Tartiblangan protist genomlari ro'yxati - List of sequenced protist genomes - Wikipedia
Bu ketma-ket protist genomlari ro'yxati tarkibida barcha mavjud protist yig'ilgan, izohlangan va nashr etilgan genomning to'liq genomik qatorlariga ega bo'lganligi ma'lum bo'lgan turlari; qoralama genomlari, faqat organellar ketma-ketligi kiritilmagan.
Alveolata
Alveolata o'z ichiga olgan protistlar guruhidir Ciliophora, Apikompleksa va Dinoflagellata. Ushbu guruh a'zolari odamlarni va chorvachilikni jiddiy kasalliklari sababi sifatida fanga alohida qiziqish bildirmoqdalar.
| Organizm | Turi | Dolzarbligi | Genom hajmi | Bashorat qilingan genlar soni | Tashkilot | Tugatish yili | Majlis holati | Havolalar |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Babesia bovis | Apikomplexan | Qoramol qo'zg'atuvchisi | 8.2 Mb | 3,671 | 2007[1] | |||
| Breviolum minutim (Simbiyodiniy minutum; qoplama B1) | Dinoflagellat | Mercan simbionti | 1,5 Gb | 47,014 | Okinava Fan va Texnologiya Instituti | 2013[2] | Qoralama | OIST dengiz genomikasi[3] |
| Kladokopium goreaui (Simbiyodiniy goreaui; C1) | Dinoflagellat | Mercan simbionti | 1.19 Gb | 35,913 | Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / Kvinslend universiteti | 2018[4] | Qoralama | ReFuGe 2020[5] |
| Kladokopiya C92 shtamm Y103 (Simbiyodiniy sp. qoplama C; taxminiy C92 turi) | Dinoflagellat | Foraminiferan simbionti | Noma'lum (yig'ish hajmi 0,70 Gb) | 65,832 | Okinava Fan va Texnologiya Instituti | 2018[6] | Qoralama | OIST dengiz genomikasi[3] |
| Cryptosporidium hominis Kuchlanish: TU502 | Apikomplexan | Inson patogen | 10.4 Mb | 3,994[7] | Virjiniya Hamdo'stlik universiteti | 2004[7] | ||
| Cryptosporidium parvum C- yoki genotip 2 ajratib turadi | Apikomplexan | Inson patogen | 16,5 Mb | 3,807[8] | UCSF va Minnesota universiteti | 2004[8] | ||
| Eimeria tenella Houghton shtammlari | Apikomplexan | Uy parrandalarining ichak paraziti | 55-60 Mb[9] | Wellcome Trust Sanger instituti[10] | Yuklab olish uchun mavjud;[10] Chr 1 uchun 2007 yil[11] | |||
| Fugacium kawagutii CS156 = CCMP2468 (Simbiyodiniy kawagutii; qopqoq F1) | Dinoflagellat | Marjon simbionmi? | 1,07 Gb | 26,609 | Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / Kvinslend universiteti | 2018[4] | Qoralama | ReFuGe 2020[5] |
| Fugacium kawagutii CCMP2468 (Simbiyodiniy kawagutii; qopqoq F1) | Dinoflagellat | Marjon simbionmi? | 1,18 Gb | 36,850 | Konnektikut universiteti / Xiamen universiteti | 2015[12] | Qoralama | S. kawagutii genom loyihasi[13] |
| Neospora caninum | Apikomplexan | Qoramol va itlar uchun patogen | 62 Mb[14] | Wellcome Trust Sanger instituti[15] | Yuklab olish uchun mavjud[15] | |||
| Paramecium tetraurelia | Siliat | Namunaviy organizm | 72 Mb | 39,642[16] | Genoskop | 2006[16] | ||
| Polarella glacialis CCMP1383 | Dinoflagellat | Psixrofil, Antarktika | 3,02 Gb (diploid), 1,48 Gbp (gaploid) | 58,232 | Kvinslend universiteti | 2020[17] | Qoralama | UQ eSpace[18] |
| Polarella glacialis CCMP2088 | Dinoflagellat | Psixrofil, Arktika | 2,65 Gb (diploid), 1,30 Gbp (gaploid) | 51,713 | Kvinslend universiteti | 2020[17] | Qoralama | UQ eSpace[18] |
