Aktinin alfa 1 - Actinin alpha 1

ACTN1
Mavjud tuzilmalar
PDB	Ortholog qidiruvi: PDBe RCSB
PDB id kodlari ro'yxati
	2EYI, 2EYN, 2N8Z, 2N8Y
Identifikatorlar
Taxalluslar	ACTN1, BDPLT15, aktinin alfa 1
Tashqi identifikatorlar	OMIM: 102575 MGI: 2137706 HomoloGene: 55553 Generkartalar: ACTN1
Gen joylashuvi (odam)
Chr.	Xromosoma 14 (odam)
Oxiri	68,979,440 bp
Gen joylashuvi (Sichqoncha)
Chr.	Xromosoma 12 (sichqoncha)
Oxiri	80,260,371 bp
RNK ekspressioni naqsh
	; ; ; ;
	Qo'shimcha ma'lumotni ifodalash ma'lumotlari
Gen ontologiyasi
Molekulyar funktsiya	• kaltsiy ioni bilan bog'lanish; • oqsilni homodimerizatsiya qilish faoliyati; • ion kanalini bog'lash; • vinkulin bilan bog'lanish; • metall ionlari bilan bog'lanish; • integralni bog'lash; • aktin filamentini bog'lash; • GO: 0001948 oqsil bilan bog'lanish; • ligandga bog'liq bo'lgan yadro retseptorlari transkripsiyasi koaktivatori faoliyati; • ikki zanjirli RNK bilan bog'lanish; • aktin bilan bog'lanish; • postsinapsning tarkibiy qismi;
Uyali komponent	• sitoplazma; • sitozol; • hujayra proektsiyasi; • psevdopodiya; • membrana; • hujayralararo birikma; • fokal yopishqoqlik; • chayqalish; • hujayra membranasi; • hujayra ichidagi; • stress tolasi; • hujayradan tashqari mintaqa; • hujayra birikmasi; • Z disk; • cho'tka chegarasi; • aktin filamenti; • fasya yopishadi; • hujayra tashqari ekzozoma; • sitoskelet; • trombotsitlar alfa granulasi lümeni; • sarcomere; • hujayradan tashqari; • glutamaterjik sinaps;
Biologik jarayon	• apoptotik jarayonni tartibga solish; • uyali komponentlarning harakatini salbiy tartibga solish; • aktin filament tashkiloti; • aktin filamanining shakllanishi; • trombotsitlar degranulyatsiyasi; • trombotsitlar shakllanishi; • aktin filament to'plamini yig'ish; • fokusli yopishqoqlik yig'ilishi; • aktin o'zaro bog'liqlik shakllanishi; • trombotsitlar morfogenezi; • trombotsitlar agregatsiyasi; • trombotsitlarni faollashtirish; • nuklein kislota bilan andozalangan transkripsiyani tartibga solish; • postsinaps tashkiloti; • nuklein kislota bilan shablonlangan transkripsiyaning ijobiy regulyatsiyasi;
	Manbalar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	87
	109711
	ENSG00000072110
	ENSMUSG00000015143
	P12814
	Q7TPR4
	NM_001102; NM_001130004; NM_001130005
	NM_134156; NM_001346669; NM_001379075; NM_001379076
	NP_001093; NP_001123476; NP_001123477; NP_001093.1
	NP_001333598; NP_598917; NP_001366004; NP_001366005
	Vikidata
Insonni ko'rish / tahrirlash	Sichqonchani ko'rish / tahrirlash

Alfa-aktinin-1 a oqsil odamlarda kodlanganligi ACTN1 gen.^[5]

