Archaeplastida - Archaeplastida

Archaeplastida
Vaqtinchalik diapazon: Kalimmiyalik - Hozir, 1600–0 mln
Spraga daryosi (Kregat okrugi, Oregon shtati manzaralari) (klaDA0073) .jpg
Atrofdagi va atrofdagi daraxtlar, o'tlar va suv o'tlari Sprague River, Oregon
Ilmiy tasnif e
Domen:Eukaryota
(ochilmagan):Diaphoretickes
(ochilmagan):Archaeplastida
Adl va boshq., 2005[1]
Kichik guruhlar
Sinonimlar
  • Plantae Kavalier-Smit, 1981 yil[2]
  • Primoplastobiota Reviers, 2002 yil[iqtibos kerak ]
  • Primoplanta Palmer va boshq. 2004 yil[3]

The Archaeplastida (yoki qirollik) Plantae sensu lato ) ning asosiy guruhidir avtotrofik eukaryotlar, tarkibiga kiradi qizil suv o'tlari (Rhodophyta), the yashil suv o'tlari, va quruqlikdagi o'simliklar, deb nomlangan chuchuk suvning bir hujayrali suv o'tlarining kichik guruhi bilan birgalikda glaukofitlar.[4] Archaeplastida bor xloroplastlar ikki membrana bilan o'ralgan bo'lib, ular to'g'ridan-to'g'ri olinganligini anglatadi endosimbiyotik siyanobakteriyalar. Ameboiddan tashqari barcha boshqa guruhlar Paulinella xromatofora, uch yoki to'rtta membrana bilan o'ralgan xloroplastlarga ega bo'lib, ular ikkilamchi qizil yoki yashil suv o'tlaridan olinganligini anglatadi. Qizil va yashil suv o'tlaridan farqli o'laroq, glaukofitlar hech qachon ikkinchi darajali endosimbioz hodisalarida qatnashmagan.[5]

Archaeplastida hujayralari odatda etishmaydi sentriol va bor mitoxondriya yassi bilan cristae. Ular odatda a hujayra devori o'z ichiga oladi tsellyuloza, va oziq-ovqat shaklida saqlanadi kraxmal. Biroq, bu xususiyatlar boshqa ökaryotlar bilan ham bo'lishadi. Archaeplastida a shakllanishining asosiy dalillari monofiletik guruh genetik tadqiqotlardan kelib chiqadi, bu ularni ko'rsatib beradi plastidlar ehtimol bitta kelib chiqishi bor edi. Ushbu dalillar bahsli.[6][7] Bugungi kungacha bo'lgan dalillarga asoslanib, muqobil evolyutsiya stsenariylarini bitta nusxada tasdiqlash yoki rad etish mumkin emas birlamchi endosimbioz.[8] Plastidalari turli xil bo'lgan fotosintezli organizmlar (masalan jigarrang suv o'tlari ) Archaeplastida ga tegishli emas.

Archaeplastidanlar ikkita asosiy evolyutsiya chizig'iga bo'linadi. Qizil suv o'tlari pigmentlangan xlorofill a va fikobiliproteinlar, aksariyat siyanobakteriyalar singari va kraxmalni xloroplastlar tashqarisida to'playdi. Yashil suv o'tlari va quruqlik o'simliklari - birgalikda ma'lum Viridiplantae (Lotincha "yashil o'simliklar") yoki Chloroplastida - xlorofillalar bilan pigmentlanadi a va b, ammo fitobiliproteinlar etishmaydi va kraxmal xloroplastlar ichida to'planadi.[9] Glaukofitlar odatdagi siyanobakterial pigmentlarga ega va ularning plastidlari (siyanellar deb ataladi) ichida hujayra devorini ushlab turishi g'ayrioddiy.[1]

Archaeplastidani eskirgan va eskirgan Archiplastideae nomi bilan adashtirmaslik kerak siyanobakteriyalar va boshqa bakteriyalar guruhlari.[10][11]

Taksonomiya

Shuningdek qarang: Eukaryot § Filogeniya

2005 yilda glaukofitlar va qizil va yashil suv o'tlari va quruq o'simliklardan tashkil topgan guruh "Archaeplastida" deb nomlanganida, kelishuvga erishildi.[1] bu edi a qoplama ya'ni edi monofiletik. O'shandan beri nashr etilgan ko'plab tadqiqotlar kelishuvga oid dalillarni taqdim etdi.[12][13][14][15] Boshqa tadqiqotlar, guruhga tegishli deb taxmin qilishdi parafiletik.[16][17][18][7] Bugungi kunga kelib, vaziyat hal etilmagan ko'rinadi, ammo yaqinda o'tkazilgan tadqiqotda (qizil alg genlarini boyitish bilan) Plantae (Archaeplastida) monofilligi uchun kuchli signal ko'rsatildi.[19] Bu erda taxmin qilingan narsa Archaeplastida haqiqiy qoplama.

Guruhga turli nomlar berilgan. Ba'zi mualliflar guruhni shunchaki o'simliklar yoki Plantae deb atashgan.[20][21] Biroq, Plantae nomi noaniq, chunki u ham kamroq inklyuzivga nisbatan qo'llanilgan qoplamalar, kabi Viridiplantae va embriofitlar. Ajratish uchun, katta guruh ba'zan Plantae deb nomlanadi sensu lato ("o'simliklar keng ma'noda").