| Plazmodium bergey Kuchlanish: Anka | Apikomplexan | Quyon bezgagi | 18,5 Mb[19] | 4,900;[19] 11,654 (UniProt) | ||||
| Plazmodium chabaudi | Apikomplexan | Kemiruvchilar bezgagi | 19,8 Mb[20] | 5,000[20] | ||||
| Plazmodium falciparum Klon: 3D7 | Apikomplexan | Inson qo'zg'atuvchisi (bezgak ) | 22.9 Mb | 5,268[21] | Bezgak genomlari loyihasi konsortsiumi | 2002[21] | ||
| Plazmodium bilimlari | Apikomplexan | Asosiy patogen (bezgak) | 23,5 Mb | 5,188[22] | 2008[22] | |||
| Plazmodium vivax | Apikomplexan | Inson qo'zg'atuvchisi (bezgak) | 26.8 Mb | 5,433[23] | 2008[23] | |||
| Plazmodium yoelii yoelii Kuchlanish: 17XNL | Apikomplexan | Kemiruvchi patogen (bezgak) | 23.1 Mb | 5,878[24] | TIGR va NMRC | 2002[24] | ||
| Simbiyodiniy mikroadriatikum (A klapani) | Dinoflagellat | Mercan simbionti | 1,1 Gb | 49,109 | Qirol Abdulla nomidagi Fan va Texnologiya Universiteti | 2016[25] | Qoralama | Rif Genomikasi[26] |
| Simbiyodiniy A3 shtamm Y106 (Simbiyodiniy sp. A3 qopqoq) | Dinoflagellat | simbiont | Noma'lum (yig'ilish hajmi 0,77 Gb) | 69,018 | Okinava Fan va Texnologiya Instituti | 2018[6] | Qoralama | OIST dengiz genomikasi[3] |
| Tetrahimena termofilasi | Siliat | Namunaviy organizm | 104 Mb | 27,000[27] | 2006[27] | |||
| Theileria annulata Anqara C9 kloni | Apikomplexan | Qoramol qo'zg'atuvchisi | 8.3 Mb | 3,792 | Sanger | 2005[28] | ||
| Theileria parva Kuchlanish: Muguga | Apikomplexan | Qoramol qo'zg'atuvchisi (Afrikaning sharqiy sohilidagi isitma ) | 8.3 Mb | 4,035[29] | TIGR va Xalqaro chorvachilik ilmiy-tadqiqot instituti | 2005[29] | ||
| Toxoplasma gondii GT1, ME49, VEG shtammlari | Apikomplexan | Sutemizuvchilar qo'zg'atuvchisi | 63 Mb (RefSeq) | 8100 (UniProt) - 9000 (EuPathDB) | J. Kreyg Venter Inst., TIGR, UPenn. | 2008[30] |
Amebozoa
Amebozoa harakatlanuvchi guruhdir ameboid protistlar, ushbu guruh a'zolari chaqirilgan vaqtinchalik proektsiyalar yordamida harakat qiladilar yoki ovqatlanadilar psevdopodlar. Ushbu guruhning eng taniqli a'zosi shilimshiq mog'or asrlar davomida o'rganilgan; boshqa a'zolarga Archamoebae, Tubulinea va Flabellinea. Ba'zi Amoeboza kasalliklarga olib keladi.
| Organizm | Turi | Dolzarbligi | Genom hajmi | Bashorat qilingan genlar soni | Tashkilot | Tugatish yili |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Dictyostelium discoideum Kuchlanish: AX4 | Shilliq mog'or | Namunaviy organizm | 34 Mb | 12,500[31] | Köln universiteti, Baylor tibbiyot kolleji va Sanger markazining konsortsiumi | 2005[31] |
| Entamoeba histolytica HM1: IMSS | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (amebik dizenteriya ) | 23,8 Mb | 9,938[32] | TIGR, Sanger instituti va London gigiena va tropik tibbiyot maktabi | 2005[32] |
| Polysphondylium pallidum Kuchlanish: PN500 | Shilliq mog'or | Namunaviy organizm | 12,939,[33] 12,350 (UniProt) | Leybnits yoshni o'rganish instituti | 2009[33] |
Chromista
The Chromista gidroksidi filasini o'z ichiga olgan protistlar guruhidir Heterokontofit (stramenopillar ), Haptophyta va Kriptofit. Ushbu guruh a'zolari asosan evolyutsion qiziqish uchun o'rganiladi.
