PER3 - PER3

PER3
Identifikatorlar
TaxalluslarPER3, GIG13, FASPS3, davriy sirkadiy soat 3, davriy sirkadiy regulyator 3
Tashqi identifikatorlarOMIM: 603427 MGI: 1277134 HomoloGene: 7886 Generkartalar: PER3
Gen joylashuvi (odam)
Xromosoma 1 (odam)
Chr.Xromosoma 1 (odam)[1]
Xromosoma 1 (odam)
PER3 uchun genomik joylashuv
PER3 uchun genomik joylashuv
Band1p36.23Boshlang7,784,320 bp[1]
Oxiri7,845,177 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Fs.png da PBB GE PER3 221045 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez

8863

18628

Ansambl

ENSG00000049246

ENSMUSG00000028957

UniProt

P56645

O70361

RefSeq (mRNA)

NM_011067
NM_001289877
NM_001289878

RefSeq (oqsil)

NP_001276806
NP_001276807
NP_035197

Joylashuv (UCSC)Chr 1: 7.78 - 7.85 MbChr 4: 151 - 151.04 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

The PER3 gen kodlaydi davr sirkadiyalik oqsil gomologi 3 oqsil odamlarda.[5] PER3 - bu paralog uchun PER1 va PER2 genlar. Bu sirkadiyalik gen bilan bog'langan kechiktirilgan uyqu fazasi sindromi odamlarda.[6]

Tarix

Per3 geni ikkita tadqiqot guruhi (Kobe universiteti tibbiyot maktabi va Garvard tibbiyot maktabi) tomonidan mustaqil ravishda klonlangan bo'lib, ikkalasi ham o'zlarining kashfiyotlarini 1998 yil iyun oyida nashr etishdi.[7][8] Per3 sutemizuvchisi Per2 ga homolog cDNA ketma-ketliklarini qidirib topildi. Sichqoncha PERIOD3 oqsilining (mPER3) aminokislota ketma-ketligi boshqa ikkita PER oqsiliga o'xshash 37-56% orasida.[8][7]

Funktsiya

Ushbu gen Period oilasining a'zosi. Bu a sirkadiyalik ichida naqsh supraxiyazmatik yadro (SCN), sutemizuvchilar miyasidagi birlamchi sirkadiyalik yurak stimulyatori. Ushbu oiladagi genlar. Komponentlarini kodlaydi sirkadiyalik ritmlar harakatlanish harakati, metabolizm va xatti-harakatlar. SCNdagi sirkadiyalik ifoda doimiy zulmatda davom etadi va yorug'lik / qorong'i tsikldagi siljish SCNda gen ekspressionining mutanosib siljishini keltirib chiqaradi.[9] PER1 va PER2 magistrda vaqtni tejash va yorug'likka javob berish uchun zarur sirkadiyalik soat SCN-da, ammo PER3 uchun aniq funktsiya haqida ozgina ma'lumotlar ko'rsatilgan. PER3 ma'lum to'qimalarda vaqtni vaqtni saqlash uchun muhim deb topildi va endogen davrlarda to'qimalarga xos bo'lgan bu o'zgarishlar Per3 juft nokaut (- / -) sichqonlarida sirkadiyalik soatlarning ichki kelishmovchiligiga olib keladi.[10] PER3 PER1 va PER2 ga barqarorlashtiruvchi ta'sir ko'rsatishi mumkin va bu barqarorlashtiruvchi ta'sir PER3-P415A / H417R polimorfizmida kamayishi mumkin.[11]

Xronobiologiyadagi o'rni

The RNK mPer3 darajalari a bilan tebranadi sirkadiyalik ikkalasida ham ritm SCN va ko'zlarda, shuningdek periferik to'qimalarda, shu jumladan jigar, skelet mushaklari va moyak.[8] Per1 va Per2 dan farqli o'laroq, ulardan mRNK nurga javoban induktsiya qilinadi, Per3 mRNA SCN nurga javob bermaydi. Bu shuni ko'rsatadiki, Per3 Per1 yoki Per2 dan farqli ravishda tartibga solinishi mumkin.[8]

MPER3 oqsilida a mavjud PAS domeni, mPER1 va mPER2 ga o'xshash. Ehtimol, mPER3 ushbu domen yordamida boshqa oqsillar bilan bog'lanadi.[8] Biroq, PER1 / 2 hujayra ichidagi transkripsiya-tarjima teskari aloqasida muhim ahamiyatga ega ekanligi ko'rsatilgan sirkadiyalik soat, mER3 funktsional jihatdan mPER1 va mPER2 ga ortiqcha emasligini hisobga olib, ushbu tsikldagi PER3 ning ta'siri hali to'liq aniqlanmagan.[12] mPer3 yadro a'zosi bo'lmasligi mumkin soat umuman pastadir.[12]