Funktsiya

Alfa aktininlar spektrin turli xil guruhni ifodalovchi gen superfamily sitoskelet oqsillari, shu jumladan alfa va beta spektrlari va distrofinlar. Alfa aktinin - bu aktin - turli xil hujayra turlarida bir nechta rol o'ynaydigan oqsil. Mushaksiz hujayralarda sitoskeletal izoform birga joylashgan mikrofilament to'plamlar va adherens tipidagi birikmalar, bu erda membranani aktin bilan bog'lashda ishtirok etadi. Aksincha, skelet, yurak va silliq mushaklarning izoformalari Z-disk va shunga o'xshash zich jismlar, ular miyofibrillyar aktin filamentlarini o'rnatishga yordam beradi. Ushbu gen mushak bo'lmagan, sitoskeletal, alfa aktinin izoformini kodlaydi va strukturasiga o'xshash eritroid beta-spektrin geni bilan bir xil joyga xaritalar.^[6]

O'zaro aloqalar

Aktinin, alfa 1 ga ko'rsatildi o'zaro ta'sir qilish bilan:

Shuningdek qarang

Aktinin

Adabiyotlar

^ ^a ^b ^v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000072110 - Ansambl, 2017 yil may
^ ^a ^b ^v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000015143 - Ansambl, 2017 yil may
^ "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.
^ Youssoufian H, McAfee M, Kwiatkowski DJ (Iyul 1990). "Inson sitoskeletal alfa-aktinining genini klonlash va xromosomal lokalizatsiyasi beta-spektrin geni bilan bog'liqligini aniqlaydi". Am J Hum Genet. 47 (1): 62–72. PMC 1683765. PMID 2349951.
^ "Entrez Gen: ACTN1 aktinin, alfa 1".
^ ^a ^b Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsay LH (sentyabr 2002). "Siklinga bog'liq kinaz 5 p35 va p39 aktivatorlari Ca2 + / kalmodulinga bog'liq protein kinaz II va alfa-aktinin-1 ning alfa-bo'linmasi bilan o'zaro ta'sir qiladi". J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. PMC 6758084. PMID 12223541.
^ Gonsales AM, Otey C, Edlund M, Jones JC (dekabr 2001). "Gemidesmosoma komponenti va aktinining oila a'zolarining o'zaro ta'siri". J. Cell Sci. 114 (Pt 23): 4197-206. PMID 11739652.
^ Bunn RC, Jensen MA, Rid BC (aprel 1999). "GLUT1 va sitoskeleton o'rtasida bog'lanishni ta'minlaydigan glyukoza tashuvchisi bilan bog'langan oqsil GLUT1CBP bilan oqsillarning o'zaro ta'siri". Mol. Biol. Hujayra. 10 (4): 819–32. doi:10.1091 / mbc.10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.
^ Vallenius T, Luukko K, Mäkelä TP (aprel 2000). "CLP-36 PDZ-LIM oqsillari mushak bo'lmagan alfa-aktinin-1 va alfa-aktinin-4 bilan bog'lanadi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (15): 11100–5. doi:10.1074 / jbc.275.15.11100. PMID 10753915.
^ Bauer K, Kratzer M, Otte M, de Kintana KL, Xagmann J, Arnold GJ, Ekkerskorn S, Lottspeich F, Siess V (dekabr 2000). "PDZ-domeni va LIM-domeni oqsili bo'lgan inson CLP36 alfa-aktinin-1 bilan bog'lanib, faol trombotsitlar va endotelial hujayralardagi aktin iplari va stress tolalari bilan bog'lanadi". Qon. 96 (13): 4236–45. PMID 11110697.
^ Feng S, Reséndiz JC, Christodoulides N, Lu X, Arboleda D, Berndt MC, Kroll MH (yanvar 2002). "Patologik qirqish stressi glikoprotein Ib-IX kompleksi bilan bog'liq bo'lgan alfa-aktininning tirozin fosforillanishini rag'batlantiradi". Biokimyo. 41 (4): 1100–8. doi:10.1021 / bi0156005. PMID 11802708.
^ Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda V, Takeuchi M, Takai Y (fevral 2003). "ADIP, hujayra hujayra yopishqoq birikmalarida lokalize qilingan afadin va alfa-aktininni bog'laydigan yangi protein". J. Biol. Kimyoviy. 278 (6): 4103–11. doi:10.1074 / jbc.M209832200. PMID 12446711.
^ Reinhard M, Zumbrunn J, Jakuemar D, Kann M, Valter U, Trueb B (may 1999). "Ziksinning alfa-aktinin bilan bog'lanish joyi subksular hujayra ziksinini lokalizatsiya qilish va alfa-aktininni yollash uchun juda muhimdir". J. Biol. Kimyoviy. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.
^ Li B, Trueb B (2001 yil sentyabr). "Alfa-aktinin / ziksin o'zaro ta'sirini tahlil qilish". J. Biol. Kimyoviy. 276 (36): 33328–35. doi:10.1074 / jbc.M100789200. PMID 11423549.
^ Besco JA, Hooft van Huijsduijnen R, Frostholm A, Rotter A (2006). "Tirozin fosfataza rho (RPTPrho / PTPRT) miya bilan boyitilgan retseptorlari oqsilining hujayra ichidagi substratlari". Brain Res. 1116 (1): 50–7. doi:10.1016 / j.brainres.2006.07.122. PMID 16973135.

