Butun genomlar ketma-ketligi - Whole genome sequencing

"Genom ketma-ketligi" bu erga yo'naltiriladi. Faqatgina DNKning ketma-ketligini ko'rish uchun qarang DNKning ketma-ketligi.
Elektroferogrammalar odatda genom qismlarini ketma-ketligi uchun ishlatiladi.[1]
Odam erkagi diploid genomini tashkil etuvchi 46 xromosomalarning tasviri. (The mitoxondriyal xromosoma ko'rsatilmagan.)

Butun genomlar ketma-ketligi go'yo to'liqligini aniqlash jarayoni DNK organizmning ketma-ketligi genom bir vaqtning o'zida. Bu organizmning barcha ketma-ketligini talab qiladi xromosoma Tarkibidagi DNK, shuningdek DNK mitoxondriya va o'simliklar uchun xloroplast. Amalda deyarli tugallangan genom sekanslari butun genom ketma-ketliklari deb ham ataladi.[2]

Butun genom sekvensiyasi asosan tadqiqot vositasi sifatida ishlatilgan, ammo klinikalarda 2014 yilda joriy qilingan.[3][4][5] Kelajakda shaxsiylashtirilgan tibbiyot, butun genom ketma-ketligi ma'lumotlari terapevtik aralashuvni boshqarish uchun muhim vosita bo'lishi mumkin.[6] Ning vositasi genlar ketma-ketligi da SNP funktsional variantlarni aniqlash uchun ham darajadan foydalaniladi uyushma tadqiqotlari va qiziqqan tadqiqotchilar uchun mavjud bo'lgan bilimlarni takomillashtirish evolyutsion biologiya, va shuning uchun kasallikka moyillikni bashorat qilish va giyohvand moddalarga javob berish uchun asos yaratishi mumkin.

Butun genom ketma-ketligi bilan aralashmaslik kerak DNKni profillash, bu faqat genetik materialning ma'lum bir shaxs yoki guruhdan kelib chiqish ehtimolini aniqlaydi va genetik munosabatlar, kelib chiqishi yoki o'ziga xos kasalliklarga moyilligi to'g'risida qo'shimcha ma'lumotlarni o'z ichiga olmaydi.[7] Bundan tashqari, butun genomni ketma-ketligini genomning o'ziga xos pastki qismlarini ketma-ketligi bilan aralashtirmaslik kerak - bunday usullar o'z ichiga oladi butun ekzome ketma-ketligi (Genomning 1-2%) yoki SNP genotipini yaratish (<0,1% genom). 2017 yildan boshlab hech kim uchun to'liq genom yo'q edi sutemizuvchilar, shu jumladan odamlar. Odam genomining 4% dan 9% gacha, asosan sun'iy yo'ldosh DNK, ketma-ketligi bo'lmagan[8]

Terminologiya

Bundan tashqari, sifatida tanilgan WGS, to'liq genom ketma-ketligi, to'liq genom ketma-ketligi, yoki butun genom ketma-ketligi.

Tarix

Sventsiyalangan birinchi bakterial butun genom bakteriya edi Gemofilus grippi.
Qurt Caenorhabditis elegans butun genomini tartiblashtirgan birinchi hayvon edi.
Drosophila melanogaster 'butun genom 2000 yilda tartiblangan.
Arabidopsis talianasi ketma-ketlikdagi birinchi o'simlik genomi edi.
Laboratoriya sichqonchasining genomi Muskul mushak 2002 yilda nashr etilgan.
Genomning ketma-ketligini yaratish uchun butun dunyo bo'ylab 10 olim va 50 olim kerak bo'ldi Elaeis guineensis (moyli palma ). Ushbu genomning ketma-ketligi ayniqsa qiyin edi, chunki u juda ko'p edi takroriy ketma-ketliklar ularni tashkil qilish qiyin bo'lgan.[9]

Masalan, 1970-80 yillarda ishlatilgan DNKning sekvensiyalash usullari qo'lda qo'llanilgan Maksam-Gilbert ketma-ketligi va Sanger ketma-ketligi. Bir necha butun bakteriofag va hayvonlarning virusli genomlari ushbu usullar bilan tartiblangan, ammo 1990-yillarda tezroq, avtomatlashtirilgan sekvensiya usullariga o'tish katta bakterial va eukaryotik genomlarning ketma-ketligini osonlashtirdi.[10]

