MMP8 - MMP8

MMP8
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	1A86, 1JAP, 1I76, 1ZVX, 3TT4, 2OY2, 1ZS0, 1JAN, 1MMB, 1I73, 1A85, 1KBC, 1ZP5, 1JH1, 3DPF, 1JAQ, 3DPE, 1BZS, 4QKZ, 1JAO, 3DNG, 2OY4, 1MNC
Identifikatorlar
Taxalluslar	MMP8, CLG1, HNC, MMP-8, PMNL-CL, matritsali metallopeptidaza 8
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 120355 MGI: 1202395 HomoloGene: 22482 Generkartalar: MMP8
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 11 (odam)
Oxiri	102,727,050 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 9 (sichqoncha)
Oxiri	7,568,485 bp
RNK ekspressioni naqsh
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• rux ionlari bilan bog'lanish; • peptidaza faolligi; • gidrolaza faolligi; • metallopeptidaza faolligi; • metall ionlari bilan bog'lanish; • serin tipidagi endopeptidaza faolligi; • metalloendopeptidaza faolligi; • endopeptidaza faolligi;
Uyali komponent	• hujayradan tashqari matritsa; • hujayradan tashqari mintaqa; • o'ziga xos granulalar lümeni; • uchinchi darajali granulalar lümeni; • hujayradan tashqari; • kollagen o'z ichiga olgan hujayradan tashqari matritsa;
Biologik jarayon	• kollagen katabolik jarayoni; • hujayradan tashqari matritsani demontaj qilish; • endodermal hujayraning differentsiatsiyasi; • proteoliz; • neytrofil degranulyatsiyasi; • gen ekspressionining ijobiy regulyatsiyasi; • gen ekspressionining salbiy regulyatsiyasi; • interleykin-10 ishlab chiqarishni salbiy tartibga solish; • interleykin-6 ishlab chiqarishni ijobiy tartibga solish; • DNK bilan bog'lanishning ijobiy regulyatsiyasi; • MAPK kaskadining ijobiy regulyatsiyasi; • azot oksidi biosintezi jarayonini ijobiy tartibga solish; • JNK kaskadining ijobiy regulyatsiyasi; • neyroinflamatuar javobni tartibga solish; • neyroinflamatuar javobni ijobiy tartibga solish; • NIK / NF-kappaB signalizatsiyasining ijobiy regulyatsiyasi; • reaktiv kislorod turlarining biosintez jarayonini ijobiy tartibga solish; • mikroglial hujayraning faollashishini tartibga solish; • mikroglial hujayraning faollashishini ijobiy tartibga solish; • hujayradan tashqari matritsani tashkil etish;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	4317
	17394
	ENSG00000118113
	ENSMUSG00000005800
	P22894
	O70138
	NM_001304441; NM_001304442; NM_002424
	NM_008611
	NP_001291370; NP_001291371; NP_002415
	NP_032637
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Neytrofil kollagenaza, shuningdek, nomi bilan tanilgan matritsali metalloproteinaza-8 (MMP-8) yoki PMNL kollagenaz (MNL-CL), a kollagen yorilish ferment ko'p sutemizuvchilarning biriktiruvchi to'qimalarida mavjud.^[5] Odamlarda MMP-8 oqsil tomonidan kodlangan MMP8 gen.^[6]^[7]Ushbu gen MMP genlari klasterining bir qismidir, ular 11q22.3 xromosomalariga joylashadi.^[5] Ko'pgina MMPlar hujayradan tashqaridagi proteinazalar bilan bo'linib faollashadigan harakatsiz proproteinlar sifatida ajralib chiqadi. Ammo bu gen tomonidan kodlangan ferment neytrofillar ichida ikkilamchi donachalarda saqlanadi va avtolitik parchalanish bilan faollashadi.

Funktsiya

Oqsillari matritsali metalloproteinaza (MMP) oilasi buzilishida ishtirok etadi hujayradan tashqari matritsa normal fiziologik jarayonlarda, masalan, embrional rivojlanish, ko'payish va to'qimalarni qayta qurish, shuningdek artrit va metastaz kabi kasallik jarayonlarida. MMP-8 ning asosiy vazifasi I, II va III turdagi kollagenlarning parchalanishidir. Saraton kasalligida MMTV-PyMT murin kasalligi ko'krak bezi saratoni modelida MMP-8 yo'qolishi o'smaning o'sishi va metastatik yukning oshishi, shuningdek o'smaning qon tomirligi kuchayishi va immun hujayralar infiltratsiyasining o'zgarishi bilan bog'liq.^[8] Bundan tashqari, ko'krak bezi saraton hujayralari ichidagi MMP-8ni tahlil qilish MMP-8 faolligi va IL6 va IL8 ishlab chiqarilishi o'rtasidagi nedensel aloqani aniqladi, bu esa tug'ma immunitet tizimini boshqarishda MMP-8ning rolini ko'rsatdi.^[9]

