PLA2G6 - PLA2G6

PLA2G6
Identifikatorlar
TaxalluslarPLA2G6, CaI-PLA2, GVI, INAD1, IPLA2-VIA, NBIA2, NBIA2A, NBIA2B, PARK14, PLA2, PNPLA9, iPLA2, iPLA2beta, fosfolipaza A2 guruhi VI
Tashqi identifikatorlarOMIM: 603604 MGI: 1859152 HomoloGene: 2635 Generkartalar: PLA2G6
Gen joylashuvi (odam)
22-xromosoma (odam)
Chr.22-xromosoma (odam)[1]
22-xromosoma (odam)
PLA2G6 uchun genomik joylashuv
PLA2G6 uchun genomik joylashuv
Band22q13.1Boshlang38,111,495 bp[1]
Oxiri38,214,778 bp[1]
RNK ekspressioni naqsh
Ps.Bng da PBB GE PLA2G6 204691 x

PBB GE PLA2G6 210647 x da fs.png

Ps.Bng da PBB GE PLA2G6 215938 s
Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Ortologlar
TurlarInsonSichqoncha
Entrez
Ansambl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001199023
NM_001199024
NM_001199025
NM_016915

RefSeq (oqsil)

NP_001185952
NP_001185953
NP_001185954
NP_058611

Joylashuv (UCSC)Chr 22: 38.11 - 38.21 MbChr 15: 79.29 - 79.33 Mb
PubMed qidirmoq[3][4]
Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlashSichqonchani ko'rish / tahrirlash

85 kDa kaltsiydan mustaqil fosfolipaza A2, shuningdek, nomi bilan tanilgan 85/88 kDa kaltsiydan mustaqil fosfolipaza A2, VI guruh fosfolipaza A2, Hujayra ichidagi membrana bilan bog'liq bo'lgan kaltsiyga bog'liq bo'lmagan fosfolipaza A2 beta, yoki Patatinga o'xshash fosfolipaza domeni tarkibidagi oqsil 9 bu ferment odamlarda kodlanganligi PLA2G6 gen.[5][6][7][8][9][10]

Tuzilishi

The PLA2G6 gen joylashgan p qo'l ning xromosoma 22 13.1 pozitsiyasida va u 80605 tayanch juftligini o'z ichiga oladi.[8] The PLA2G6 gen 166 dan iborat bo'lgan 18,6 kDa oqsilini ishlab chiqaradi aminokislotalar.[11][12] Hosil bo'lgan oqsil tuzilishi tarkibida a borligi ko'rsatilgan lipaza motif va 8 ankirin takrorlaydi.[5] Umumiy 90 foizni tashkil etishi ma'lum bo'lgan kemiruvchilar PLA2G6 dan farq qiladi aminokislota odamning PLA2G6 oqsiliga ega bo'lgan ketma-ketlik identifikatori 54 ta qoldiq qo'shimchasini o'z ichiga oladi, prolin - boy mintaqa. Ushbu qo'shimchalar oxirgisi buzilganligi ko'rsatildi taxminiy ankirin takrorlang, shuningdek ajratuvchi bog'lovchi mintaqa sifatida ishlaydi N-terminal dan oqsillarni bog'laydigan domen C-terminali katalitik domen.[5][13]

Funktsiya

The PLA2G6 gen a uchun kodlaydi fosfolipaza A2 ferment, bu fermentning subklassi bo'lib, uning chiqarilishini katalizlaydi yog 'kislotalari dan fosfolipidlar.[8] Ushbu turdagi fermentlar parchalanish (metabolizm) uchun javobgardir. fosfolipidlar. Fosfolipid metabolizm tanadagi ko'plab jarayonlar uchun juda muhimdir, shu jumladan hujayra membranasi.

Xususan, A2 fosfolipaza dan ishlab chiqarilgan PLA2G6 ba'zan PLA2 guruhi VI deb ataladigan gen, deyilgan birikma darajasini tartibga solishga yordam beradi fosfatidilxolin, hujayra membranasida juda ko'p.[14] Bunda kodlangan oqsil ham rol o'ynashi mumkin fosfolipid qayta qurish, arakidon kislotasi ajratish, azot oksidi ta'sirida yoki vazopressin - tushuntirilgan arakidon kislotasi ozod qilish va leykotrien va prostaglandin sintez, Fas retseptorlari - vositachilik apoptoz va transmembran ionlari oqimi glyukoza - rag'batlantirildi B hujayralari.[8][9]

Bundan tashqari, uning roli bor kardiolipin (CL) deatsilatsiya, va ham tezligi, ham yo'nalishi uchun talab qilinadi monotsit MCP1 / CCL2 - tushuntirilgan kemotaksis tartibga solish orqali F-aktin polimerizatsiya da psevdopodlar. Katalitik domenga ega bo'lmagan izoform ankirin-iPLA2-1 va izoform ankirin-iPLA2-2, ehtimol PLA2G6 faolligining salbiy regulyatsiyasida qatnashgan.[9] Bir nechta transkript variantlari bir nechta kodlash izoformlar tasvirlangan, ammo ulardan faqat ikkitasining to'liq metrajli xususiyati bugungi kungacha aniqlangan.[8]