| Organizm | Turi | Dolzarbligi | Genom hajmi | Bashorat qilingan genlar soni | Tashkilot | Tugatish yili |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Albugo laibachii | Oomitset | Arabidopsis paraziti, biotrof | 37 Mb[34] | 13,032[34] | 2011[34] | |
| Aureococcus anophagefferens Kuchlanish: CCMP1984 | Pelagofit | DOE qo'shma genom instituti | 2011[35] | |||
| Bigelowiella natans | Xloraraxniofit | Namunaviy organizm | nukleomorf: 0.331 Mb yadro: 95 Mb | nukleomorf: 373[36] yadro:> 21,000[37] | nukleomorf: Hall instituti Avstraliya, Univ. Melburn, Univ. Miloddan avvalgi yadro: Dalhousie universiteti, Galifaks, Yangi Shotlandiya, Kanada | 2006,[36] 2012[37] |
| Chroomonas mezostigmatika CCMP1168 | Kriptofit | 2012[38] | ||||
| Kriptomonalar parametsium | Kriptofit | 2010[39] | ||||
| Emiliania huxleyi CCMP1516 | Kokkolitofora (fitoplankton ) | 141.7 Mb[40] | 30,569[40] | Qo'shma Genom instituti | 2013[40] | |
| Emiliania huxleyi RCC1217 | Kokkolitofora (fitoplankton ) | Yuklab olish uchun mavjud[41] | ||||
| Fragilariopsis silindr | Diatom | 61.1 Mb[42] | 21,066[42] | Qo'shma Genom instituti | 2017[42] | |
| Guillardia teta | Kriptomonad | Namunaviy organizm | 0.551 Mb (nukleomorf faqat genom) 87 Mb (yadro genomi) | nukleomorf: 465[43] 513, 598 (UniProt) yadro:> 21,000[37] | nukleomorf: Kanadaning Ilg'or tadqiqotlar instituti, Filipplar universiteti Marburg va Britaniya Kolumbiyasi universiteti yadro: Dalhousie universiteti, Galifaks, Yangi Shotlandiya, Kanada | 2001,[43] 2012[37] |
| Hemiselmis andersenii CCMP7644 | Kriptomonad | Namunaviy organizm | 0.572 Mb (nukleomorf faqat genom) | 472,[44] 502 (UniProt) | Kanada ilg'or tadqiqotlar instituti | 2007[44] |
| Hyaloperonospora arabidopsidis | Oomitset | majburiy biotrof, Arabidopsis patogen | WUGSC | 2010[45] | ||
| Nanxloropis gaditana Kuchlanish: CCMP526 | Eustigmatofit | Lipit ishlab chiqaruvchi, biotexnologiyalar | Virjiniya bioinformatika instituti | 2012[46] | ||
| Phaeodactylum tricornutum Kuchlanish: CCAP1055 / 1 | Diatom | 27.4 Mb | 10,402 | Qo'shma Genom instituti | 2008[47] | |
| Fitoftora infestansi Kuchlanish: T30-4 | Oomitset | Irlandiyaning katta ochligi patogen | Keng institut | 2009[48] | ||
| Phytophthora ramorum | Oomitset | Emanning to'satdan o'lishi patogen | 65 Mb (7x) | 15,743 | Qo'shma Genom instituti va boshq. | 2006[49] |
| Phytophthora sojae | Oomitset | Soya patogen | 95 Mb (9x) | 19,027 | Qo'shma Genom instituti va boshq. | 2006[49] |
| Pseudo-nitzschia multiseries | Diatom | Qo'shma Genom instituti | ||||
| Plasmodiophora brassicae | Plazmodioforid | Clubroot kasalligi patogen | 25,5 Mb | 9,730 | SLU Uppsala va boshq. | 2015[50] |
| Pythium ultimate | Oomitset | hamma joyda tarqalgan o'simlik qo'zg'atuvchisi | 42,8 Mb | 15,290 | Michigan shtati universiteti va boshq. | 2010[51] |
| Talassiosira pseudonana Kuchlanish: CCMP 1335 | Diatom | 34,5 Mb | 11,242[52] | Qo'shma Genom instituti va Vashington universiteti | 2004[52] |
Ekskavata
Ekskavata bog'liq erkin hayot va simbiotik protistlar guruhidir; u o'z ichiga oladi Metamonada, Loukozoa, Evglenozoa va Perkolozoa. Ular inson kasalliklarida ularning roli uchun o'rganiladi.