Ikkilanishdan qochish uchun boshqa ismlar taklif qilingan. Primoplantae, 2004 yilda paydo bo'lgan, bu guruh uchun tavsiya etilgan birinchi yangi ismga o'xshaydi.[3] Ushbu tugunga qo'llaniladigan yana bir ism Plastida bo'lib, unda "birlamchi (to'g'ridan-to'g'ri prokaryot) kelib chiqadigan plastidlar bilan qoplashish" deb nomlangan. Magnolia virginiana Linnaeus 1753 "deb nomlangan.[22]

Ko'pgina tadqiqotlar Archaeplastida a shaklini taklif qilganiga qaramay monofiletik guruh,[23] 2009 yilgi nashrda ular aslida ekanligi ta'kidlanadi parafiletik.[18] Yaqinda o'tkazilgan tadqiqotda yangi qizil suv o'tlari genlarining boyitilishi Plantae (Archaeplastida) monofilligi uchun kuchli signalni va qizil / yashil suv o'tlari va boshqa nasl-nasab o'rtasidagi genlarni almashish tarixining teng darajada kuchli signalini namoyish etadi.[19] Ushbu tadqiqot eukaryot evolyutsiyasidagi munozarali masalalarni sinab ko'rish va protistlarda gen merosxo'rligining murakkab shakllarini tushunish uchun mezofil qizil alg geni ma'lumotlarining qanchalik boyligi to'g'risida tushuncha beradi.

Archaeplastida nomi 2005 yilda katta xalqaro mualliflar guruhi tomonidan taklif qilingan (Adl va boshq.uchun tasniflashni ishlab chiqarishni maqsad qilgan eukaryotlar morfologiya, biokimyo va filogenetikani hisobga olgan va "yaqin kelajakda biroz barqarorlikka" ega bo'lgan. Ular rasmiy taksonomik darajalardan foydalanishni ierarxik tartib foydasiga rad etishdi, bu erda kiyim nomlari darajani anglatmaydi. Shunday qilib, "Glaucophyta" va "Rhodophyceae" sinf nomi ularning tasnifida bir xil darajada paydo bo'ladi. Archaeplastida uchun taklif qilingan bo'linmalar quyida ham jadvalda, ham ko'rsatilgan diagramma shakli.[1]

Archaeplastida:

The glaukofit Glaukotsistis
  • Glaukofitalar Skuja, 1954 yil (Glaukotsistofta) Kies & Kremer, 1986 yil) - glaukofitlar
  • Glaukofitlar - chuchuk suvli bir hujayrali suv o'tlarining kichik guruhi. Ularning xloroplastlari siyanellar, bor peptidoglikan qatlam bo'lib, ularni siydikobakteriyalarga o'xshash bo'lib, qolgan Archaeplastidalarga qaraganda ko'proq o'xshashdir.
The rodofit Laurensiya
  • Rodofitsiya Thuret, 1855, emend. Rabenhorst, 1863, emend. Adl va boshq., 2005 (Rodofta.) Vettstein 1901) - qizil suv o'tlari
Qizil suv o'tlari suv o'tlarining eng katta guruhlaridan birini tashkil qiladi. Ko'pchilik dengiz hujayralari va dengiz hujayralari. Ularning qizil rangi kelib chiqadi fikobiliproteinlar sifatida ishlatiladi aksessuar pigmentlari fotosintez uchun yorug'lik olishda.
  • Xloroplastida Adl va boshq., 2005 (Viridiplantae Kavalier-Smit 1981 yil; Xlorobionta Jeffri 1982, nashr. Bremer 1985 yil, emend. Lyuis va Makkur 2004 yil; Xlorobiota Kendrik va Kran 1997 yil)
Xloroplastida - Adl tomonidan tanlangan atama va boshq. yashil suv o'tlari va quruq o'simliklar (embriofitlar) dan tashkil topgan guruh uchun. Ikkinchidan yo'qolgan joylar bundan mustasno, ularning hammasida peptidoglikan qatlami bo'lmagan xloroplastlar mavjud va ular fikobiliproteinlarga ega emaslar.
The xlorofit Stigeoklonium
  • Xlorofit Pascher, 1914 yil, emend. Lyuis va Makkur, 2004 yil - yashil suv o'tlari (qismi)
  • Adl va boshq. Xlorofitaning tor ta'rifidan foydalaning; boshqa manbalarga Chlorodendrales va Prasinophytae kiradi, ular o'zlari birlashtirilishi mumkin.
  • Ulvofitsiya Mattoks va Styuart, 1984 yil
  • Trebouxiophyceae Fridl, 1995 yil (Pleurastrophyceae) Mattoks va boshq. 1984 yil; Mikrotaminalar Melkonian 1990 yil)
  • Xlorofitlar Kristensen, 1994 yil
  • Xlorodendrallar Fritsch, 1917 yil - yashil suv o'tlari (qismi)
  • Prasinofitlar Kavalier-Smit, 1998 y. Lyuis va Makkur, 2004 yil - yashil suv o'tlari (qismi)
  • Mesostigma Lauterborn, 1894, emend. Makkur yilda Adl va boshq., 2005 (Mesostigmata Turmel, Otis va Lemieux 2002 yil)
  • Charophyta Karol va boshq., 2001 yil, emend. Lyuis va Makkur, 2004 yil (Charophyceae Smit 1938, emend. Mattoks va Styuart 1984 yil) - yashil suv o'tlari (qismi) va quruqlik o'simliklari
Charophyta sensu lato, Adl tomonidan ishlatilgan va boshq., ba'zi yashil suv o'tlaridan, shu jumladan tosh toshlardan tashkil topgan monofiletik guruh (Charophyta). sensu stricto), shuningdek quruqlikdagi o'simliklar (embriofitlar).
  • Streptofitinadan tashqari pastki bo'linmalar (quyida) Adl va boshq.
Boshqa manbalarga yashil suv o'tlari guruhlari kiradi Xlorokiballar, Klebsormidiales, Zigematematalar va Coleochaetales.[24]
  • Streptofitina Lyuis va Makkur, 2004 yil - toshbo'ron va quruq o'simliklar
  • Charales Lindli 1836 (Charophytae.) Engler, 1887 yil) - toshbo'ron
  • Plantae Gekkel 1866 yil (Cormophyta Endlicher, 1836 yil; Embriofitalar Endlicher, 1836, emend. Lyuis va Makkur, 2004 yil) - quruqlikdagi o'simliklar (embriofitlar)