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl versiyasi 89: ENSG00000118113 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000005800 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ ^a ^b "Entrez Gen: MMP8 matritsasi metallopeptidaza 8 (neytrofil kollagenaza)".
^ Shoshilinch KA, Pourmotabbed TF, Goldberg GI, Tompson JP, Spinella DG, Stivens RM, Mainardi CL (1990 yil iyul). "Inson neytrofil kollagenazasi. Boshqa matritsali metalloproteinazlarga homologiyasi bilan ajralib turadigan gen mahsuloti". J. Biol. Kimyoviy. 265 (20): 11421–4. PMID 2164002.
^ Devarajan P, Mookhtiar K, Van Vart H, Berliner N (iyun 1991). "Odam neytrofil kollagenazini kodlovchi cDNA ning tuzilishi va ifodasi". Qon. 77 (12): 2731–8. doi:10.1182 / qon.V77.12.2731.2731. PMID 1646048.^{[doimiy o'lik havola ]}
^ Dekok, Juli; Xendrikx, Vouter; Firklift, Salli; Gutieres-Fernandes, Ana; Robinson, Stiven D; Edvards, Dilan R (2015). "MMTV-PyMT transgenli sichqonlarda sut bezlari saratonida o'sma va metastazni bostiruvchi metalloproteinaz-8 matritsasining pleyotropik funktsiyalari". Ko'krak bezi saratoni rez. 17: 38. doi:10.1186 / s13058-015-0545-8. PMC 4380014. PMID 25848906.
^ Firklift, Salli; Dekok, Juli; Arnold, Xyu; Pennington, Kerolin J; Javorski, Dayan M; Edvards, Dilan R (2013). "Matritsali metalloproteinaza 8 (kollagenaza 2) ko'krak bezi saraton hujayralarida interleykinlarning 6 va 8 ekspressionini keltirib chiqaradi". J Biol Chem. 288 (23): 16282–16294. doi:10.1074 / jbc.M113.464230. PMC 3675567. PMID 23632023.

