Yurgen Brosius - Jürgen Brosius - Wikipedia

Yurgen Brosius
Yurgen Brosius-2.jpg
Tug'ilgan1948
MillatiNemis
Ma'lumketma-ketlik ribosomal RNK, ifoda vektorlari uchun rekombinant oqsillar, RNK biologiyasi, RNomika, genomlar, genlar va gen modullari evolyutsiyasida retropozitsiyaning roli
Ilmiy martaba
Maydonlarmolekulyar genetika va evolyutsion biologiya
InstitutlarMyunster universiteti

Yurgen Brosius (1948 yilda tug'ilgan) yilda Saarbruken ) nemis molekulyar genetikasi va evolyutsion biologidir. U professor edi Myunster universiteti u erda eksperimental patologiya institutining direktori. Uning ba'zi ilmiy hissalari a ning birinchi genetik ketma-ketligini o'z ichiga oladi ribosomal RNK operon, dizayni plazmidlar gen ekspressionini o'rganish uchun, ifoda vektorlari yuqori darajadagi uchun rekombinant oqsillarni ishlab chiqarish va RNK, RNK biologiyasi, RNomics, shuningdek, genomlar, genlar va evolyutsiya uchun retropozitsiyaning ahamiyati. gen modullari shu jumladan tartibga soluvchi ketma-ketliklar yoki elementlar.

Biografiya

Dastlabki hayot va ta'lim

Brosius kimyo va farmatsevtika fakultetlarida o'qidi Gyote Frankfurt universiteti va 1974 yilda dorixonada Staatsexamen (davlat imtihonini) ni tugatdi va tugatdi. Keyinchalik, u doktorlik dissertatsiyasini himoya qildi. biokimyo va molekulyar biologiyada ishlash Maks Plank molekulyar genetika instituti Berlin Dahlemda Xaynts-Gyunter Vittman bo'lim mudiri edi. Bir nechta E. coli ning asosiy tuzilmalarini aniqlashda ribosoma oqsillari, u izolyatsiyalash uchun qo'lda mikro-usullarni ishlab chiqdi peptidlar tsellyuloza bo'yicha ikki o'lchovli ajratishni qo'llash yupqa qatlamli plitalar (qatorini ishlatish o'rniga xromatografiya ustunlari ) keyin dansyl-Edman degradatsiyasi. Bu kerakli oqsil moddasini 100 ga nisbatan birdan ikki martagacha kamaytirdi nanomol oralig'i.[1] Ko'p o'tmay, ushbu usul avtomatlashtirilgan tomonidan almashtirildi oqsillarni ketma-ketligi past pikomol oralig'ida ishlaydi.[2]

Doktorlikdan keyingi aloqalar

1977-1980 yillarda Brosius tomonidan qo'llab-quvvatlangan doktorlikdan keyingi stajirovka o'tkazildi Fogarti xalqaro markazi yilda Garri F. Noller Laboratoriyasi Kaliforniya universiteti, Santa-Kruz. U erda u birinchi yirik ribosomal RNKlarni genlaridan foydalanib genlar orqali ketma-ketlashtirdi Maksam-Gilbert ketma-ketligi usul. Ba'zi yonbosh mintaqalarga qo'shimcha ravishda butun rrnB rRNA operonini o'z ichiga olgan 7,5 kilobazani ketma-ket tuzish ~ 2,5 yil davom etdi.[3] Garchi kimyoviy usul noqulay bo'lsa-da, ketma-ketliklarni to'liq xatolarni aniqlab olish mumkin edi.[4]

UCSC da bo'lganida Brosius tashrif buyurgan professor bilan uchrashdi Karl Vuz, evolyutsion fikrga va molekulyar kuchga qiziqishini qo'zg'atgan filogenetik tahlil.

