaza 11 (stromelizin 3)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

Proteazlar: metalloendopeptidazalar (EC 3.4.24 )
ADAM oqsillari	Alfa sekretsiyalari ADAM9 ADAM10 ADAM17 ADAM19 ADAM2 ADAM7 ADAM8 ADAM11 ADAM12 ADAM15 ADAM18 ADAM22 ADAM23 ADAM28 ADAM33 ADAMTS1 ADAMTS2 ADAMTS3 ADAMTS4 ADAMTS5 ADAMTS8 ADAMTS9 ADAMTS10 ADAMTS12 ADAMTS13
Matritsali metalloproteinazlar	Kollagenazlar MMP1 MMP8 Jelatinazlar MMP2 MMP9 MMP3 MMP7 MMP10 MMP11 MMP12 MMP13 MMP14 MMP15 MMP16 MMP17 MMP19 MMP20 MMP21 MMP23A MMP23B MMP24 MMP25 MMP26 MMP27 MMP28
Boshqalar	Neprilysin Prokollagen peptidaz Termolizin Homiladorlik bilan bog'liq plazma oqsili A Suyak morfogenetik oqsil 1 Lisostafin Insulinni parchalaydigan ferment ZMPSTE24

Fermentlar
Faoliyat	Faol sayt Majburiy sayt Katalitik uchlik Oksiyon teshigi Fermentlarning buzilishi Katalitik jihatdan mukammal ferment Koenzim Kofaktor Ferment katalizi
Tartibga solish	Allosterik regulyatsiya Hamkorlik Ferment inhibitori Ferment aktivatori
Tasnifi	EC raqami Superfamily ferment Fermentlar oilasi Fermentlar ro'yxati
Kinetika	Fermentlar kinetikasi Eadi-Xofsti diagrammasi Xanlar-Vulf fitnasi Lineweaver - Burk fitnasi Michaelis-Menten kinetikasi
Turlari	EC1 Oksidoreduktazalar (ro'yxat ) EC2 Transferazalar (ro'yxat ) EC3 Gidrolazalar (ro'yxat ) EC4 Lizalar (ro'yxat ) EC5 Izomerazalar (ro'yxat ) EC6 Ligazlar (ro'yxat ) EC7 Translokaza (ro'yxat )