Qo'shimcha o'qish

Chandler S, Miller KM, Clements JM va boshq. (1997). "Matritsali metalloproteinazalar, o'smaning nekroz omillari va multipl skleroz: umumiy nuqtai". J. Neyroimmunol. 72 (2): 155–61. doi:10.1016 / S0165-5728 (96) 00179-8. PMID 9042108. S2CID 26495949.
Massova I, Kotra LP, Fridman R, Mobashery S (1998). "Matritsali metalloproteinazalar: tuzilmalar, evolyutsiya va diversifikatsiya". FASEB J. 12 (25n26): 1075-95. CiteSeerX 10.1.1.31.3959. doi:10.1142 / S0217984998001256. PMID 9737711.
Nagase H, Woessner JF (1999). "Matritsali metalloproteinazalar". J. Biol. Kimyoviy. 274 (31): 21491–4. doi:10.1074 / jbc.274.31.21491. PMID 10419448.
Bläser J, Triebel S, Reinke H, Tschesche H (1992). "PMNL prokollagenazning simob bilan faollashishi paytida kovalent Hg-Cys-bog'lanishining shakllanishi sistein-almashtirish mexanizmi to'g'risida dalolat beradi". FEBS Lett. 313 (1): 59–61. doi:10.1016 / 0014-5793 (92) 81184-N. PMID 1330697. S2CID 36829374.
Devarajan P, Mookhtiar K, Van Vart H, Berliner N (1991). "Odam neytrofil kollagenazini kodlovchi cDNA ning tuzilishi va ifodasi". Qon. 77 (12): 2731–8. doi:10.1182 / qon.V77.12.2731.2731. PMID 1646048.
Bläser J, Knäuper V, Osthues A va boshq. (1992). "Odam polimorfonükleer leykotsitlari prokollagenazasining simob faolligi". Yevro. J. Biokimyo. 202 (3): 1223–30. doi:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb16494.x. PMID 1662606.
Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). "Odam polimorfonükleer leykotsitlaridan prokollagenazning xarakteristikasi va faollashishi. Proferment va turli xil proteolitik faollashtirilgan shakllarning N-terminal ketma-ketligini aniqlash". Yevro. J. Biokimyo. 189 (2): 295–300. doi:10.1111 / j.1432-1033.1990.tb15489.x. PMID 2159879.
Shoshilinch KA, Pourmotabbed TF, Goldberg GI va boshq. (1990). "Inson neytrofil kollagenazasi. Boshqa matritsali metalloproteinazlarga homologiyasi bilan ajralib turadigan gen mahsuloti". J. Biol. Kimyoviy. 265 (20): 11421–4. PMID 2164002.
Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). "Odamning PMN leykotsitlari prokollagenazasining qisman aminokislotalar ketma-ketligi". Biol. Kimyoviy. Xop-Seyler. 371 qo'shimcha: 295-304. PMID 2169256.
Knäuper V, Krämer S, Reinke H, Tschesche H (1990). "Odamning PMN leykotsitlari prokollagenazasining qisman aminokislota ketma-ketligi". Biol. Kimyoviy. Xop-Seyler. 371 (8): 733–734. doi:10.1515 / bchm3.1990.371.2.733. PMID 2169766.
Mallya SK, Mookhtiar KA, Gao Y va boshq. (1991). "58 kilodaltonli odam neytrofil kollagenazining xarakteristikasi: inson fibroblast kollagenazasi bilan taqqoslash". Biokimyo. 29 (47): 10628–34. doi:10.1021 / bi00499a008. PMID 2176876.
Stams T, Spurlino JC, Smit DL va boshq. (1995). "Inson neytrofil kollagenazasining tuzilishi katta S1 'o'ziga xos cho'ntagini ochib beradi". Nat. Tuzilishi. Biol. 1 (2): 119–23. doi:10.1038 / nsb0294-119. PMID 7656015. S2CID 35458800.
Fosang AJ, Last K, Neame PJ va boshq. (1995). "Neytrofil kollagenaza (MMP-8) xaftaga agrekanining interglobulyar domenidagi E373-A374 aggrekanaz uchastkasida bo'linadi". Biokimyo. J. 304 (2): 347–51. doi:10.1042 / bj3040347. PMC 1137499. PMID 7998967.
Bode V, Reinemer P, Huber R va boshq. (1994). "Substrat analogi tomonidan inhibe qilingan inson neytrofil kollagenaza katalitik sohasining rentgen kristalli tuzilishi kataliz va o'ziga xos xususiyatlarni ochib beradi". EMBO J. 13 (6): 1263–9. doi:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06378.x. PMC 394940. PMID 8137810.
Fosang AJ, Last K, Knäuper V va boshq. (1993). "Fibroblast va neytrofil kollagenazlar xaftaga aggrecan interglobular domenidagi ikkita joyda bo'linadi". Biokimyo. J. 295 (1): 273–6. doi:10.1042 / bj2950273. PMC 1134849. PMID 8216228.
Reinemer P, Grams F, Huber R va boshq. (1994). "Kollagenazlarning" superaktivlanishida "N terminali roli uchun tarkibiy ta'sir. Kristalografik tadqiqotlar". FEBS Lett. 338 (2): 227–33. doi:10.1016/0014-5793(94)80370-6. PMID 8307185. S2CID 2454182.
Tomas DB, Devies M, Peters JR, Uilyams JD (1993). "Tamm Horsfall oqsillari inson neytrofillaridagi yagona uglevod retseptorlari sinfiga bog'lanadi". Buyrak Int. 44 (2): 423–9. doi:10.1038 / ki.1993.260. PMID 8397318.
Koul AA, Chubinskaya S, Shumaxer B va boshq. (1996). "Kondrosit matritsasi metalloproteinaza-8. Insonning bo'g'im xondrositlari neytrofil kollagenazni ifoda etadi". J. Biol. Kimyoviy. 271 (18): 11023–6. doi:10.1074 / jbc.271.18.11023. PMID 8631924.
Nakaxara Y, Miyata T, Hamuro T va boshq. (1996). "Xitoyning hamster tuxumdon hujayralarida ifodalangan aminokislota ketma-ketligi va rekombinant inson to'qimalarining omil yo'lining inhibitori uglevod tuzilishi: bitta N-va ikkita O-bog'langan uglevod zanjiri Kunits domenlari 2 va 3 o'rtasida joylashgan va bitta N-bog'langan uglevod zanjiri Kunitsda domen 2 ". Biokimyo. 35 (20): 6450–9. doi:10.1021 / bi9524880. PMID 8639592.
Pendas AM, Santamaria I, Alvarez MV va boshqalar. (1997). "11q22.3 xromosomasida to'plangan inson matritsasi metalloproteinaza genlarining fizik xaritasini tuzish". Genomika. 37 (2): 266–8. doi:10.1006 / geno.1996.0557. PMID 8921407.