Tomonidan qo'llab-quvvatlangan uning doktorlikdan keyingi ikkinchi do'stligi (1980-1982) Deutsche Forschungsgesellschaft, uni laboratoriyasiga olib bordi Valter Gilbert, Kimyo bo'yicha Nobel mukofoti sovrindori (1980), da Garvard universiteti. Bu erda Brosius rivojlana boshladi plazmid vektorlari tanlash uchun targ'ibotchilar va terminatorlar,[5][6] shuningdek keng qo'llanilgan vektorlar tez-tez rRNA operonidan tartibga soluvchi ketma-ketliklar yoki modullardan foydalangan holda, E. coli tarkibidagi rekombinat oqsillarni yuqori darajada ifodalash uchun.[7][8]

Fakultet lavozimlari

1982 yilda Brosius o'z laboratoriyasini tashkil qildi Kolumbiya universiteti shifokorlar va jarrohlar kolleji dotsent sifatida qisman tomonidan moliyalashtiriladi Alfred P. Sloan jamg'armasi[9] va Irma T. Hirschl Trust.[10] 1988 yilda u o'zining tadqiqot guruhiga ko'chib o'tdi Sinay tog'idagi tibbiyot maktabi dotsent va 1994 yilda eksperimental patologiya institutining to'liq professori va direktori sifatida Myunster universiteti, Germaniya. To'qsoninchi yillarning o'rtalarida u a transgenik va genlarni yo'naltirish masalan, ishlab chiqarish orqali butun shaharchaga va undan tashqariga xizmat ko'rsatadigan bino. sichqoncha modellari insonni o'rganish uchun mo'ljallangan genetik kasalliklar.[11] 2015 yil boshidan boshlab u yangi tashkil etilgan xususiy tibbiyot maktabining tashrif buyurgan professori, Medizinische Hochschule Brandenburg Teodor Fontane.

Ilmiy hissalar

1980-yillarning boshlarida Brosius kichik miyaga xos bo'lgan narsalarga qiziqib qoldi RNK bu genlarni ifoda etishni tashkil etuvchi mexanizmning chiqindi moddasi deb o'ylardi RNK polimeraza III identifikator ketma-ketligi (ID) transkripsiyasi takrorlanadigan elementlar sifatida tasniflanadi Sinuslar, joylashgan qisqa interfaol takrorlashlar intronlar qilish orqali miyaga xos genlarning kromatin kirish mumkin RNK polimeraza II.[12] Ushbu jozibali gipoteza barqaror emas edi. Buning o'rniga, Brosius laboratoriyasi ushbu miyaning sitoplazmatik BC1 RNK-siga e'tibor qaratdi va uni klonlashtirdi cDNA ishlab chiqarish usulini ishlab chiqish orqali cDNA kutubxonalari bo'lmaganlarga asoslanganpoliadenillangan RNKlar va uning bitta genini ajratib olishgan, bu esa a ning qayta tiklangan nusxasidan kelib chiqqan transfer RNK (tRNK)Ala). BC1 RNK kemiruvchilarda ID takrorlanadigan elementlar uchun manba geni ekanligi va uning laboratoriyasi dendritik BC1 RNK ning lokalizatsiyasi neyronlar[13][14][15] ning ko'plab tarkibiy qismlari bilan birgalikda mahalliylashadi tarjima texnika.[16] Ushbu topilmalar asosida Brosius saksoninchi yillarda shunday xulosaga keldi:

1. Funktsional RNKlar nafaqat o'tmishdagi qoldiqlardir RNK dunyosi[17] ammo zamonaviy hujayralarda de novo paydo bo'lishi va hujayra yoki organizmning ishlashiga hissa qo'shishi mumkin; yana ko'plab RNKlar hali kashf etilmagan.

2. Retropoziya (RNKning DNKga aylanishi) qadimiy jarayon, ammo ko'pchilik evolyutsiyasi davomida saqlanib qolgan eukaryotlar. Bu jarayon massaga o'z hissasini qo'shdi genomlar zamonaviy ko'p hujayrali organizmlar,[18] shu bilan birga genomlarni oqimida ushlab turish va uchun xom ashyo taqdim etish genlarning novo evolyutsiyasi.[19]

3. Qayta joylashish, nafaqat segmentar genlarning takrorlanishi, shuningdek, qo'shimcha gen nusxalarini yoki kichikroq gen modullarini ham o'z ichiga olishi mumkin tartibga soluvchi elementlar mavjud genlar uchun.[20][19][21]