Qo'shimcha o'qish

Snásel J, Pichová I (1997). "OIV-1 proteaz bilan mezbon hujayralar oqsillarini parchalanishi". Folia Biol. (Praha). 42 (5): 227–30. doi:10.1007 / BF02818986. PMID 8997639.
Menko S, Philp N, Veneziale B, Walker J (1998). "Integrinlar va rivojlanish: ushbu retseptorlar ob'ektivning differentsiatsiyasini qanday tartibga solishi mumkin". Ann. N. Yad. Ilmiy ish. 842: 36–41. doi:10.1111 / j.1749-6632.1998.tb09629.x. PMID 9599291.
Yürüker B, Niggli V (1992). "Inson neytrofillaridagi alfa-aktinin va vinkulin: yopishish paytida qayta tashkil etish va aktin tarmog'iga bog'liqlik". J. Cell Sci. 101 (2): 403–14. PMID 1629252.
Tokuue Y, Goto S, Imamura M va boshq. (1992). "Tovuq skelet mushaklari alfa-aktinin cDNA ning mushak va miogen hujayralarga o'tkazilishi: dimerizatsiya alfa-aktininning mikrofilamentlar bilan birikishi uchun muhim emas". Muddati Hujayra rez. 197 (2): 158–67. doi:10.1016 / 0014-4827 (91) 90418-T. PMID 1720388.
Shoeman RL, Kesselmier C, Mothes E va boshq. (1991). "Inson immunitet tanqisligi virusi 1-turdagi proteaza uchun virusli bo'lmagan hujayra substratlari". FEBS Lett. 278 (2): 199–203. doi:10.1016 / 0014-5793 (91) 80116-K. PMID 1991513.
Nishiyama M, Ozturk M, Frohlich M va boshq. (1990). "Inson gepatotsellular karsinomasida odam alfa-aktinin ekspressioni". Saraton kasalligi. 50 (19): 6291–4. PMID 2169343.
Millake DB, Blanchard AD, Patel B, Critchley DR (1989). "Inson platsenta alfa-aktininning cDNA ketma-ketligi". Nuklein kislotalari rez. 17 (16): 6725. doi:10.1093 / nar / 17.16.6725. PMC 318366. PMID 2780298.
Dyubernard V, Faucher D, Launay JM, Legrand C (1995). "Trombotsitlar bilan bog'lovchi oqsil sifatida alfa-aktininning sitoskeletal oqsilini aniqlash". FEBS Lett. 364 (2): 109–14. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00362-D. PMID 7750553.
Knudsen KA, Soler AP, Jonson KR, Wheelock MJ (1995). "Alfa-aktininning alfa-katenin orqali kaderin / katenin hujayralari hujayralari yopishqoqligi kompleksi bilan o'zaro ta'siri". J. Hujayra Biol. 130 (1): 67–77. doi:10.1083 / jcb.130.1.67. PMC 2120515. PMID 7790378.