Butun genomini tartiblashtirgan birinchi organizm bu edi Gemofilus grippi 1995 yilda.[11] Undan keyin boshqa bakteriyalarning genomlari va ba'zilari arxey birinchi navbatda, asosan, ularning kichik genom hajmi tufayli. H. grippi 1,830,140 bazaviy juft DNK genomiga ega.[11] Farqli o'laroq, eukaryotlar, ikkalasi ham bir hujayrali va ko'p hujayrali kabi Amoeba dubia va odamlar (Homo sapiens ) navbati bilan ancha katta genomlarga ega (qarang) S qiymati paradoksi ).[12] Amoeba dubia 700 milliard genomga ega nukleotid juftliklar minglab kishilarga tarqaldi xromosomalar.[13] Odamlarda kamroq bo'ladi nukleotid juftlik (har birida taxminan 3,2 mlrd jinsiy hujayralar - inson genomining aniq hajmi hali ham qayta ko'rib chiqilayotganiga e'tibor bering) nisbatan A. dubiya ammo ularning genom kattaligi alohida bakteriyalarning genom kattaligidan ustundir.[14]

Birinchi bakterial va arxeologik genomlar, shu jumladan H. grippi, tomonidan tartiblangan Miltiqni ketma-ketligi.[11] 1996 yilda birinchi ökaryotik genom (Saccharomyces cerevisiae ) ketma-ketligi S. cerevisiae, a model organizm yilda biologiya atigi 12 million atrofida genomga ega nukleotid juftliklar,[15] va birinchi bo'ldi bir hujayrali eukaryot butun genomini tartiblash uchun. Birinchi ko'p hujayrali eukaryot va hayvon, uning butun genomini ketma-ketligini yaratish edi nematod qurt: Caenorhabditis elegans 1998 yilda.[16] Eukaryotik genomlar ketma-ketlikda, DNKning qisqa parchalarini miltiq sekvensiyasi va undan kattaroq DNK klonlarini sekvensiyalash kabi bir necha usullar bilan ketma-ketlashtiriladi. DNK kutubxonalari kabi bakterial sun'iy xromosomalar (BAC) va xamirturushli sun'iy xromosomalar (YAC).[17]

1999 yilda insonning butun DNK ketma-ketligi xromosoma 22, eng past odam autosome, nashr etildi.[18] 2000 yilga kelib, ikkinchi hayvon va ikkinchisi umurtqasizlar (hali birinchi hasharotlar ) genom ketma-ketligi - mevali chivin Drosophila melanogaster - eksperimental tadqiqotlarda taniqli model model.[19] Birinchi o'simlik genom - bu namunali organizm Arabidopsis talianasi - shuningdek, 2000 yilgacha to'liq ketma-ketlikda edi.[20] 2001 yilga kelib, butun inson genomlari ketma-ketligining loyihasi nashr etildi.[21] Laboratoriya sichqonining genomi Muskul mushak 2002 yilda qurib bitkazilgan.[22]

2004 yilda, Inson genomining loyihasi inson genomining to'liq bo'lmagan versiyasini nashr etdi.[23] 2008 yilda Gollandiyaning Leyden shahridan bir guruh birinchi ayol genomining sekanslanishi haqida xabar berdi (Marjolein Krik ).

Hozirda minglab genomlar to'liq yoki qisman tartiblangan.

Eksperimental tafsilotlar

Tartiblash uchun ishlatiladigan hujayralar

DNKning to'liq nusxasini o'z ichiga olgan deyarli har qanday biologik namuna, hatto juda oz miqdordagi DNK yoki qadimiy DNK - genomning to'liq ketma-ketligi uchun zarur bo'lgan genetik materialni taqdim etishi mumkin. Bunday namunalar o'z ichiga olishi mumkin tupurik, epiteliya hujayralari, ilik, Soch (sochlar tarkibida a bor ekan soch follikulasi ), urug'lar, o'simlik barglari yoki DNK o'z ichiga olgan hujayralarga ega bo'lgan boshqa narsalar.

Hujayralarning aralash populyatsiyasi orasidan tanlangan bitta hujayraning genom ketma-ketligini metodlari yordamida aniqlash mumkin bitta hujayra genomini tartiblashtirish. Bu ma'lum bir mikroorganizm turining bitta hujayrasini mikroskop yordamida uning morfologik yoki boshqa ajralib turadigan xususiyatlari asosida aralash populyatsiyadan ajratib olish mumkin bo'lgan holatlarda ekologik mikrobiologiyada muhim afzalliklarga ega. Bunday hollarda organizmni madaniyatga ajratish va o'sishining odatdagi zaruriy bosqichlari qoldirilishi mumkin, bu esa organizm genomlarining ancha katta spektrlarini ketma-ketligini ta'minlashga imkon beradi.[24]

Yagona hujayra genomini tartiblash usuli sifatida sinovdan o'tkazilmoqda preimplantatsiya genetik diagnostikasi, bu erda yaratilgan embrion hujayrasi ekstrakorporal urug'lantirish oldin olinadi va tahlil qilinadi embrionni o'tkazish bachadonga.[25] Implantatsiyadan so'ng, hujayrasiz homilaning DNKsi oddiy tomonidan qabul qilinishi mumkin venipunktur onadan va homilaning butun genom sekvensiyasi uchun ishlatiladi.[26]

Dastlabki texnikalar

ABI PRISM 3100 genetik analizatori. Bunday kapillyar sekvensiyalar genomlarni sekvensiyalashning dastlabki harakatlarini avtomatlashtirdi.