| Organizm | Turi | Dolzarbligi | Genom hajmi | Bashorat qilingan genlar soni | Tashkilot | Tugatish yili |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Giardia enterica (G. duodenalis yig'ilishi B) | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (Giardiasis ) | 11.7 Mb | 4,470[53] | ko'p markazli hamkorlik | 2009[53] |
| Giardia duodenalis ATCC 50803 (Giardia duodenalis yig'ish A) | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (Giardiasis ) | 11.7 Mb | 6,470,[54] 7,153 (UniProt) | Karolinska instituti, Dengiz biologik laboratoriyasi | 2007[54] |
| Leishmania braziliensis MHOM / BR / 75M2904 | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (Leyshmanioz ) | 33 Mb | 8,314[55] | Sanger instituti, San-Paulu Universidadasi, Imperial kolleji | 2007[55] |
| Leishmania infantum JPCM5 | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (Visseral leyshmanioz ) | 33 Mb | 8,195[55] | Sanger instituti, Imperial kolleji va Glazgo universiteti | 2007[55] |
| Leyshmaniya mayor Kuchlanish: Fridlin | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (Teri leyshmaniozi ) | 32,8 Mb | 8,272[56] | Sanger instituti va Sietl biomedikal tadqiqot instituti | 2005[56] |
| Naegleria gruberi | amoefoflagellat | 1 milliard yil oldin boshqa eukaryotlardan ajralib chiqqan | 41 Mb[57] | 15,727[57] | 2010[57] | |
| Trichomonas vaginalis | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (Trichomoniasis ) | 160 Mb | 59,681[58] | TIGR | 2007[58] |
| Trypanosoma brucei Kuchlanish: TREU927 / 4 GUTat10.1 | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (Uyqu kasalligi ) | 26 Mb | 9,068[59] | Sanger instituti va TIGR | 2005[59] |
| Trypanosoma cruzi Kuchlanish: CL Brener TC3 | Parazit protozoan | Inson qo'zg'atuvchisi (Chagas kasalligi ) | 34 Mb | 22,570[60] | TIGR, Sietl biomedikal tadqiqot instituti va Uppsala universiteti | 2005[60] |
Opisthokonts, bazal
Opisthokonts ikkalasini ham o'z ichiga olgan ökaryotlar guruhi hayvonlar va qo'ziqorinlar shuningdek, ushbu guruhlarda tasniflanmagan bazal guruhlar. Ushbu bazal opistokontslar oqilona protistlar toifasiga kiritilgan va quyidagilarni o'z ichiga oladi xanoflagellatlar, bu hayvonlarning singlisi yoki singlisi singlisi.
| Organizm | Turi | Dolzarbligi | Genom hajmi | Bashorat qilingan genlar soni | Tashkilot | Tugatish yili |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Monosiga brevicollis | Choanoflagellat | metazoanlarning yaqin qarindoshi | 41.6 Mb | 9,200[61] | Qo'shma Genom instituti | 2007[61] |
Shuningdek qarang
- Tizimli bakterial genomlar ro'yxati
- Hayvonlarning ketma-ket genomlari ro'yxati
- Tartibga qo'yilgan ökaryotik genomlar ro'yxati
- Qatorli zamburug'lar genomlari ro'yxati
- Tartiblangan o'simlik genomlari ro'yxati
- Yosunlarning ketma-ket genomlari ro'yxati
Adabiyotlar
- ^ Brayton KA, Lau AO, Xerndon DR, Xannik L, Kappmeyer LS, Berens SJ va boshq. (2007 yil oktyabr). "Babesia bovisning genom ketma-ketligi va apikompleksan gemoprotozoaning qiyosiy tahlili". PLOS patogenlari. 3 (10): 1401–13. doi:10.1371 / journal.ppat.0030148. PMC 2034396. PMID 17953480.
- ^ Shoguchi E, Shinzato C, Kawashima T, Gyoja F, Mungpakdee S, Koyanagi R va boshq. (2013 yil avgust). "Symbiodinium minutum yadro genomini yig'ish loyihasi dinoflagellat gen tuzilishini ochib beradi". Hozirgi biologiya. 23 (15): 1399–408. doi:10.1016 / j.cub.2013.05.062. PMID 23850284.
- ^ a b v "OIST dengiz genomikasi". marinegenomics.oist.jp. Olingan 2018-08-22.
- ^ a b Liu H, Stefens TG, Gonsales-Pech RA, Beltran VH, Lapeyre B, Bongaerts P va boshq. (2018). "Symbiodinium genomlari marjon-dinoflagellat simbiyoziga bog'liq funktsiyalarning adaptiv evolyutsiyasini ochib beradi". Aloqa biologiyasi. 1: 95. doi:10.1038 / s42003-018-0098-3. PMC 6123633. PMID 30271976.
- ^ a b "ReFuGe 2020 ma'lumotlar sayti". boshpana2020.reefgenomics.org. Olingan 2018-09-07.
- ^ a b Shoguchi E, Beedessee G, Tada I, Hisata K, Kavashima T, Takeuchi T va boshq. (Iyun 2018). "Ikki xilma-xil bo'lgan Symbiodinium genomlari quyosh nurlaridan himoya qiluvchi biosintez va yaqinda yo'qolgan genlar uchun gen klasterining saqlanishini aniqlaydi". BMC Genomics. 19 (1): 458. doi:10.1186 / s12864-018-4857-9. PMC 6001144. PMID 29898658.
- ^ a b Xu P, Vidmer G, Vang Y, Ozaki LS, Alves JM, Serrano MG va boshq. (2004 yil oktyabr). "Cryptosporidium hominis genomi". Tabiat. 431 (7012): 1107–12. Bibcode:2004 yil natur.431.1107X. doi:10.1038 / tabiat02977. PMID 15510150.