Glyuk U, Ben-Zeev A (1995). "Alfa-aktinin darajasining modulyatsiyasi hujayraning harakatlanishiga ta'sir qiladi va 3T3 hujayralardagi o'simogenlikni keltirib chiqaradi". J. Cell Sci. 107 (7): 1773–82. PMID 7983147.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-kepka: eukaryotik mRNAlarning kepka tuzilishini oligoribonukleotidlar bilan almashtirishning oddiy usuli". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Egerton M, Moritz RL, Druker B va boshq. (1996). "Tk limfotsitlarida yangi fosfotirozin o'z ichiga olgan oqsillar sifatida 70kD issiqlik zarbasi bilan aloqador oqsil (Hsc70) va alfa-aktinin-1ni aniqlash". Biokimyo. Biofiz. Res. Kommunal. 224 (3): 666–74. doi:10.1006 / bbrc.1996.1082. PMID 8713105.
Mukai H, Toshimori M, Shibata H va boshqalar. (1997). "PKN ning alfa-aktinin bilan o'zaro ta'siri". J. Biol. Kimyoviy. 272 (8): 4740–6. doi:10.1074 / jbc.272.8.4740. PMID 9030526.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagava K, Maruyama K va boshq. (1997). "To'liq boyitilgan va 5'darajali boyitilgan cDNA kutubxonasini qurish va tavsifi". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Hazan RB, Norton L (1998). "Epidermal o'sish faktori retseptorlari E-kaderinning aktin sitoskeleton bilan o'zaro ta'sirini modulyatsiya qiladi". J. Biol. Kimyoviy. 273 (15): 9078–84. doi:10.1074 / jbc.273.15.9078. PMID 9535896.
Bunn RC, Jensen MA, Rid BC (1999). "GLUT1 va sitoskeleton o'rtasida bog'lanishni ta'minlaydigan glyukoza tashuvchisi bilan bog'langan oqsil GLUT1CBP bilan oqsillarning o'zaro ta'siri". Mol. Biol. Hujayra. 10 (4): 819–32. doi:10.1091 / mbc.10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.
Reinhard M, Zumbrunn J, Jakuemar D va boshq. (1999). "Ziksinning alfa-aktinin bilan bog'lanish joyi subksular hujayra ziksinini lokalizatsiya qilish va alfa-aktininni yollash uchun juda muhimdir". J. Biol. Kimyoviy. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.

Tashqi havolalar

Aktinin, alfa 1 Da havolalari bo'lgan ma'lumot Uyali migratsiya shlyuzi
Inson ACTN1 genom joylashuvi va ACTN1 gen tafsilotlari sahifasida UCSC Genome brauzeri.

[refGRCh38Ensembl-1] v GRCh38: Ensembl relizi 89: ENSG00000072110 - Ansambl, 2017 yil may

[refGRCm38Ensembl-2] v GRCm38: Ensembl relizi 89: ENSMUSG00000015143 - Ansambl, 2017 yil may

[3] "Human PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[4] "Sichqoncha PubMed ma'lumotnomasi:". Milliy Biotexnologiya Axborot Markazi, AQSh Milliy Tibbiyot Kutubxonasi.

[pmid2349951-5] Youssoufian H, McAfee M, Kwiatkowski DJ (Iyul 1990). "Inson sitoskeletal alfa-aktinining genini klonlash va xromosomal lokalizatsiyasi beta-spektrin geni bilan bog'liqligini aniqlaydi". Am J Hum Genet. 47 (1): 62–72. PMC 1683765. PMID 2349951.

[6] "Entrez Gen: ACTN1 aktinin, alfa 1".