Kladogramma

Quyida asosan molekulyar ma'lumotlarga asoslangan yashil suv o'tlari munosabatlarining konsensus rekonstruksiyasi keltirilgan.[25][26][27][28][29][30][31][32][33][34] Glaucophyta odatda eng chuqur ildiz otadigan Archeaplastida deb hisoblansa ham,[35][36][37][38] ba'zi genomik tadqiqotlar Rodofitani bazal deb hisoblaydi, ehtimol Archaeplastida paydo bo'lgan Cryptista va pikozoa bilan.[39][40][41][42][43][44][45]

Diaphoretickes
Archaeplastida + cryptista
 
 

Glaukofitalar (ko'k-yashil suv o'simliklari)

 
Viridiplantae /
 
 

Mezostigmatofitlar

 
 
 

Spirotaeniya

 
 

Xlorokibofitlar

 
 
 
 
 

Xlorofit

 
Streptofit /
 

Klebsormidiophyceae

 
Fragmoplastofit
 

Charophyceae

 
 
 

Coleochaetophyceae

 
 
 
 

Zigematematofeya

 
 

Mesotaeniaceae

 
 
 

Embriofitlar (er o'simliklari)

 
 
 
 
Charophyta
 
yashil suv o'tlari
 
 
 

Rodofit (qizil suv o'tlari / qizil suv o'simliklari)

 
 

Pikozoa

 
 

Rodelfidiya (yirtqich)

 
 
 

Cryptista

 
 (+ Gloeomargarita litofora ) 
 
 

Haptista

 
TSAR
 

Telonemiya

 
SAR
Halvariya
 

Stramenopillar

 
 

Alveolata

 
 
 

Rizariya

 
 
 
 
 

Biroq, Archaeplastida ildizi yaqinida juda ko'p tortishuvlar mavjud, masalan. Glaucophyta yoki Rhodophyta bazalmi yoki yo'qmi. Archaeplastida tarkibida Cryptista paydo bo'ldi. 2014 yilda ushbu nomuvofiqliklar bo'yicha to'liq sharh nashr etildi.[46] Ning pozitsiyasi Telonemiya va Pikozoa aniq emas. Bundan tashqari, Hacrobia (Haptista + Cryptista) SAR qoplamasi bilan to'liq bog'liq bo'lishi mumkin. SAR ko'pincha eukaryot-eukaryot duragaylari sifatida qaraladi va bu genetik tahlillarda chalkashlikka sabab bo'ladi. Opasi Gloeomargarita litofora Archaeplastida ajdodi tomonidan yutib yuborilgan plastidlar avlodlarning ko'p qismida doimiy endosimbiozda yashaydiganlar. Gloeomargarita ham, unga aloqador siyanobakteriyalar ham, eng ibtidoiy arxeplastidlardan tashqari, hammasi chuchuk suvda yashaganligi sababli, Archaeplastida chuchuk suvda paydo bo'lgan va okeanlarni faqat Proterozoyning oxirlarida mustamlaka qilgan.[47][48]

Morfologiya

Barcha arxaeplastidanlarda fotosintezni amalga oshiradigan va endosimbiotik siyanobakteriyalardan kelib chiqqan deb hisoblanadigan plastidlar (xloroplastlar) mavjud. Glaukofitlarda, ehtimol guruhning eng ibtidoiy a'zolari xloroplast a deb ataladi siyanel va guruhning boshqa a'zolarida saqlanmaydigan peptidoglikan hujayra devori bilan bir qatorda siyanobakteriyalar bilan bir nechta xususiyatlarga ega. Siyanellarning siyanobakteriyalarga o'xshashligi endosimbiyotik nazariya.

Ko'pgina arxeplastidanlar hujayralarining devorlari bor, odatda, ammo ular hamisha ham tsellyulozadan tayyorlanmaydi.