- ^ a b Abrahamsen MS, Templeton TJ, Enomoto S, Abrahante JE, Zhu G, Lancto CA va boshq. (2004 yil aprel). "Apikomplexanning to'liq genom ketma-ketligi, Cryptosporidium parvum". Ilm-fan. 304 (5669): 441–5. Bibcode:2004 yil ... 304..441A. doi:10.1126 / science.1094786. PMID 15044751. S2CID 26434820.
- ^ genedb
- ^ a b Sanger
- ^ Ling KH, Rajandream MA, Rivailler P, Ivens A, Yap SJ, Madeira AM va boshq. (2007 yil mart). "Eimeria tenella 1-xromosomasining ketma-ketligi va tahlili noyob segmental tashkilotni ochib beradi". Genom tadqiqotlari. 17 (3): 311–9. doi:10.1101 / gr.5823007. PMC 1800922. PMID 17284678.
- ^ Lin S, Cheng S, Song B, Zhong X, Lin X, Li V va boshqalar. (Noyabr 2015). "Symbiodinium kawagutii genomi dinoflagellat geni ekspressioni va mercan simbiyozini yoritadi". Ilm-fan. 350 (6261): 691–4. Bibcode:2015 yil ... 350..691L. doi:10.1126 / science.aad0408. PMID 26542574.
- ^ "S. kawagutii ma'lumotlar sayti ". web.malab.cn/symka_new. Olingan 2018-08-22.
- ^ genedb
- ^ a b Sanger
- ^ a b Aury JM, Jaillon O, Duret L, Noel B, Jubin C, Porcel BM va boshq. (2006 yil noyabr). "Paramecium tetraurelia siliati tomonidan aniqlangan butun genom nusxalarining global tendentsiyalari". Tabiat. 444 (7116): 171–8. Bibcode:2006 yil Noyabr 444 ... 171A. doi:10.1038 / nature05230. PMID 17086204.
- ^ a b Stefens TG, Gonsales-Pech RA, Cheng Y, Mohamed AR, Burt DW, Battacharya D va boshq. (2020). "Dinoflagellatning genomlari Polarella glacialis tandemli takrorlangan bitta ekzonli genlarni adaptiv funktsiyalar bilan kodlash ". BMC biologiyasi. 18 (1): 56. doi:10.1186 / s12915-020-00782-8. PMC 7245778. PMID 32448240.
- ^ a b Stivenlar, Timo'tiy; Ragan, Mark; Battacharya, Debashish; Chan, Cheong Xin (2020). "Polarella ma'lumotlar sayti ". doi:10.14264 / uql.2020.222. Iqtibos jurnali talab qiladi
| jurnal =(Yordam bering) - ^ a b Ansamblga kirish
- ^ a b Ansamblga kirish
- ^ a b Gardner MJ, Hall N, Fung E, White O, Berriman M, Hyman RW va boshq. (2002 yil oktyabr). "Odam bezgak parazitining genom ketma-ketligi Plasmodium falciparum". Tabiat. 419 (6906): 498–511. Bibcode:2002 yil natur.419..498G. doi:10.1038 / nature01097. PMC 3836256. PMID 12368864.
- ^ a b Pain A, Böhme U, Berry AE, Mungall K, Finn RD, Jekson AP va boshq. (Oktyabr 2008). "Simiya va odam bezgak paraziti plazmodium knowlesi genomi". Tabiat. 455 (7214): 799–803. Bibcode:2008 yil natur.455..799P. doi:10.1038 / nature07306. PMC 2656934. PMID 18843368.
- ^ a b Carlton JM, Adams JH, Silva JC, Bidwell SL, Lorenzi H, Caler E va boshq. (Oktyabr 2008). "Inson bezgak paraziti paraziti Plasmodium vivax ning qiyosiy genomikasi". Tabiat. 455 (7214): 757–63. Bibcode:2008 yil natur.455..757C. doi:10.1038 / nature07327. PMC 2651158. PMID 18843361.
- ^ a b Carlton JM, Angiuoli SV, Suh BB, Kooij TW, Pertea M, Silva JC va boshq. (2002 yil oktyabr). "Plasmodium yoelii yoelii kemiruvchi bezgak parazitining genom ketma-ketligi va modelini qiyosiy tahlil qilish". Tabiat. 419 (6906): 512–9. Bibcode:2002 yil natur.419..512C. doi:10.1038 / nature01099. PMID 12368865.
- ^ Aranda M, Li Y, Liew YJ, Baumgarten S, Simakov O, Uilson MC va boshq. (Dekabr 2016). "Coral dinoflagellat simbiontsining genomlari simbiyotik turmush tarziga mos keladigan evolyutsion moslashuvlarni ta'kidlaydi". Ilmiy ma'ruzalar. 6: 39734. Bibcode:2016 yil NatSR ... 639734A. doi:10.1038 / srep39734. PMC 5177918. PMID 28004835.