Deyarli butun inson genomini ketma-ketlashtirish birinchi marta 2000 yilda qisman ov miltig'ini ketma-ketligi texnologiya. Kichik (4000-7000) uchun to'liq genomli ov miltig'ini tartiblash paytida asosiy juftlik ) genomlar 1979 yilda ishlatilgan,[27] kengroq qo'llanma, so'zma-so'z sifatida tanilgan juft juft tugatish ketma-ketligidan foydalandi ikki o'qli miltiqni ketma-ketligi. Sekvensiya loyihalari uzoqroq va murakkab genomlarni qabul qila boshlagach, bir nechta guruhlar DNK bo'lagining ikkala uchini ketma-ket ketma-ket qilish orqali foydali ma'lumotlarni olish mumkinligini anglay boshladilar. Bir xil fragmentning ikkala uchini ketma-ket ajratish va bog'langan ma'lumotni kuzatib borish ikkita alohida qismning bitta uchini ketma-ketlashtirishdan ko'ra ancha mashaqqatli bo'lgan bo'lsa-da, bu ikki ketma-ketlik qarama-qarshi yo'nalishga yo'naltirilganligi va har biridan alohida qismning uzunligi atrofida ekanligi boshqasi asl nishonning ketma-ketligini tiklashda qimmatli edi.

Juftlashtirilgan uchlarning ishlatilishining birinchi nashr etilgan tavsifi 1990 yilda insonning ketma-ketligi tarkibida bo'lgan HPRT lokus,[28] juftlashtirilgan uchlarini ishlatish an'anaviy ov miltig'ini ketma-ketlik yondashuvi qo'llanilgandan keyin bo'shliqlarni yopish bilan cheklangan bo'lsa ham. Doimiy uzunlikdagi bo'laklarni nazarda tutgan holda, sof juftlik bilan yakuniy ketma-ketlik strategiyasining birinchi nazariy tavsifi 1991 yilda bo'lgan.[29] 1995 yilda har xil o'lchamdagi bo'laklardan foydalanish bo'yicha yangilik kiritildi,[30] va katta maqsadlarda sof juftlik bilan yakuniy tartiblashtirish strategiyasini amalga oshirish mumkinligini namoyish etdi. Keyinchalik strategiya tomonidan qabul qilindi Genomik tadqiqotlar instituti (TIGR) bakteriyaning butun genomini ketma-ketlashtirish uchun Gemofilus grippi 1995 yilda,[31] va keyin Celera Genomics 2000 yilda barcha mevali chivinlar genomini ketma-ketlashtirish uchun,[32] va keyinchalik butun inson genomi. Amaliy biosistemalar, endi chaqirildi Hayotiy texnologiyalar, Celera Genomics va Inson Genom loyihasi tomonidan ishlatiladigan avtomatlashtirilgan kapillyar sekvensiyalarni ishlab chiqardi.

Amaldagi texnikalar

Asosiy maqola: DNKning ketma-ketligi

Kapillyar sekvensiya deyarli to'liq inson genomini muvaffaqiyatli ketma-ketlashtirish uchun birinchi yondashuv bo'lsa-da, u hali ham juda qimmat va tijorat maqsadlarida juda uzoq davom etadi. 2005 yildan boshlab kapillyarlarning ketma-ketligi asta-sekin siljiydi yuqori o'tkazuvchanlik (ilgari "keyingi avlod") kabi ketma-ketlik texnologiyalari Illumina bo'yoqlarini ketma-ketligi, pirosekvensiya va SMRT ketma-ketligi.[33] Ushbu texnologiyalarning barchasi asosiy miltiq strategiyasini, ya'ni genomni parchalash orqali parallellashtirish va shablonni yaratishda davom etmoqda.

Boshqa texnologiyalar, shu jumladan, paydo bo'lmoqda nanopore texnologiyasi. Nanopore ketma-ketlik texnologiyasi hali ham takomillashtirilgan bo'lsa-da, uning portativligi va uzoq o'qishlarni yaratish potentsiali butun genomlar ketma-ketligi dasturlari uchun dolzarbdir.[34]

Tahlil

Asos sifatida, to'liq genom sekvensiyasi xom ashyoni ta'minlashi mumkin nukleotid individual organizm DNKning ketma-ketligi. Shu bilan birga, ushbu ketma-ketlikning biologik yoki tibbiy ma'nosini ta'minlash uchun qo'shimcha tahlillarni o'tkazish kerak, masalan, ushbu ma'lumot kasalliklarning oldini olishga yordam berish uchun qanday ishlatilishi mumkin. Ma'lumotlarni ketma-ketligini tahlil qilish usullari ishlab chiqilmoqda va takomillashtirilmoqda.