Archaeplastida hujayraning uyushganlik darajasi, ajratilgan hujayralardan filamentlarga, koloniyalargacha, ko'p hujayrali organizmlarga qadar har xil. Eng qadimgi bir hujayrali bo'lgan va ko'plab guruhlar bugungi kunda ham shunday bo'lib qolmoqda. Ko'p hujayralilik bir nechta guruhlarda alohida rivojlandi, shu jumladan qizil suv o'tlari, ulvofit yashil suv o'tlari va paydo bo'lgan yashil suv o'tlarida toshbo'ron va quruqlikdagi o'simliklar.

Endosimbioz

Asosiy maqola: Endosimbiyotik nazariya

Ajdodlar archaeplastidani o'z xloroplastlarini to'g'ridan-to'g'ri siyanobakteriyalarni yutish yo'li bilan olganligi haqida faraz qilinganligi sababli, bu hodisa birlamchi endosimbioz ("Archaeplastida", ya'ni "qadimiy plastid" guruhi uchun tanlangan nomda aks ettirilgan). Yashil yosunlarning bir turi, Cymbomonas tetramitiformis tartibda Piramimonadales, a mikotrof va ikkalasi orqali o'zini ta'minlashga qodir fagotrofiya va fototrofiya. Bu ibtidoiy xususiyat ekanligi va shuning uchun Archaeplastidaning so'nggi umumiy ajdodini belgilaydiganligi, bu uning xloroplastlarni qanday qo'lga kiritganligini tushuntirishi yoki bu o'ziga xos xususiyatga ega ekanligi hali ma'lum emas. gorizontal genlarning uzatilishi.[49]

Birlamchi endosimbozning dalillari xloroplastlar atrofida ikki qavatli membrananing mavjudligini o'z ichiga oladi; bir membrana bakteriyaga, ikkinchisi uni ushlagan eukaryotga tegishli edi. Vaqt o'tishi bilan xloroplastdan ko'plab genlar mezbon hujayraning yadrosiga o'tkazildi. Xloroplastlarsiz eukaryotlarning yadrolarida bunday genlarning mavjudligi bu ko'chish guruh evolyutsiyasi boshida sodir bo'lganligini ko'rsatadi.[50]

Xloroplastlarga ega bo'lgan boshqa ökaryotlar, ularni o'zlarining bakteriyalaridan kelib chiqqan xloroplastlar bilan bitta hujayrali archaeplastidan yutib olish orqali olganga o'xshaydi. Ushbu hodisalar o'zlarining endosimbiontlariga ega bo'lgan hujayralar endosimbiozini o'z ichiga olganligi sababli, jarayon deyiladi ikkilamchi endosimbioz. Bunday eukaryotlarning xloroplastlari odatda ikkitadan ortiq membranalar bilan o'ralgan bo'lib, ular ko'p marta yutilish tarixini aks ettiradi. Ning xloroplastlari evglenidlar, xloraraxniofitlar va kichik guruh dinoflagellatlar qo'lga kiritilgan yashil suv o'tlari,[51] qolgan fotosintez ökaryotlari, masalan heterokont suv o'tlari, kriptofitlar, gappofitlar, va dinoflagellatlar, tutilgan qizil suv o'tlari kabi ko'rinadi.

Qadimgi toshlar

Ehtimol, Archaeplastidaning eng qadimiy qoldiqlari taxminiy qizil suv o'tlari (Rafatazmiya ) ichida stromatolitlar 1600 yilda (million yil oldin) Hindistondagi jinslar.[52] Bir oz yaqinroq mikrofosil shimoliy Avstraliyadagi Roper guruhidan. Ushbu bitta hujayrali qoldiqlarning tuzilishi zamonaviy yashil suv o'tlariga o'xshaydi. Ular sanaga Mesoproterozoy Era, taxminan 1500 dan 1300 gacha.[53] Ushbu qoldiqlar a bilan mos keladi molekulyar soat Ushbu qoplama taxminan 1500 mln.[54] Muayyan zamonaviy guruhga tayinlanishi mumkin bo'lgan eng qadimgi toshqotganlik qizil algdir Bangiomorpha, 1200 mln. dan[55]

Kech Neoproterozoy Davr, yosun qoldiqlari tobora ko'payib bordi. Oxir-oqibat Paleozoy Eralar, o'simliklar quruqlikda paydo bo'lgan va hozirgi kunga qadar gullab-yashnagan.