Bilan birga Stiven J.Guld, Brosius kontseptsiyasini oldi ozod qilish genomik darajaga.[22][23][24]

BC1 RNK atrofidagi ogohlantiruvchi topilmalardan ruhlanib, to'qsoninchi yillarning o'rtalarida u genom loyihalari bilan birgalikda RNK kodlash genlarining ahamiyatini ta'kidladi.[25] va ko'proq cDNA kutubxonalarini yaratishga kirishdi oqsil bo'lmagan kodlash RNKlari sichqonlardan va har xil model organizmlar, RNomics davrida qo'ng'iroq qilish,[26][27][28]

Bir qator kichik nukleolyar RNKlar miyada ham keng tarqalgan muhrlangan (faqat bitta ota-ona xromosomasi bilan ifodalangan) sichqonlar va odamlarda topilgan.[26][28]

Ulardan bir nechtasi odam uchun xaritada ko'rsatilgan Prader-Villi sindromi lokus, a neyro rivojlanishning buzilishi. Sichqoncha modellarida ushbu lokusning barcha protein kodlash genlari nomzodlari individual ravishda o'chirilgandan so'ng,[29] Brosius laboratoriyasi klasterni o'chirib tashladi Snord116 snoRNA genlari va xost genining mos keladigan oqsil bo'lmagan kodlash eksonlari. Ular inson buzilishi kabi ba'zi bir xil fenotiplarni kuzatdilar rivojlanmaslik past bo'yli, ammo keyinchalik hayotda yoki bepushtlikda semirish emas.[30] Buni mustaqil tadqiqotlar tasdiqladi.[31]

Avvalroq Brosius va uning hamkasblari BC1 RNK geniga ega bo'lmagan sichqonlarning laboratoriyada va yarim tabiiy sharoitlarda kashfiyotchi xatti-harakatlarida nuqsonlar borligini namoyish etishgan.[32]

Boshqa RNomics kashfiyotlaridan tashqari, ular birinchi bo'lib ba'zi tandem takrorlanishlari qayta ishlanganligini namoyish etdilar CRISPR RNK birliklari Arxeya.[33]

Brosius uzoq vaqtdan beri advokat bo'lib qolmoqda[34] zamonaviy hujayralardagi ham RNK molekulalarining ahamiyati va boyligi uchun. Shunga qaramay, u ilmiy doiradagi RNKni qabul qilishdagi keskin o'zgarishlarga shubha bilan qaraydi. RNKning keng tarqalgan ahamiyati g'oyasi ilgari tez-tez rad etilgan. Hozirgi vaqtda fikrlash tendentsiyasi har qanday transkriptni yoki transkriptning aniqlanadigan parchasini qayta ishlashdan yoki funktsional holatga kelgandan keyin ko'tarishdir.[35][36][37][38][39]

U takrorlanadigan yoki o'xshash sohadagi o'xshash tendentsiyalarni kuzatdi transpozitsiya qilingan genomik elementlar Qayta joylashgan elementlarni o'z ichiga olgan (TE).[20] Ushbu elementlar dastlab mavjud deb hisoblangan axlat, axlatni tashlab yuboradigan genomlar va faqat bir nechtasi tomonidan tasodifiy va faqat vaqti-vaqti bilan olib ketilish uchun xom ashyo sifatida taklif qilingan,[40] va genomlarning plastikligi va genlarning modulli arxitekturasi uchun javobgar bo'lish.[19][41][40] Hozirgi to'lqin teskari yo'nalishda harakat qilmoqda.[42] TE-larga ko'p funktsiyalar berildi, ularning bir misoli evolyutsion ravishda yosh primatlarga xos vazifalarning ajablantiradigan spektri. Alu elementlari. Bunday keng talqinlarga qarshi turish kerak.[43]

Boshqa tadqiqot yo'nalishlari quyidagilarni o'z ichiga oladi:

Tahririyat kengashlari

  • "PLoS Genetika" dotsenti muharriri (2009-)
  • "Molekulyar evolyutsiya jurnali" dotsenti muharriri (2004-2012)
  • "Ilmiy ma'ruzalar" tahririyat kengashi a'zosi (2015-)
  • "PLoS ONE" tahrir kengashi a'zosi (2010-)
  • "Mobil DNK" tahririyat kengashi a'zosi (2009-)
  • "Biology Direct" tahririyat kengashi a'zosi (2007-)
  • "RNK Biologiya" tahrir kengashi a'zosi (2004-)
  • "RepBase Reports" tahririyat kengashi a'zosi (2001-)
  • "DNK va hujayra biologiyasi" tahririyat kengashi a'zosi va Evropa muharriri (1986-2011)

Tashqi havolalar

Nashrlar

Adabiyotlar

  1. ^ Brosius J. Escherichia coli ribosomal oqsilining asosiy tuzilishi L31 Biokimyo. 1978 yil 7-fevral; 17 (3): 501-8
  2. ^ Hunkapiller MW, Hood LE. Proteinlar ketma-ketligini tahlil qilish: avtomatlashtirilgan mikroskventsiya. Ilm-fan. 1983 yil 11-fevral; 219 (4585): 650-9.
  3. ^ Brosius J, Dull TJ, Sleeter DD, Noller HF. Escherichia coli-dan ribosomal RNK operonining gen tashkiloti va asosiy tuzilishi. J Mol Biol. 1981 yil 15-may; 148 (2): 107-27.
  4. ^ Blattner FR, Burland V, Plunkett G 3rd, Sofiya HJ, Daniels DL. Escherichia coli genomini tahlil qilish. IV. Mintaqaning DNKning ketma-ketligi 89,2 dan 92,8 daqiqagacha. Nuklein kislotalari rez. 1993 yil 25-noyabr; 21 (23): 5408-17.y
  5. ^ Brosius J. Plazmid vektorlari promouterlarni tanlash uchun. Gen. 1984 yil fevral; 27 (2): 151-60.
  6. ^ Brosius J. Escherichia coli-da ortiqcha ishlab chiqarilgan begona gen mahsulotining toksikligi va uning transkripsiya terminatorlarini tanlash uchun plazmid vektorlarida ishlatilishi. Gen. 1984 yil fevral; 27 (2): 161-72.
  7. ^ Brosius J, Holy A. Sintetik lak operatori bilan ribosomal RNK promotorlarini tartibga solish. Proc Natl Acad Sci U S A. 1984 yil noyabr; 81 (22): 6929-33.
  8. ^ Amann E, Brosius J. "Escherichia coli-da klonlangan genlarning yuqori darajadagi tartibga solinishi uchun ATG vektorlari. Gen. 1985; 40 (2-3): 183-90.
  9. ^ [1]
  10. ^ Irma T. Hirschl Trust
  11. ^ Münster tibbiyot fakultetining TRAnsgenik hayvonlar va genetik muhandislik modellari (TRAM)
  12. ^ Sutkliff JG, Milner RJ, Gottesfeld JM, Reynolds V. Neyron genlarining ekspressionini boshqarish. Ilm-fan. 1984 yil 21 sentyabr; 225 (4668): 1308-15
  13. ^ DeChiara TM, Brosius J. Neural BC1 RNK: cDNA klonlari takrorlanmaydigan ketma-ketlik tarkibini ochib beradi. Proc Natl Acad Sci U S A. 1987 yil may; 84 (9): 2624-8
  14. ^ Tiedge H, Fremeau RT Jr, Weinstock PH, Arancio O, Brosius J. Dendritik BC1 neyron BCN nerv joylashuvi. Proc Natl Acad Sci U S A. 1991 yil 15-mart; 88 (6): 2093-7
  15. ^ Kim J, Martignetti JA, Shen MR, Brosius J, Deininger P. Rodent BC1 RNK geni ID elementini kuchaytirish uchun usta geni sifatida.Proc Natl Acad Sci U S A. 1994 yil 26-aprel; 91 (9): 3607-11
  16. ^ Tiedge H, Brosius J. Madaniyatdagi hipokampal neyronlarning dendritlarida translyatsion texnika. J Neurosci. 1996 yil 15-noyabr; 16 (22): 7171-81.