- ^ "Reef Genomics ma'lumotlar sayti". smic.reefgenomics.org. Olingan 2018-08-22.
- ^ a b Eisen JA, Coyne RS, Wu M, Wu D, Tiagarajan M, Wortman JR va boshq. (2006 yil sentyabr). "Eukaryotning modeli Tetrahymena thermophila siliatining makronukleer genom ketma-ketligi". PLOS biologiyasi. 4 (9): e286. doi:10.1371 / journal.pbio.0040286. PMC 1557398. PMID 16933976.
- ^ Pain A, Renauld H, Berriman M, Murphy L, Yeats CA, Weir V va boshq. (2005 yil iyul). "T. parva bilan taqqoslaganda xujayra o'zgaruvchan parazit Theileria annulata genomi". Ilm-fan. 309 (5731): 131–3. Bibcode:2005 yil ... 309..131P. doi:10.1126 / science.1110418. PMID 15994557.
- ^ a b Gardner MJ, Bishop R, Shoh T, de Villiers E.P., Karlton JM, Hall N va boshq. (2005 yil iyul). "Theileria parva genom ketma-ketligi, limfotsitlarni o'zgartiradigan sigir patogenasi". Ilm-fan. 309 (5731): 134–7. Bibcode:2005 yil ... 309..134G. doi:10.1126 / science.1110439. PMID 15994558.
- ^ NCBI Genom T. gondii ME49
- ^ a b Eichinger L, Pachebat JA, Glöckner G, Rajandream MA, Sucgang R, Berriman M va boshq. (2005 yil may). "Dictyostelium discoideum ijtimoiy amyobasining genomi". Tabiat. 435 (7038): 43–57. Bibcode:2005 yil Noyabr 435 ... 43E. doi:10.1038 / nature03481. PMC 1352341. PMID 15875012.
- ^ a b Loftus B, Anderson I, Devis R, Alsmark UC, Samuelson J, Amedeo P va boshq. (2005 yil fevral). "Protam paraziti Entamoeba histolytica genomi" (PDF). Tabiat. 433 (7028): 865–8. Bibcode:2005 yil Noyabr. 433..865L. doi:10.1038 / nature03291. PMID 15729342. S2CID 14231289.
- ^ a b NCBIga qo'shilish
- ^ a b v Kemen E, Gardiner A, Shults-Larsen T, Kemen AC, Balmut AL, Robert-Seilaniantz A va boshq. (2011 yil iyul). Ausubel FM (tahrir). "Arabidopsis taliananing oq zang qo'zg'atuvchisida majburiy parazitizm evolyutsiyasi jarayonida genlarning ko'payishi va yo'qotilishi". PLOS biologiyasi. 9 (7): e1001094. doi:10.1371 / journal.pbio.1001094. PMC 3130010. PMID 21750662.
- ^ Gobler CJ, Berry DL, Dyhrman ST, Wilhelm SW, Salamov A, Lobanov AV va boshq. (2011 yil mart). "Aureococcus anophagefferens zararli suv o'tlari ekogenomikasi orqali aniqlandi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 108 (11): 4352–7. Bibcode:2011PNAS..108.4352G. doi:10.1073 / pnas.1016106108. PMC 3060233. PMID 21368207.
- ^ a b Gilson PR, Su V, Slamovits CH, Reith ME, Keeling PJ, McFadden GI (iyun 2006). "Xloraraxniofit nukleomorfining to'liq nukleotidlar ketma-ketligi: tabiatning eng kichik yadrosi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 103 (25): 9566–71. Bibcode:2006 yil PNAS..103.9566G. doi:10.1073 / pnas.0600707103. PMC 1480447. PMID 16760254.
- ^ a b v d Kurtis BA, Tanifuji G, Burki F, Gruber A, Irimiya M, Maruyama S va boshq. (2012 yil dekabr). "Algal genomlari evolyutsion mozaika va nukleomorflarning taqdirini ochib beradi". Tabiat. 492 (7427): 59–65. Bibcode:2012 yil 492 ... 59C. doi:10.1038 / tabiat11681. PMID 23201678.
- ^ Mur Idoralar, Kertis B, Mills T, Tanifuji G, Archibald JM (2012). "Chroomonas mesostigmatica CCMP1168 kriptofit algining nukleomorf genom ketma-ketligi naslga xos gen yo'qolishi va genomning murakkabligini ochib beradi". Genom biologiyasi va evolyutsiyasi. 4 (11): 1162–75. doi:10.1093 / gbe / evs090. PMC 3514955. PMID 23042551.