Adabiyotlar

  1. ^ a b v d Adl, S.M .; va boshq. (2005). "Protukonlar taksonomiyasiga urg'u berib, evkaryotlarning yangi yuqori darajadagi tasnifi". Eukaryotik mikrobiologiya jurnali. 52 (5): 399–451. doi:10.1111 / j.1550-7408.2005.00053.x. PMID  16248873. S2CID  8060916.
  2. ^ Kavalier-Smit, T. (1981). "Eukaryot qirolliklari: yettimi yoki to'qqiztami?"". BioSistemalar. 14 (3–4): 461–481. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID  7337818.
  3. ^ a b Palmer, Jeffri D.; Soltis, Duglas E.; Chase, Mark V. (2004). "O'simlik hayot daraxti: umumiy nuqtai va ba'zi qarashlar". Amerika botanika jurnali. 91 (10): 1437–1445. doi:10.3732 / ajb.91.10.1437. PMID  21652302.
  4. ^ Ball S, Colleoni C, Cenci U, Raj JN, Tirtiaux C (yanvar 2011). "Eukaryotlarda glikogen va kraxmal metabolizmining evolyutsiyasi plastid endosimbiozining o'rnatilishini tushunish uchun molekulyar maslahatlar beradi". Eksperimental botanika jurnali. 62 (6): 1775–1801. doi:10.1093 / jxb / erq411. PMID  21220783.
  5. ^ Dengiz mikroalglari qo'llanmasi: biotexnologiya yutuqlari
  6. ^ Parfri. L. V.; Barbero, E .; Lasser, E; va boshq. (2006 yil dekabr). "Eukaryotik xilma-xillikning joriy tasnifini qo'llab-quvvatlashni baholash". PLOS Genetika. 2 (12): e220. doi:10.1371 / journal.pgen.0020220. PMC  1713255. PMID  17194223.
  7. ^ a b Kim, E; Graham, L. E. (2008 yil iyul). Redfild, Rozmari Janna (tahrir). "EEF2 tahlili Archaeplastida va Chromalveolata monofilligiga qarshi chiqadi". PLOS ONE. 3 (7): e2621. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2621K. doi:10.1371 / journal.pone.0002621. PMC  2440802. PMID  18612431.
  8. ^ Mackevich, P.; Gagat, P. (2014). "Filogenetik va filogenomik tadqiqotlar asosida Archaeplastida super guruhining monofilligi va uning nasl-nasablari o'rtasidagi munosabatlar. Biz konsensusga yaqinmizmi?". Acta Societatis Botanicorum Poloniae. 83 (4): 263–280. doi:10.5586 / asbp.2014.044.
  9. ^ Viola, R .; Nyvall, P .; Pedersen, M (2001). "Qizil yosunlarda kraxmal metabolizmining o'ziga xos xususiyatlari". Qirollik jamiyati materiallari B: Biologiya fanlari. 268 (1474): 1417–1422. doi:10.1098 / rspb.2001.1644. PMC  1088757. PMID  11429143.
  10. ^ Copeland, H. F. (1956). Quyi organizmlarning tasnifi. Palo Alto: Tinch okeanidagi kitoblar, p. 29, [1].
  11. ^ Bessi, C. E. (1907). "O'simliklar filasi haqida qisqacha ma'lumot". Univ. Nebraska tadqiqotlari. 7: 275–358.
  12. ^ Burki, Fabien; Kamran Shalchian-Tabriziy; Marianne Minge; Msmund Skjevland; Sergey I. Nikolaev; Kjetill S. Yakobsen; Yan Pavlovskiy (2007). Butler, Jeraldin (tahrir). "Filogenomika Eukaryotik super guruhlarni almashtiradi". PLOS ONE. 2 (8): e790. Bibcode:2007PLoSO ... 2..790B. doi:10.1371 / journal.pone.0000790. PMC  1949142. PMID  17726520.
  13. ^ Burki, F.; Inagaki, Y .; Brate, J .; Archibald, J. M .; Kiling, P. J .; Kavalier-Smit, T.; va boshq. (2009). "Katta miqyosli filogenomik tahlillar ikkita sirli protist naslining (Telonemiya va Centroheliozoaning) fotosintezli xromalveolatlarga aloqadorligini aniqladi". Genom biologiyasi va evolyutsiyasi. 1: 231–238. doi:10.1093 / gbe / evp022. PMC  2817417. PMID  20333193.
  14. ^ Kavalier-Smit, Tomas (2009). "Protozoa va Xromista qirolliklari va eukaryotik daraxtning eozoan ildizi". Biologiya xatlari. 6 (3): 342–345. doi:10.1098 / rsbl.2009.0948. PMC  2880060. PMID  20031978.
  15. ^ Rogozin, I. B.; Basu, M. K .; Csürös, M. & Koonin, E. V. (2009). "Noyob genomik o'zgarishlarni tahlil qilish Unikont-Bikont filogeniyasini qo'llab-quvvatlamaydi va siyanobakterial simbiozni evkaryotlarning birlamchi nurlanish nuqtasi sifatida taklif qiladi". Genom biologiyasi va evolyutsiyasi. 1: 99–113. doi:10.1093 / gbe / evp011. PMC  2817406. PMID  20333181.
  16. ^ Baldauf, SL, Rojer, AJ, Venk-Siefert, I., Doolittle, W.F. 2000. Birlashtirilgan oqsil ma'lumotlariga asoslangan ökaryotlarning qirollik darajasidagi filogeniyasi. Ilm-fan 290: 972-977 (researchgate.net)