  17. ^ Brosius J. O'tmishdagi aks-sadolar - biz hali ham RNP dunyosidamizmi? Sitogenet Genom Res. 2005; 110 (1-4): 8-24.
  18. ^ Barcha toifadagi Brosius J. RNKlari yangi genlar yoki tartibga soluvchi elementlar sifatida chiqarilishi mumkin bo'lgan retrosekventsiyalarni hosil qiladi. Gen. 1999 yil 30 sentyabr; 238 (1): 115-34.
  19. ^ a b v Brosius J, Tiedge H. Teskari transkriptaz: genomik plastika vositachisi. Virus genlari. 1995; 11 (2-3): 163-79.
  20. ^ a b Brosius J. Retroposons - evolyutsiya urug'lari. Ilm-fan. 1991 yil 15-fevral; 251 (4995): 753
  21. ^ Vayner AM. 2006 yil RNAworld-da (tahr. Gesteland RF, Cech TR, Atkins JF), 507-533-betlar. Sovuq Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY].
  22. ^ Brosius J, Gould SJ. "Genomenklatura" bo'yicha: psevdogenlar va boshqa "keraksiz DNK" lar uchun keng qamrovli (va hurmatli) taksonomiya. Proc Natl Acad Sci U S A. 1992 yil 15-noyabr; 89 (22): 10706-10.
  23. ^ Stiven Jey Guld, Elisabet S. Vrba (1982) Asirlik - shakl ilmida etishmayotgan atama. Paleobiologiya 8, 4-15
  24. ^ Brosius J, Gould SJ. Molekulyar konstruktivlik. Tabiat. 1993 yil 9 sentyabr; 365 (6442): 102
  25. ^ Brosius J. Ko'proq gemofil va mikoplazma genlari. Ilm-fan. 1996 yil 1-mart; 271 (5253): 1302a
  26. ^ a b Hüttenhofer A, Kiefmann M, Meier-Ewert S, O'Brien J, Lehrach H, Bachellerie JP, Brosius J. RNomics: sichqonchada yangi, kichik, messenjer bo'lmagan RNKlarga 201 nomzodni aniqlaydigan eksperimental yondashuv. EMBO J. 2001 yil 1-iyun; 20 (11): 2943-53
  27. ^ Filipowicz W. Miyadagi kichik nukleolyar RNKlarning ekspression ekspressioni: RNomics uchun vaqt. Proc Natl Acad Sci U S A. 2000 yil 19-dekabr; 97 (26): 14035-7
  28. ^ a b Cavaillé J, Buiting K, Kiefmann M, Lalande M, Brannan CI, Horsthemke B, Bachellerie JP, Brosius J, Hüttenhofer A. G'ayrioddiy genomik tashkilotni namoyish qiluvchi miyaga xos va muhrlangan kichik nukleolyar RNK genlarini aniqlash. Proc Natl Acad Sci U S A. 2000 yil 19-dekabr; 97 (26): 14311-6.
  29. ^ Bervini S, Herzog H. Prader-Villi sindromining sichqoncha modellari: muntazam ravishda ko'rib chiqish. Old neyroendokrinol. 2013 yil aprel; 34 (2): 107-19. doi: 10.1016 / j.yfrne.2013.01.01.002. Epub 2013 yil 4-fevral.
  30. ^ Skryabin BV, Gubar LV, Seeger B, Pfeiffer J, Handel S, Robeck T, Karpova E, Rozhdestvensky TS, Brosius J. MBII-85 snoRNA gen klasterining sichqonlarda yo'q qilinishi tug'ruqdan keyingi o'sishning sustlashishiga olib keladi. PLoS Genet. 2007 yil 28-dekabr; 3 (12): e235. doi: 10.1371 / journal.pgen.0030235.
  31. ^ Ding F, Li HH, Zhang S, Solomon NM, Camper SA, Cohen P, Francke U. SnoRNA Snord116 (Pwcr1 / MBII-85) o'chirilishi sichqonlarda o'sish etishmovchiligini va giperfagiyani keltirib chiqaradi. PLoS One. 2008 yil 5-mart; 3 (3): e1709. doi: 10.1371 / journal.pone.0001709