Katalitik faollik

Fosfatidilxolin + H2O = 1-atsilgliserofosfokolin + karboksilat.[10][9]

Model organizmlar

Model organizmlar PLA2G6 funktsiyasini o'rganishda ishlatilgan. Shartli sichqoncha chiziq chaqirildi Pla2g6tm1a (EUCOMM) Wtsi da hosil bo'lgan Wellcome Trust Sanger instituti.[15] Erkak va urg'ochi hayvonlar standartlashtirildi fenotipik ekran[16] o'chirish ta'sirini aniqlash uchun.[17][18][19][20] Qo'shimcha ekranlar amalga oshirildi: - chuqur immunologik fenotiplash.[21]

Klinik ahamiyati

Mutatsiyalar PLA2G6 mitokondriyal etishmovchilik va shu bilan bog'liq buzilishlarga olib kelishi ko'rsatilgan Miyaning temir birikmasi 2B (NBIA2B) bilan neyrodejeneratsiya, Miyaning temir birikmasi 2A (NBIA2A) bilan neyrodejeneratsiya, Parkinson kasalligi 14 (PARK14) va irsiy spastik paraplegiya.[22][9][10]

Miyaning temir birikmasi 2B (NBIA2B) bilan neyrodejeneratsiya

Miyaning temir birikmasi 2B (NBIA2B) bilan neyrodejeneratsiya bilan bog'liq bo'lgan neyrodejenerativ buzilishdir temir miyada to'planish, birinchi navbatda bazal ganglionlar. Bu progressivlik bilan ajralib turadi ekstrapiramidal qattiqlikka olib keladigan disfunktsiya, distoniya, dizartriya va sensorimotorlarning buzilishi.[9][10]

Neyrodejeneratsiya | Miyada temir birikmasi 2A (NBIA2A) bilan neyrodejeneratsiya

Miyaning temir birikmasi 2A (NBIA2A) bilan neyrodejeneratsiya a neyrodejenerativ kasallik patologik xarakterlidir aksonal shish va sferoid jismlar ichida markaziy asab tizimi. Boshlanish hayotning dastlabki 2 yilida, 10 yoshgacha o'lim bilan.[9][10]

Parkinson kasalligi 14 (PARK14)

Parkinson kasalligi 14 (PARK14) parkinsonizm bilan tavsiflangan, kattalar uchun boshlangan progressiv neyrodejenerativ kasallik, distoniya, jiddiy kognitiv pasayish, miya va serebellar atrofiya va tarkibida temir yo'q bazal ganglionlar kuni magnit-rezonans tomografiya.[9][10]

Irsiy spastik paraplegiya

Irsiy spastik paraplegialar irsiy degenerativning turli xil sinfidir orqa miya sekin, asta-sekin, progressiv zaiflik va spastiklik oyoqlarning (qattiqligi). Dastlabki alomatlar muvozanat, oyoqlarda zaiflik va qattiqlik bilan bog'liq qiyinchiliklarni o'z ichiga olishi mumkin, mushaklarning spazmlari, va yurish paytida oyoq barmoqlarini sudrab. Buzilishning ba'zi shakllarida, siydik pufagi alomatlar paydo bo'lishi mumkin (masalan, tutmaslik) yoki zaiflik va qattiqlik tananing boshqa qismlariga tarqalishi mumkin. Progressiya darajasi va simptomlarning og'irligi juda o'zgaruvchan.[23]

Ushbu genning mutatsiyasiga bog'liq bo'lgan yana bir kasallik infantil neyroaksonal distrofiya.

O'zaro aloqalar

PLA2G6 borligi ko'rsatilgan Protein-oqsilning o'zaro ta'siri quyidagilar bilan.[24][9]