  17. ^ Lipscomb, Diana. 1991. Keng tasnif: qirollik va protozoa. In: Parazit Protozoa, Vol. 1, 2-nashr, J.P. Kreier, JR Beyker (tahr.), 81-136-betlar. Academic Press, San-Diego.
  18. ^ a b Nozaki, X.; Maruyama, S .; Matsuzaki, M.; Nakada, T .; Kato, S .; Misawa, K. (dekabr 2009). "Glaukofitaning, yashil o'simliklarning (Archaeplastida) va Haptopitaning (Chromalveolata) filogenetik pozitsiyalari asta-sekin rivojlanib borayotgan yadro genlaridan kelib chiqadigan". Molekulyar filogenetik va evolyutsiyasi. 53 (3): 872–80. doi:10.1016 / j.ympev.2009.08.015. PMID  19698794.
  19. ^ a b Chan, X X.; Yang, E. C .; Banerji, T .; Yoon, H. S .; Martone, P. T .; Estevez, J. M .; Battacharya, D. (2011). "Qizil va yashil suv o'tlari monofilligi va genlarning almashinuvi qizil alg genlarining boy repertuaridan topilgan". Hozirgi biologiya. 21 (4): 328–333. doi:10.1016 / j.cub.2011.01.037. PMID  21315598. S2CID  7162977.
  20. ^ T. Kavalyer-Smit (1981). "Eukaryot qirolliklari: etti yoki to'qqiz?". BioSistemalar. 14 (3–4): 461–481. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID  7337818.
  21. ^ Battacharya, Debashish; Yun, Xvan Su; Hackett, Eremiyo (2003). "Fotosintezli eukaryotlar birlashadi: endosimbioz nuqtalarni birlashtiradi". BioEssays. 26 (1): 50–60. doi:10.1002 / bies.10376. PMID  14696040.
  22. ^ Simpson, A. G. B. (2004). "Eukaryotlar tarkibidagi eng yuqori darajadagi taksonlar". Birinchi Xalqaro Filogenetik Nomenklatura Uchrashuvi. Parij, 6-9 iyul.
  23. ^ Vinogradov S. N .; Fernández, I .; Xogevijs, D .; Arredondo-Piter, R. (2010 yil oktyabr). "Archaeplastida genomlaridagi 3/3 va 2/2 gemoglobinlarning bakterial va boshqa ökaryotli gemoglobinlar bilan filogenetik aloqalari". Molekulyar o'simlik. 4 (1): 42–58. doi:10.1093 / mp / ssq040. PMID  20952597. Arxivlandi asl nusxasi 2012-12-09 kunlari. Olingan 2011-01-08.
  24. ^ Turmel, M .; Otis, C .; Lemieux, C. (2005). "Charophycean yashil suv o'tlarining to'liq xloroplast DNK ketma-ketliklari Staurastrum va Zigema xyropematlast evolyutsiyasi jarayonida xloroplast genomining katta o'zgarishlarga uchraganligini aniqlang ". BMC biologiyasi. 3: 22. doi:10.1186/1741-7007-3-22. PMC  1277820. PMID  16236178.
  25. ^ Leliaert, Frederik; Smit, Devid R.; Moro, Erve; Herron, Metyu D.; Verbruggen, qahramon; Delvich, Charlz F.; De Klerk, Olivye (2012). "Yashil suv o'tlarining filogeniyasi va molekulyar evolyutsiyasi" (PDF). O'simlikshunoslik bo'yicha tanqidiy sharhlar. 31: 1–46. doi:10.1080/07352689.2011.615705. S2CID  17603352.
  26. ^ Marin, Birger (2012). "Xlorellalalarda yoki mustaqil sinfda joylashtirilganmi? To'liq yadro va plastmassa bilan kodlangan rRNA operonlarining molekulyar filogenetik tahlillari bilan aniqlangan filogenezi va pedinofitlar (Viridiplantae) tasnifi". Protist. 163 (5): 778–805. doi:10.1016 / j.protis.2011.11.004. PMID  22192529.
  27. ^ Laurin-Lemay, Simon; Brinkmann, Xenner; Filipp, Erve (2012). "Er o'simliklarining kelib chiqishi ketma-ket ifloslanishi va etishmayotgan ma'lumotlar asosida qayta ko'rib chiqildi". Hozirgi biologiya. 22 (15): R593-R594. doi:10.1016 / j.cub.2012.06.013. PMID  22877776.
  28. ^ Leliaert, Frederik; Tronxolm, Ana; Lemi, Klod; Turmel, Monika; DePriest, Maykl S.; Battacharya, Debashish; Karol, Kennet G.; Frederik, Suzanna; Zechman, Frederik V. (2016-05-09). "Xloroplast filogenomik tahlillari Chlorophyta, Palmophyllophyceae sinfining novdaning eng chuqur shoxlanganligini aniqlaydi.". Ilmiy ma'ruzalar. 6: 25367. Bibcode:2016 yil NatSR ... 625367L. doi:10.1038 / srep25367. ISSN  2045-2322. PMC  4860620. PMID  27157793.
  29. ^ Kuk, Marta E .; Graham, Linda E. (2017). Archibald, Jon M.; Simpson, Alastair G. B.; Slamovits, Klaudio H. (tahrir). Protistlarning qo'llanmasi. Springer xalqaro nashriyoti. 185-204 betlar. doi:10.1007/978-3-319-28149-0_36. ISBN  9783319281476.