- ^ Tanifuji G, Onodera NT, Wheeler TJ, Dlutek M, Donaher N, Archibald JM (2012). "Fotosintetik bo'lmagan alga Cryptomonas paramecium-ning to'liq nukleomorf genom ketma-ketligi yadro nukleomorf genlar to'plamini ochib beradi". Genom biologiyasi va evolyutsiyasi. 3: 44–54. doi:10.1093 / gbe / evq082. PMC 3017389. PMID 21147880.
- ^ a b v BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F va boshqalarni o'qing. (2013 yil iyul). "Emiliania fitoplanktonining pan genomi uning global tarqalishiga yordam beradi". Tabiat. 499 (7457): 209–13. Bibcode:2013 yil natur.499..209.. doi:10.1038 / tabiat12221. PMID 23760476.
- ^ Kirish
- ^ a b v Mock T, Otillar RP, Strauss J, McMullan M, Paajanen P, Schmutz J va boshq. (2017 yil yanvar). "Sovuqqa moslashgan diatom Fragilariopsis silindrining evolyutsion genomikasi". Tabiat. 541 (7638): 536–540. Bibcode:2017 yil natur.541..536M. doi:10.1038 / nature20803. PMID 28092920.
- ^ a b Duglas S, Zauner S, Fraunholz M, Beaton M, Penny S, Deng LT va boshq. (2001 yil aprel). "Qulga olingan alg yadrosining yuqori darajada kamaytirilgan genomi". Tabiat. 410 (6832): 1091–6. Bibcode:2001 yil 4-noyabr. doi:10.1038/35074092. PMID 11323671.
- ^ a b Lane CE, van den Heuvel K, Kozera C, Kertis BA, Parsons BJ, Bowman S, Archibald JM (dekabr 2007). "Hemiselmis andersenii nukleomorf genomida intronning to'liq yo'qolishi va zichlashuvi oqsil tuzilishi va funktsiyasini harakatlantiruvchi omil sifatida namoyon bo'ladi". Amerika Qo'shma Shtatlari Milliy Fanlar Akademiyasi materiallari. 104 (50): 19908–13. Bibcode:2007PNAS..10419908L. doi:10.1073 / pnas.0707419104. PMC 2148396. PMID 18077423.
- ^ Baxter L, Tripatiya S, Ishoq N, Boot N, Kabral A, Kemen E va boshq. (2010 yil dekabr). "Hyaloperonospora arabidopsidis genomidagi majburiy biotrofiyaga moslashish imzolari". Ilm-fan. 330 (6010): 1549–1551. Bibcode:2010Sci ... 330.1549B. doi:10.1126 / science.1195203. PMC 3971456. PMID 21148394.
- ^ Radakovits R, Jinkerson RE, Fuerstenberg SI, Tae H, Settlage RE, Boore JL, Posewitz MC (fevral 2012). "Oleaginous alg Nannochloropis gaditana genomining ketma-ketligi va genetik o'zgarishi". Tabiat aloqalari. 3 (2): 686. Bibcode:2012 yil NatCo ... 3..686R. doi:10.1038 / ncomms1688. PMC 3293424. PMID 22353717.
- ^ Bowler C, Allen AE, Badger JH, Grimwood J, Jabbari K, Kuo A va boshq. (2008 yil noyabr). "Phaeodactylum genomi diatom genomlarining evolyutsion tarixini ochib beradi". Tabiat. 456 (7219): 239–44. Bibcode:2008 yil natur.456..239B. doi:10.1038 / tabiat07410. PMID 18923393.
- ^ Haas BJ, Kamoun S, Zody MC, Jiang RH, Handsaker RE, Cano LM va boshq. (Sentyabr 2009). "Irlandiyalik kartoshkada ochlik qo'zg'atuvchisi Phytophthora infestansining genomlari ketma-ketligi va tahlili" (PDF). Tabiat. 461 (7262): 393–8. Bibcode:2009 yil natur.461..393H. doi:10.1038 / nature08358. PMID 19741609. S2CID 4385549.
- ^ a b Tyler BM, Tripathy S, Zhang X, Dehal P, Jiang RH, Aerts A va boshq. (2006 yil sentyabr). "Fitoftora genomlari ketma-ketligi evolyutsion kelib chiqish va patogenez mexanizmlarini ochib beradi". Ilm-fan. 313 (5791): 1261–6. Bibcode:2006 yil ... 313.1261T. doi:10.1126 / science.1128796. PMID 16946064. S2CID 21287860.
- ^ Schwelm A, Fogelqvist J, Knaust A, Jyulke S, Lilja T, Bonilla-Rosso G va boshq. (Iyun 2015). "Plasmodiophora brassicae genomining hayot tsikli va xitin sintazlarining ajdodlari haqidagi tushunchalarni ochib beradi". Ilmiy ma'ruzalar. 5: 11153. Bibcode:2015 yil NatSR ... 511153S. doi:10.1038 / srep11153. PMC 4471660. PMID 26084520.