[pmid12223541-7] Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsay LH (sentyabr 2002). "Siklinga bog'liq kinaz 5 p35 va p39 aktivatorlari Ca2 + / kalmodulinga bog'liq protein kinaz II va alfa-aktinin-1 ning alfa-bo'linmasi bilan o'zaro ta'sir qiladi". J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. PMC 6758084. PMID 12223541.

[pmid11739652-8] Gonsales AM, Otey C, Edlund M, Jones JC (dekabr 2001). "Gemidesmosoma komponenti va aktinining oila a'zolarining o'zaro ta'siri". J. Cell Sci. 114 (Pt 23): 4197-206. PMID 11739652.

[pmid10198040-9] Bunn RC, Jensen MA, Rid BC (aprel 1999). "GLUT1 va sitoskeleton o'rtasida bog'lanishni ta'minlaydigan glyukoza tashuvchisi bilan bog'langan oqsil GLUT1CBP bilan oqsillarning o'zaro ta'siri". Mol. Biol. Hujayra. 10 (4): 819–32. doi:10.1091 / mbc.10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.

[pmid10753915-10] Vallenius T, Luukko K, Mäkelä TP (aprel 2000). "CLP-36 PDZ-LIM oqsillari mushak bo'lmagan alfa-aktinin-1 va alfa-aktinin-4 bilan bog'lanadi". J. Biol. Kimyoviy. 275 (15): 11100–5. doi:10.1074 / jbc.275.15.11100. PMID 10753915.

[pmid11110697-11] Bauer K, Kratzer M, Otte M, de Kintana KL, Xagmann J, Arnold GJ, Ekkerskorn S, Lottspeich F, Siess V (dekabr 2000). "PDZ-domeni va LIM-domeni oqsili bo'lgan inson CLP36 alfa-aktinin-1 bilan bog'lanib, faol trombotsitlar va endotelial hujayralardagi aktin iplari va stress tolalari bilan bog'lanadi". Qon. 96 (13): 4236–45. PMID 11110697.

[pmid11802708-12] Feng S, Reséndiz JC, Christodoulides N, Lu X, Arboleda D, Berndt MC, Kroll MH (yanvar 2002). "Patologik qirqish stressi glikoprotein Ib-IX kompleksi bilan bog'liq bo'lgan alfa-aktininning tirozin fosforillanishini rag'batlantiradi". Biokimyo. 41 (4): 1100–8. doi:10.1021 / bi0156005. PMID 11802708.

[pmid12446711-13] Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda V, Takeuchi M, Takai Y (fevral 2003). "ADIP, hujayra hujayra yopishqoq birikmalarida lokalize qilingan afadin va alfa-aktininni bog'laydigan yangi protein". J. Biol. Kimyoviy. 278 (6): 4103–11. doi:10.1074 / jbc.M209832200. PMID 12446711.

[pmid10224105-14] Reinhard M, Zumbrunn J, Jakuemar D, Kann M, Valter U, Trueb B (may 1999). "Ziksinning alfa-aktinin bilan bog'lanish joyi subksular hujayra ziksinini lokalizatsiya qilish va alfa-aktininni yollash uchun juda muhimdir". J. Biol. Kimyoviy. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.

[pmid11423549-15] Li B, Trueb B (2001 yil sentyabr). "Alfa-aktinin / ziksin o'zaro ta'sirini tahlil qilish". J. Biol. Kimyoviy. 276 (36): 33328–35. doi:10.1074 / jbc.M100789200. PMID 11423549.

[pmid16973135-16] Besco JA, Hooft van Huijsduijnen R, Frostholm A, Rotter A (2006). "Tirozin fosfataza rho (RPTPrho / PTPRT) miya bilan boyitilgan retseptorlari oqsilining hujayra ichidagi substratlari". Brain Res. 1116 (1): 50–7. doi:10.1016 / j.brainres.2006.07.122. PMID 16973135.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]