  32. ^ Lewejohann L, Skryabin BV, Sachser N, Prehn C, Heiduschka P, Thanos S, Jordan U, Dell'Omo G, Vyssotski AL, Pleskacheva MG, Lipp HP, Tiedge H, Brosius J, Prior H. Neyron kichik bo'lmagan kishining roli -xabarchi RNK: BC1 RNK-o'chirilgan sichqonlarda xatti-harakatlarning o'zgarishi. Behav Brain Res. 2004 yil 23 sentyabr; 154 (1): 273-89
  33. ^ Tang TH, Bachellerie JP, Rozhdestvensky T, Bortolin ML, Huber H, Drungowski M, Elge T, Brosius J, Hüttenhofer A. Archaeoglobus fulgidus arxeonidan kichik messenjerli RNKlarga 86 nomzodni aniqlash. Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 yil 28-may; 99 (11): 7536-41
  34. ^ Petherick A. Genetika: ishlab chiqarish liniyasi. Tabiat. 2008 yil 28 avgust; 454 (7208): 1042-5. doi: 10.1038 / 4541042a
  35. ^ Brosius J. Ko'p hujayrali eukaryotlarda transkripsiyaning ko'pligi isrof qilinmaydi, xohlamaydi. Trends Genet. 2005 yil may; 21 (5): 287-8.
  36. ^ Brosius J. RNKning doimiy ravishda eukaryotik gen (om) me'morchiligi va uyali funktsiyaga qo'shgan hissasi. Sovuq bahor harb istiqbolli biol. 2014 yil 31-iyul; 6 (12): a016089. doi: 10.1101 / cshperspect.a016089.
  37. ^ Raabe, CA, Brosius J. Har bir transkript gendan kelib chiqadimi? Ann N Y Acad Sci. 2015 yil aprel; 1341: 136-48. doi: 10.1111 / nyas.12741.
  38. ^ Brosius J, Raabe, Kaliforniya. RNK nima? RNK tasnifi uchun yuqori qatlam. RNK Biol. 2016 yil fevral; 13 (2): 140-4. doi: 10.1080 / 15476286.2015.1128064
  39. ^ RNK multfilmi - pastki uchlik
  40. ^ a b Brosius J. Parchalangan gen. Ann N Y Acad Sci. 2009 yil oktyabr; 1178: 186-93. doi: 10.1111 / j.1749-6632.2009.05004.x
  41. ^ Krull M, Brosius J, Shmitz J. Alu-SINE eksonizatsiyasi: oqsillarni kodlash funktsiyasiga yo'l. Mol Biol Evol. 2005 yil avgust; 22 (8): 1702-11. Epub 2005 yil 18-may
  42. ^ Retrostuff multfilmi - eng yaxshi uchlik
  43. ^ Graur D, Zheng Y, Price N, Azevedo RB, Zufall RA, Elhaik E. Televizorlarning boqiyligi to'g'risida: inson genomida "kod" ning evolyutsiyasiz xushxabariga ko'ra "funktsiya". Genom Biol Evol. 2013; 5 (3): 578-90. doi: 10.1093 / gbe / evt028
  44. ^ Krull M, Petrusma M, Makalovski V, Brosius J, Shmitz J. Eksonlangan sutemizuvchilar keng tarqalgan intervalgacha takroriy elementlarning (MIR) funktsional qat'iyligi. Genom Res. 2007 yil avgust; 17 (8): 1139-45. Epub 2007 yil 10-iyul
  45. ^ Martignetti JA, Brosius J. Neural BC1 RNK evolyutsion belgi sifatida: dengiz cho'chqasi kemiruvchi bo'lib qoladi. Proc Natl Acad Sci U S A. 1993 yil 15 oktyabr; 90 (20): 9698-702
  46. ^ Brosius J. Genning takrorlanishi va boshqa evolyutsion strategiyalar: RNK dunyosidan kelajakka. J Struct Funktsiyasi Genomikasi. 2003; 3 (1-4): 1-17
  47. ^ Brosius J. Edendan do'zaxga bir xillikka? Odamlarda yo'naltirilgan evolyutsiya. 2003 yil avgust; 25 (8): 815-21
  48. ^ Patent AQSh # 5,670,318 va AQSh # 5,736,329