- ^ Carbone A, Siu A, Patel R (2010 yil sentyabr). "Pediatrik atopik dermatit: tibbiy boshqaruvni qayta ko'rib chiqish". Farmakoterapiya yilnomalari. 44 (9): 1448–58. doi:10.1345 / aph.1P098. PMID 20628042. S2CID 44649671.
- ^ a b Armbrust EV, Berges JA, Bowler C, Green BR, Martinez D, Putnam NH va boshq. (2004 yil oktyabr). "Thalassiosira pseudonana diatomining genomi: ekologiya, evolyutsiya va metabolizm". Ilm-fan. 306 (5693): 79–86. Bibcode:2004 yil ... 306 ... 79A. CiteSeerX 10.1.1.690.4884. doi:10.1126 / science.1101156. PMID 15459382. S2CID 8593895.
- ^ a b Franzén O, Jerlström-Hultqvist J, Kastro E, Shervud E, Ankarklev J, Reiner DS va boshq. (Avgust 2009). Petri V (tahrir). "Giardia intestinalis birikmasi B ning GS izolatsiyasini genom sekvensiyasini loyihalashtirish: odam lyardiozi ikki xil turdan kelib chiqadimi?". PLOS patogenlari. 5 (8): e1000560. doi:10.1371 / journal.ppat.1000560. PMC 2723961. PMID 19696920.
- ^ a b Morrison HG, McArthur AG, Gillin FD, Aley SB, Adam RD, Olsen GJ va boshq. (2007 yil sentyabr). "Giardia lamblia erta parazit ichak parazitida genomik minimalizm". Ilm-fan. 317 (5846): 1921–6. Bibcode:2007 yil ... 317.1921 million. doi:10.1126 / science.1143837. PMID 17901334. S2CID 29299317.
- ^ a b v d Peacock CS, Seeger K, Harris D, Murphy L, Ruiz JC, Quail MA va boshq. (2007 yil iyul). "Odamning turli kasalliklarini keltirib chiqaradigan uchta Leyshmaniya turlarining qiyosiy genomik tahlili". Tabiat genetikasi. 39 (7): 839–47. doi:10.1038 / ng2053. PMC 2592530. PMID 17572675.
- ^ a b Ivens AC, Peacock CS, Worthey EA, Murphy L, Aggarwal G, Berriman M va boshq. (2005 yil iyul). "Kinetoplastid parazitining genomi, Leishmania major". Ilm-fan. 309 (5733): 436–42. Bibcode:2005 yil ... 309..436I. doi:10.1126 / science.1112680. PMC 1470643. PMID 16020728.
- ^ a b v Fritz-Laylin LK, Prochnik SE, Ginger ML, Dacks JB, Carpenter ML, Field MC va boshq. (2010 yil mart). "Naegleria gruberi genomi erta ökaryotik ko'p qirralilikni yoritadi". Hujayra. 140 (5): 631–42. doi:10.1016 / j.cell.2010.01.032. PMID 20211133. S2CID 13901186.
- ^ a b Carlton JM, Hirt RP, Silva JC, Delcher AL, Schatz M, Zhao Q va boshq. (2007 yil yanvar). "Trichomonas vaginalis jinsiy yo'l bilan yuqadigan qo'zg'atuvchining genomlari ketma-ketligi". Ilm-fan. 315 (5809): 207–12. Bibcode:2007Sci ... 315..207C. doi:10.1126 / science.1132894. PMC 2080659. PMID 17218520.
- ^ a b Berriman M, Ghedin E, Xertz-Fouler S, Blandin G, Renauld H, Bartolomeu DC va boshq. (2005 yil iyul). "Afrikalik tripanosoma Trypanosoma brucei genomi". Ilm-fan. 309 (5733): 416–22. Bibcode:2005 yil ... 309..416B. doi:10.1126 / science.1112642. PMID 16020726. S2CID 18649858.
- ^ a b El-Sayed NM, Myler PJ, Bartholomeu DC, Nilsson D, Aggarwal G, Tran AN va boshq. (2005 yil iyul). "Chagas kasalligining etiologik agenti bo'lgan Trypanosoma cruzi ning genom ketma-ketligi". Ilm-fan. 309 (5733): 409–15. Bibcode:2005 yil ... 309..409E. doi:10.1126 / science.1112631. PMID 16020725. S2CID 3830267.
- ^ a b King N, Westbrook MJ, Young SL, Kuo A, Abedin M, Chapman J va boshq. (2008 yil fevral). "Monosiga brevicollis xanoflagellatining genomi va metazoanlarning kelib chiqishi". Tabiat. 451 (7180): 783–8. Bibcode:2008 yil natur.451..783K. doi:10.1038 / nature06617. PMC 2562698. PMID 18273011.