  30. ^ Lyuis, Luiza A.; Richard M. Makkur (2004). "Yashil suv o'tlari va quruqlik o'simliklarining kelib chiqishi" (mavhum). Amerika botanika jurnali. 91 (10): 1535–1556. doi:10.3732 / ajb.91.10.1535. PMID  21652308.
  31. ^ Ruhfel, Bred R.; Gitsendanner, Metyu A.; Soltis, Pamela S.; Soltis, Duglas E.; Burli, J. Gordon (2014-02-17). "Yosunlardan angiospermgacha - 360 plastid genomidan yashil o'simliklar filogeniyasini (Viridiplantae) xulosa qilish". BMC evolyutsion biologiyasi. 14: 23. doi:10.1186/1471-2148-14-23. ISSN  1471-2148. PMC  3933183. PMID  24533922.
  32. ^ Adl, Sina M.; Simpson, Alastair G. B.; Leyn, Kristofer E.; Lukash, Yuliy; Bass, Devid; Bowser, Samuel S.; Braun, Metyu V.; Burki, Fabien; Dunthorn, Mixa (2012-09-01). "Eukaryotlarning qayta ko'rib chiqilgan tasnifi". Eukaryotik mikrobiologiya jurnali. 59 (5): 429–514. doi:10.1111 / j.1550-7408.2012.00644.x. ISSN  1550-7408. PMC  3483872. PMID  23020233.
  33. ^ Lemi, Klod; Otis, nasroniy; Turmel, Monika (2007-01-12). "Mesostigma viride va Chlorokybus atmophyticus yashil suv o'tlarini birlashtiruvchi qoplama xloroplast genomiga asoslangan filogeniyalardagi Streptofitaning eng chuqur tarmog'ini anglatadi". BMC biologiyasi. 5: 2. doi:10.1186/1741-7007-5-2. ISSN  1741-7007. PMC  1781420. PMID  17222354.
  34. ^ Umen, Jeyms G. (2014-11-01). "Yashil suv o'tlari va o'simlik dunyosida ko'p hujayralilikning kelib chiqishi". Biologiyaning sovuq bahor porti istiqbollari. 6 (11): a016170. doi:10.1101 / cshperspect.a016170. ISSN  1943-0264. PMC  4413236. PMID  25324214.
  35. ^ Fris, Jan de; Gould, Sven B. (2017-01-01). "Yosunlar va o'simliklarning evolyutsiyasidagi monoplastidik to'siq". J Uyali ilmiy ish. 131 (2): jcs.203414. doi:10.1242 / jcs.203414. ISSN  0021-9533. PMID  28893840.
  36. ^ Ponce-Toledo, Rafael I.; Desham, Filipp; Lopes-Garsiya, Purificación; Zivanovich, Yvan; Benzerara, Karim; Moreira, Devid (2017). "Plastidlar kelib chiqishida erta tarvaqaylagan chuchuk suv siyanobakteriyasi". Hozirgi biologiya. 27 (3): 386–391. doi:10.1016 / j.cub.2016.11.056. PMC  5650054. PMID  28132810.
  37. ^ Dittami, Simon M.; Xesh, Svenya; Olsen, Janin L.; Kollen, Jonas (2017-08-01). "Dengiz va chuchuk suv muhitlari o'rtasidagi o'tish ko'p hujayrali o'simliklar va suv o'tlarining kelib chiqishi to'g'risida yangi ma'lumot beradi" (PDF). Fitologiya jurnali. 53 (4): 731–745. doi:10.1111 / jpy.12547. ISSN  1529-8817. PMID  28509401. S2CID  43325392.
  38. ^ Smit, Devid R. (2018). "Yorug'likda yo'qolgan: Fotosentetik bo'lmagan suv o'tlarida plastid genom evolyutsiyasi". Plastid Genom evolyutsiyasi. Botanika tadqiqotlarining yutuqlari. 85. 29-53 betlar. doi:10.1016 / bs.abr.2017.10.001. ISBN  9780128134573.
  39. ^ Burki, Fabien; Kaplan, Mayya; Tixonenkov, Denis V.; Zlatogurskiy, Vasiliy; Minx, Bui-Quang; Radaykina, Lyudmila V.; Smirnov, Aleksey; Mylnikov, Aleksandr P.; Kiling, Patrik J. (2016-01-27). "Eukaryotlarning erta diversifikatsiyasini echish: Centrohelida, Haptophyta va Cryptista evolyutsion kelib chiqishini filogenomik o'rganish". Proc. R. Soc. B. 283 (1823): 20152802. doi:10.1098 / rspb.2015.2802. ISSN  0962-8452. PMC  4795036. PMID  26817772.
  40. ^ Braun, Metyu V.; Xeys, Aaron; Kamikava, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Aleksandr K.; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken; Xashimoto, Tetsuo (2017-12-03). "Filogenomika yangi ökaryotik super guruhga etim protistan nasablarini joylashtiradi". Genom Biol Evol. 10 (2): 427–433. doi:10.1093 / gbe / evy014. PMC  5793813. PMID  29360967.
  41. ^ Li, JunMo; Cho, Chung Xyon; Park, Seung In; Choi, Dji Von; Song, Xyon Suk; G'arbiy, Jon A .; Battacharya, Debashish; Yoon, Xvan Su (2016-09-02). "Qizil dengiz o'tlari va urug 'o'simliklarida yuqori darajada saqlanib qolgan plastid genom arxitekturasining parallel evolyutsiyasi". BMC biologiyasi. 14: 75. doi:10.1186 / s12915-016-0299-5. ISSN  1741-7007. PMC  5010701. PMID  27589960.