Hayvonlarni o'rganish

Per3 geni a paralog PER1 va PER2 genlariga nisbatan, hayvonlarda o'tkazilgan tadqiqotlar shuni ko'rsatadiki, u tsirkadiyalik ritmlarga katta hissa qo'shmaydi. Funktsional Per3 - / - hayvonlar faqat kichik o'zgarishlarga duch kelishadi erkin ishlaydigan davr,[12] va yorug'lik impulslariga sezilarli darajada farq qilmang.[13] Per1 - / - va Per2 - / - hayvonlar erkin harakatlanish davrida sezilarli o'zgarishlarga duch kelishadi; ammo Per1 yoki Per2 ga qo'shimcha ravishda Per3ni nokaut qilish erkin yugurish ritmlariga unchalik ta'sir qilmaydi.[12] Bundan tashqari, Per1 - / - Per2 - / - sichqonlari butunlay aritmik bo'lib, bu ikki genning Per3 ga qaraganda biologik soat uchun ahamiyati katta ekanligini ko'rsatadi.[12]

Per3 nokaut bilan yiqitmoq; ishdan chiqarilgan sichqonlarda harakatlanish harakati biroz qisqartirilgan (0,5 soatga)[13]) va yorug'likka nisbatan kam sezgir, chunki ular qorong'ulik va qorong'ulik davridagi o'zgarishlarga sekinroq bog'lanib qoladilar. PER3 nurga javoban xatti-harakatni bostirishda ishtirok etishi mumkin, ammo mPer3 ekspressioni sirkadiyalik ritmlar uchun zarur emas.[14][15]

Klinik ahamiyati

Exon 18-dagi 54-bp takroriy ketma-ketlikdagi PER3 "uzunlik" polimorfizmi (GenBank qo'shilish raqami. AB047686) - bu taxminiy fosforillanish domenini kodlovchi mintaqaga 18 ta aminokislotani kiritish yoki yo'q qilish sababli strukturaviy polimorfizmdir. Polimorfizm kunduzgi afzallik va bilan bog'liq kechiktirilgan uyqu fazasi sindromi. Uzunroq allel polimorfizmi bilan bog'liq "Tong" va qisqa allel bilan "Oqshom". Qisqa allel, shuningdek, kechiktirilgan uyqu fazasi sindromi bilan bog'liq.[6] Uzunlik polimorfizmi adipogenezni inhibe qilgani va Per3 nokaut sichqonlari ko'payganligi ko'rsatilgan yog ' yovvoyi turga nisbatan to'qima va mushak to'qimalarining pasayishi. Bundan tashqari, uzunlikdagi polimorfizmning mavjudligi diabetga chalingan bo'lmagan bemorlarga nisbatan 2-toifa diabet mellitus (T2DM) bemorlari bilan bog'liqligi ko'rsatilgan.[16] PER3-P415A / H417R polimorfizmi bilan bog'langan oilaviy rivojlangan uyqu fazasi sindromi odamlarda, shuningdek mavsumiy affektiv buzilish, ammo sichqonlar bilan urishganda, polimorfizm kechiktirilgan uyqu fazasini keltirib chiqaradi.[11]

Gen

Ortologlar

Quyida ba'zilarining ro'yxati keltirilgan ortologlar boshqa turlardagi PER3 genining:[17]

  • PER3 (P. trogloditlar)
  • PER3 (M. mulatta)
  • PER3 (C. qizilcha)
  • PER3 (H. sapiens)
  • PER3 (B. tarus)
  • Per3 (M. mushaklari)
  • Per3 (R. norvegicus)
  • PER3 (G. gallus)
  • per3 (X. tropicalis)
  • per3 (D. rerio)

Paraloglar

  • PER1
  • PER2

Gen joylashuvi

Insonning PER3 geni 1-xromosomada quyidagi joyda joylashgan:[18]

  • Boshlanishi: 7 784 320 bp
  • Tugatish: 7,845,181 bp
  • Uzunlik: 60,862 taglik
  • Exons: 25

PER3-da 19 ta transkript (splice variantlari) mavjud.

Protein tuzilishi

PER3 oqsili quyidagi xususiyatlarga ega ekanligi aniqlandi:[19]

  • Hajmi: 1201 aminokislotalar
  • Molekulyar massa: 131888 Da
  • To‘rtlamchi davr tuzilishi: Gomodimer

Tarjima modifikatsiyasini yuboring

Quyida Per3 geniga transkripsiyadan keyingi ma'lum modifikatsiyalar keltirilgan:[19]

  • CSNK1E tomonidan fosforillanish kuchsiz va PER1 bilan birikishni va yadroga translokatsiyani talab qiladi.
  • Joylashgan.
  • PhosphoSitePlus-da o'zgartirish joylari
  • NeXtProt-da o'zgartirish joylari