Tashqi havolalar

The MEROPS peptidazalar va ularning inhibitorlari uchun onlayn ma'lumotlar bazasi: M10.002

Ushbu maqola gen kuni inson xromosomasi 11 a naycha. Siz Vikipediyaga yordam berishingiz mumkin uni kengaytirish.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl versiyasi 89: ENSG00000118113 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000005800 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[entrez-5] "Entrez Gen: MMP8 matritsasi metallopeptidaza 8 (neytrofil kollagenaza)".

[pmid2164002-6] Shoshilinch KA, Pourmotabbed TF, Goldberg GI, Tompson JP, Spinella DG, Stivens RM, Mainardi CL (1990 yil iyul). "Inson neytrofil kollagenazasi. Boshqa matritsali metalloproteinazlarga homologiyasi bilan ajralib turadigan gen mahsuloti". J. Biol. Kimyoviy. 265 (20): 11421–4. PMID 2164002.

[pmid1646048-7] Devarajan P, Mookhtiar K, Van Vart H, Berliner N (iyun 1991). "Odam neytrofil kollagenazini kodlovchi cDNA ning tuzilishi va ifodasi". Qon. 77 (12): 2731–8. doi:10.1182 / qon.V77.12.2731.2731. PMID 1646048.^{[doimiy o'lik havola ]}

[8] Dekok, Juli; Xendrikx, Vouter; Firklift, Salli; Gutieres-Fernandes, Ana; Robinson, Stiven D; Edvards, Dilan R (2015). "MMTV-PyMT transgenli sichqonlarda sut bezlari saratonida o'sma va metastazni bostiruvchi metalloproteinaz-8 matritsasining pleyotropik funktsiyalari". Ko'krak bezi saratoni rez. 17: 38. doi:10.1186 / s13058-015-0545-8. PMC 4380014. PMID 25848906.

[9] Firklift, Salli; Dekok, Juli; Arnold, Xyu; Pennington, Kerolin J; Javorski, Dayan M; Edvards, Dilan R (2013). "Matritsali metalloproteinaza 8 (kollagenaza 2) ko'krak bezi saraton hujayralarida interleykinlarning 6 va 8 ekspressionini keltirib chiqaradi". J Biol Chem. 288 (23): 16282–16294. doi:10.1074 / jbc.M113.464230. PMC 3675567. PMID 23632023.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

Proteazlar: metalloendopeptidazalar (EC 3.4.24 )
ADAM oqsillari	Alfa sekretsiyalari ADAM9 ADAM10 ADAM17 ADAM19 ADAM2 ADAM7 ADAM8 ADAM11 ADAM12 ADAM15 ADAM18 ADAM22 ADAM23 ADAM28 ADAM33 ADAMTS1 ADAMTS2 ADAMTS3 ADAMTS4 ADAMTS5 ADAMTS8 ADAMTS9 ADAMTS10 ADAMTS12 ADAMTS13
Matritsali metalloproteinazalar	Kollagenazlar MMP1 MMP8 Jelatinazlar MMP2 MMP9 MMP3 MMP7 MMP10 MMP11 MMP12 MMP13 MMP14 MMP15 MMP16 MMP17 MMP19 MMP20 MMP21 MMP23A MMP23B MMP24 MMP25 MMP26 MMP27 MMP28
Boshqalar	Neprilysin Prokollagen peptidaz Termolizin Homiladorlik bilan bog'liq plazma oqsili A Suyak morfogenetik oqsil 1 Lisostafin Insulinni parchalaydigan ferment ZMPSTE24

Fermentlar
Faoliyat	Faol sayt Majburiy sayt Katalitik uchlik Oksiyan teshigi Fermentlarning buzilishi Katalitik jihatdan mukammal ferment Koenzim Kofaktor Fermentlar katalizi
Tartibga solish	Allosterik regulyatsiya Hamkorlik Ferment inhibitori Ferment aktivatori
Tasnifi	EC raqami Superfamily ferment Fermentlar oilasi Fermentlar ro'yxati
Kinetika	Fermentlar kinetikasi Eadi-Xofsti diagrammasi Xanlar-Vulf fitnasi Lineweaver - Burk fitnasi Michaelis-Menten kinetikasi
Turlari	EC1 Oksidoreduktazalar (ro'yxat ) EC2 Transferazalar (ro'yxat ) EC3 Gidrolazalar (ro'yxat ) EC4 Lizalar (ro'yxat ) EC5 Izomerazalar (ro'yxat ) EC6 Ligazlar (ro'yxat ) EC7 Translokaza (ro'yxat )