Adabiyotlar

  1. ^ a b v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000184381 - Ansambl, 2017 yil may
  2. ^ a b v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000042632 - Ansambl, 2017 yil may
  3. ^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  4. ^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
  5. ^ a b v Larsson PK, Kesson HE, Kennedi BP (Yanvar 1998). "Insonning kaltsiyga bog'liq bo'lmagan A2 fosfolipazasining qo'shilishning bir nechta variantlari va ularning fermentlar faolligiga ta'siri". Biologik kimyo jurnali. 273 (1): 207–14. doi:10.1074 / jbc.273.1.207. PMID  9417066.
  6. ^ Uilson PA, Gardner SD, Lambie NM, Commans SA, Crowther DJ (2006 yil sentyabr). "Inson patatiniga o'xshash fosfolipaza oilasining xarakteristikasi". Lipid tadqiqotlari jurnali. 47 (9): 1940–9. doi:10.1194 / jlr.M600185-JLR200. PMID  16799181.
  7. ^ Kienesberger kompyuter, Oberer M, Lass A, Zechner R (2009 yil aprel). "Oqsillarni o'z ichiga olgan sutemizuvchilardan patatinli domen: turli xil biologik funktsiyalarga aloqador turli xil lipolitik faolliklarga ega oila". Lipid tadqiqotlari jurnali. 50 ta qo'shimcha: S63-8. doi:10.1194 / jlr.R800082-JLR200. PMC  2674697. PMID  19029121.
  8. ^ a b v d e "Entrez Gen: PLA2G6 fosfolipaza A2, VI guruh (sitosolik, kaltsiydan mustaqil)". Ushbu maqola ushbu manbadagi matnni o'z ichiga oladi jamoat mulki.
  9. ^ a b v d e f g h men "PLA2G6 - 85/88 kDa kaltsiyga bog'liq bo'lmagan fosfolipaza A2 - Homo sapiens (Inson) - PLA2G6 geni va oqsili". Olingan 2018-08-22. Ushbu maqola o'z ichiga oladi matn ostida mavjud CC BY 4.0 litsenziya.
  10. ^ a b v d e f "UniProt: universal oqsil bilimlari bazasi". Nuklein kislotalarni tadqiq qilish. 45 (D1): D158-D169. 2017 yil yanvar. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  11. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Ximenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu XJ, Xu T, Vayss J. , Duan H, Uhlen M, Yeyts JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (oktyabr 2013). "Kardiyak proteom biologiyasi va tibbiyotini ixtisoslashgan ma'lumot bazasi bilan integratsiyasi". Sirkulyatsiya tadqiqotlari. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  12. ^ "85/88 kDa kaltsiyga bog'liq bo'lmagan fosfolipaza A2". Kardiyak organellar oqsillari atlasining bilim bazasi (COPaKB).
  13. ^ Ma Z, Vang X, Nowatzke V, Ramanadham S, Turk J (1999 yil aprel). "Inson pankreatik adacıkları, transkriptni iPLA2 genidan 22q13.1 xromosomasiga muqobil ravishda qo'shib ekzonsiz o'tish mexanizmidan kelib chiqadigan, VI guruhdagi fosfolipaza A2 (iPLA2) ning ikkita katalitik jihatdan faol izoformalarini kodlovchi mRNK turlarini ifoda etadi".. Biologik kimyo jurnali. 274 (14): 9607–16. doi:10.1074 / jbc.274.14.9607. PMC  3715997. PMID  10092647.
  14. ^ "PLA2G6". Genetika bo'yicha ma'lumot. NCBI. Ushbu maqola ushbu manbadagi matnni o'z ichiga oladi jamoat mulki.
  15. ^ Gerdin AK (2010). "Sanger Mouse Genetics Program: nokaut sichqonlarining yuqori samaradorligi". Acta Oftalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  16. ^ a b "Xalqaro sichqoncha fenotiplarini konsortsiumi".
  17. ^ Skarnes WC, Rozen B, West AP, Koutsourakis M, Bushell V, Iyer V, Mujica AO, Thomas M, Harrow J, Cox T, Jackson D, Severin J, Biggs P, Fu J, Nefedov M, de Jong PJ, Stewart AF, Bredli A (iyun 2011). "Sichqon genlari funktsiyasini genom bo'yicha o'rganish uchun shartli nokaut-resurs". Tabiat. 474 (7351): 337–42. doi:10.1038 / tabiat10163. PMC  3572410. PMID  21677750.
  18. ^ Dolgin E (iyun 2011). "Sichqoncha kutubxonasi nokautga uchradi". Tabiat. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  19. ^ Kollinz FS, Rossant J, Vurst V (yanvar 2007). "Barcha sabablarga ko'ra sichqoncha". Hujayra. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  20. ^ White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Solsbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Tannahill D , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smith I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (Iyul 2013). "Genom bo'yicha avlod yaratish va nokaut sichqonlarini muntazam ravishda fenotiplash ko'plab genlar uchun yangi rollarni ochib beradi". Hujayra. 154 (2): 452–64. doi:10.1016 / j.cell.2013.06.022. PMC  3717207. PMID  23870131.
  21. ^ a b "Infektsiya va immunitetni immunofenotiplash (3i) konsortsiumi".
  22. ^ Ozes B, Karagoz N, Schüle R, Rebelo A, Sobrido MJ, Harmut F, Synofzik M, Pascual SIP, Colak M, Ciftci-Kavaklioglu B, Kara B, Ordónez-Ugalde A, Quintáns B, Gonsales MA, Soysal A, Zuchner S, Battaloglu E (2017) PLA2G6 mutatsiyalari neyroaksonal distrofiyadan irsiy spastik paraplegiyaga qadar doimiy klinik spektr bilan bog'liq. Clin Genet 92 (5): 534-539
  23. ^ "Irsiy spastik paraplegiya". www.uniprot.org.
  24. ^ Mick DU, Dennerlein S, Wiese H, Reinhold R, Pacheu-Grau D, Lorenzi I, Sasarman F, Weraarpachai W, Shoubridge EA, Warscheid B, Rehling P (dekabr 2012). "MITRAC mitoxondriyal oqsil translokatsiyasini nafas olish zanjiri yig'ilishi va translyatsion tartibga solish bilan bog'laydi". Hujayra. 151 (7): 1528–41. doi:10.1016 / j.cell.2012.11.053. PMID  23260140.

Qo'shimcha o'qish