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000049246 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000028957 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ Shearman LP, Zylka MJ, Weaver DR, Kolakowski LF, Reppert SM (dekabr 1997). "Ikki davrli gomologlar: sutkalik ekspression va suprakiazmatik yadrolarda fotik regulyatsiya". Neyron. 19 (6): 1261–9. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80417-1. PMID  9427249. S2CID  10059149.
  6. ^ a b Archer SN, Robilliard DL, Skene DJ, Smits M, Uilyams A, Arendt J, fon Shants M (iyun 2003). "Per3 sirkadiyalik soat genidagi uzunlik polimorfizmi kechiktirilgan uyqu fazasi sindromi va kunduzgi afzallik bilan bog'liq". Uyqu. 26 (4): 413–5. doi:10.1093 / uyqu / 26.4.413. PMID  12841365.
  7. ^ a b Takumi T, Taguchi K, Miyake S, Sakakida Y, Takashima N, Matsubara C, Maebayashi Y, Okumura K, Takekida S, Yamamoto S, Yagita K, Yan L, Young MW, Okamura H (Avgust 1998). "SCN va OVLT sichqonchasida yorug'likdan mustaqil tebranuvchi gen mPer3". EMBO jurnali. 17 (16): 4753–9. doi:10.1093 / emboj / 17.16.4753. PMC  1170804. PMID  9707434.
  8. ^ a b v d e Zylka MJ, Shearman LP, Weaver DR, Reppert SM (iyun 1998). "Sutemizuvchilardagi uch davrli gomologlar: suprakiyazmatik sirkadiyalik soatdagi differentsial yorug'lik reaktsiyalari va miyadan tashqaridagi tebranuvchi transkriptlar". Neyron. 20 (6): 1103–10. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80492-4. PMID  9655499. S2CID  14797914.
  9. ^ "Entrez Gen: PER3 davr homolog 3 (Inson)".
  10. ^ Pendergast JS, Niswender KD, Yamazaki S (2012). "Period3 ning tsirkad ritmidagi to'qimalarga xos funktsiyasi". PLOS ONE. 7 (1): e30254. Bibcode:2012PLoSO ... 730254P. doi:10.1371 / journal.pone.0030254. PMC  3256228. PMID  22253927.
  11. ^ a b Zhang L, Hirano A, Hsu PK, Jones CR, Sakai N, Okuro M, McMahon T, Yamazaki M, Xu Y, Saigoh N, Saigoh K, Lin ST, Kaasik K, Nishino S, Ptáček LJ, Fu YH (2016 yil mart) ). "PERIOD3 varianti sirkadiyalik fenotipni keltirib chiqaradi va mavsumiy kayfiyat xususiyati bilan bog'liq". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 113 (11): E1536-44. Bibcode:2016PNAS..113E1536Z. doi:10.1073 / pnas.1600039113. PMC  4801303. PMID  26903630.
  12. ^ a b v d e Bae K, Jin X, Mayvud ES, Xastings MH, Reppert SM, Weaver DR (may 2001). "SCP sirkadiyalik soatidagi mPer1, mPer2 va mPer3 ning differentsial funktsiyalari". Neyron. 30 (2): 525–36. doi:10.1016 / S0896-6273 (01) 00302-6. PMID  11395012. S2CID  219582.
  13. ^ a b Shearman LP, Jin X, Lee C, Reppert SM, Weaver DR (sentyabr 2000). "MPer3 genining maqsadli buzilishi: sirkadiyalik soat funktsiyasiga nozik ta'sirlar". Molekulyar va uyali biologiya. 20 (17): 6269–75. doi:10.1128 / MCB.20.17.6269-6275.2000. PMC  86101. PMID  10938103.
  14. ^ van der Veen DR, Archer SN (2010 yil fevral). "PER3 tanqisligi bo'lgan sichqonlarda nurga bog'liq bo'lgan xatti-harakatlar fenotiplari" (PDF). Biologik ritmlar jurnali. 25 (1): 3–8. doi:10.1177/0748730409356680. PMID  20075295. S2CID  770136.
  15. ^ Pereira DS, van der Veen DR, Gonsalves BS, Tufik S, fon Shants M, Archer SN, Pedrazzoli M (2014). "Per3 nokautli sichqonlarning sirkadiyalik ritmidagi turli xil fotoperiodlarning ta'siri". BioMed Research International. 2014: 170795. doi:10.1155/2014/170795. PMC  4042019. PMID  24982860.
  16. ^ Karthikeyan R, Marimuthu G, Sooriyakumar M, BaHammam AS, Spence DW, Pandi-Perumal SR, Brown GM, Cardinali DP (iyun 2014). "Ikkinchi turdagi qandli diabet bilan og'rigan bemorlarda Per3 uzunlikdagi polimorfizm". Gormonlar molekulyar biologiyasi va klinik tekshiruvi. 18 (3): 145–9. doi:10.1515 / hmbci-2013-0049. hdl:11336/15739. PMID  25390010. S2CID  36626446.
  17. ^ "PER3". Gomologen. NCBI. 2017 yil. Olingan 12 aprel 2017.
  18. ^ "PER3". Entrez Gen. NCBI. 2017 yil. Olingan 12 aprel 2017.
  19. ^ a b "Per3 Gen". Generkartalar. Weizmann Ilmiy Instituti. Olingan 12 aprel, 2017.

Tashqi havolalar

Ushbu maqolada Amerika Qo'shma Shtatlarining Milliy tibbiyot kutubxonasi ichida joylashgan jamoat mulki.