  42. ^ Bodl, Anjey (2018). "Ba'zi qizil suv o'tlaridan hosil bo'lgan plastidlar kleptoplastidiya orqali rivojlanganmi? Gipoteza". Biologik sharhlar. 93 (1): 201–222. doi:10.1111 / brv.12340. ISSN  1464-7931. PMID  28544184. S2CID  24613863.
  43. ^ Gitsendanner, Metyu A.; Soltis, Pamela S.; Vong, Geyn K.-S.; Ruhfel, Bred R.; Soltis, Duglas E. (2018). "Yashil o'simliklarning plastid filogenomik tahlili: milliard yillik evolyutsion tarix". Amerika botanika jurnali. 105 (3): 291–301. doi:10.1002 / ajb2.1048. ISSN  0002-9122. PMID  29603143.
  44. ^ Strassert, Yurgen F. X.; Jeymi, Mahvash; Mylnikov, Aleksandr P.; Tixonenkov, Denis V.; Burki, Fabien (2018-08-30). "Sirli telonemiya phylumining yangi filogenomik tahlili hayot evkaryotini yanada hal qiladi". bioRxiv: 403329. doi:10.1101/403329.
  45. ^ Gavriluk, Rayan M. R.; Tixonenkov, Denis V.; Xenberger, Elisabet; Husnik, Filip; Mylnikov, Aleksandr P.; Kiling, Patrik J. (2019-09-08). "Fotosintetik bo'lmagan yirtqichlar qizil yosunlarga singil". Tabiat. 572 (7768): 240–243. doi:10.1038 / s41586-019-1398-6. ISSN  0028-0836. PMID  31316212. S2CID  197542583.
  46. ^ Mackevich, Pavel; Gagat, Przemyslav (2014-12-31). "Filogenetik va filogenomik tadqiqotlar asosida Archaeplastida super guruhining monofilligi va uning nasl-nasablari o'rtasidagi munosabatlar. Biz konsensusga yaqinmizmi?". Acta Societatis Botanicorum Poloniae. 83 (4): 263–280. doi:10.5586 / asbp.2014.044. ISSN  2083-9480.
  47. ^ de Vriz, Jan; Archibald, Jon M. (2017). "Endosimbioz: Plastidlar chuchuk suv siyanobakteriyasidan rivojlanganmi?". Hozirgi biologiya. 27 (3): R103-R105. doi:10.1016 / j.cub.2016.12.006. PMID  28171752.
  48. ^ Lyuis, L. A. (2017). "Tuzni ushlab turing: Birlamchi plastidlarning chuchuk suvi. Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 114 (37): 9759–9760. doi:10.1073 / pnas.1712956114. PMC  5604047. PMID  28860199.
  49. ^ Raven, Jon A. (2013). "Hujayralar ichidagi hujayralar: simbiyoz va davomli fagotrofiya". Hozirgi biologiya. 23 (12): R530-R531. doi:10.1016 / j.cub.2013.05.006. PMID  23787050.
  50. ^ Andersson, Yan O.; Rojer, Endryu J. (2002). "Fotosintetik bo'lmagan protistlardagi siyanobakterial gen - ökaryotlarda xloroplastni erta olish?". Hozirgi biologiya. 12 (2): 115–119. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00649-2. PMID  11818061. S2CID  18809784.
  51. ^ Kiling, Patrik J. (2010). "Plastidalarning endosimbiyotik kelib chiqishi, xilma-xilligi va taqdiri". Qirollik jamiyatining falsafiy operatsiyalari B: Biologiya fanlari. 365 (1541): 729–748. doi:10.1098 / rstb.2009.0103. PMC  2817223. PMID  20124341.
  52. ^ Bengtson, Stefan; Sallstedt, Tereza; Belivanova, Veneta; Whitehouse, Martin (2017). "Uyali va subcellular tuzilmalarning uch o'lchovli saqlanib qolishi 1,6 milliard yillik toj guruhidagi qizil suv o'tlarini nazarda tutadi". PLOS biologiyasi. 15 (3): e2000735. doi:10.1371 / journal.pbio.2000735. PMC  5349422. PMID  28291791.
  53. ^ Javaux, Emmanuel J.; Knoll, Endryu X.; Valter, Malkolm R. (2004). "O'rta Proterozoy okeanlaridagi eukaryotik xilma-xillik uchun TEM dalillari". Geobiologiya. 2 (3): 121–132. doi:10.1111 / j.1472-4677.2004.00027.x. S2CID  53600639.
  54. ^ Yun, Xvan Su; Xakett, Eremiyo D.; Ciniglia, Klaudiya; Pinto, Gabriele; Battacharya, Debashish (2004). "Fotosintez qiluvchi ökaryotlarning kelib chiqishi molekulyar xronologiyasi". Molekulyar biologiya va evolyutsiya. 21 (5): 809–818. doi:10.1093 / molbev / msh075. PMID  14963099.
  55. ^ Butterfild, Nikolas J. (2000). "Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp .: jinsiy aloqa evolyutsiyasi, ko'p hujayralilik va ökaryotlarning mezoproterozoy / neoproterozoy nurlanishlari ". Paleobiologiya. 26 (3): 386–404. doi:10.1666 / 0094-8373 (2000) 026 <0386: BPNGNS> 2.0.CO; 2.

Tashqi havolalar