Chunki ketma-ketlik ko'plab ma'lumotlarni hosil qiladi (masalan, taxminan olti milliard bor tayanch juftliklari har bir insonning diploid genomida), uning chiqishi elektron shaklda saqlanadi va katta miqdordagi hisoblash quvvati va saqlash hajmini talab qiladi.

WGS ma'lumotlarini tahlil qilish sekin bo'lishi mumkin bo'lsa-da, maxsus apparatlar yordamida ushbu bosqichni tezlashtirish mumkin.[35]

Tijoratlashtirish

Asosiy maqola: 1000 dollarlik genom
Tomonidan hisoblangan butun inson genomini sekvensiyalashning umumiy qiymati NHGRI.

Bir qator davlat va xususiy kompaniyalar tadqiqot va klinik foydalanish uchun tijorat jihatdan mustahkam bo'lgan to'liq genom sekvensiya platformasini ishlab chiqishda raqobatlashmoqdalar,[36] shu jumladan Illumina,[37] Knome,[38] Sequenom,[39]454 Hayot fanlari,[40] Tinch okeani biologlari,[41] To'liq Genomika,[42]Helicos Bioscience,[43] GE Global tadqiqot (General Electric ), Affimetriya, IBM, Intelligent Bio-tizimlari,[44] Life Technologies, Oksford Nanopore Technologies,[45] va Pekin Genomika instituti.[46][47][48] Ushbu kompaniyalar katta miqdorda moliyalashtiriladi va qo'llab-quvvatlanadi venchur kapitalistlari, to'siq mablag'lari va investitsiya banklari.[49][50]

2010 yillarning oxiriga qadar ketma-ketlikni saralash uchun odatda havola qilinadigan tijorat maqsadi bo'lgan $1,000 Biroq, xususiy kompaniyalar atigi $ 100 yangi maqsadga erishish uchun ishlamoqdalar.[51]

Rag'batlantirish

2006 yil oktyabr oyida X mukofot fondi, J. Kreyg Venter nomidagi ilmiy jamg'arma bilan hamkorlikda tashkil etilgan Archon X mukofoti Genomika uchun,[52] "Qurilmani qurib, undan 100 kun ichida yoki 100 kundan kam bo'lmagan vaqt ichida odamning 100 genomini ketma-ketlikda ishlata oladigan, har bir 1,000,000 bazasida bitta xatolik aniqligi bilan, ketma-ketligi kamida aniqligini qamrab oladigan birinchi guruhga" 10 million dollar mukofot berishni niyat qilgan. 98% genom, va takroriy xarajatlarda genom uchun 1000 dollardan oshmaydi ".[53] The Archon X mukofoti Genomics uchun 2013 yilda rasmiy boshlanish sanasidan oldin bekor qilingan.[54][55]

Tarix

2007 yilda, Amaliy biosistemalar SOLiD System deb nomlangan yangi sekvension turini sotishni boshladi.[56] Ushbu texnologiya foydalanuvchilarga 60 gigabazani ketma-ketlikda ishlashga imkon berdi.[57]

2009 yil iyun oyida Illumina a-da o'zlarining shaxsiy to'liq genomlarini ketma-ketlik xizmatini boshlashlarini e'lon qilishdi chuqurlik genom uchun $ 48,000 uchun 30 × dan.[58][59] Avgust oyida Helicos Bioscience asoschisi, Stiven Quake, kompaniyaning yagona molekula sekvenseri yordamida o'zining to'liq genomini 50 000 dollardan kamroq narxga ajratganligini aytdi.[60] Noyabr oyida "Complete Genomics" nashri tomonidan qayta ko'rib chiqilgan maqola chop etildi Ilm-fan 1700 dollarga to'liq inson genomini ketma-ketlik qilish qobiliyatini namoyish etadi.[61][62]

2011 yil may oyida Illumina o'zining to'liq genomini ketma-ketlashtirish xizmatini inson genomiga 5000 dollarga, yoki 50 yoki undan ortiq buyurtma bergan taqdirda 4000 dollarga tushirdi.[63]Helicos Bioscience, Pacific Bioscience, Complete Genomics, Illumina, Sequenom, ION Torrent Systems, Halcyon Molecular, NABsys, IBM va GE Global to'liq genomlar ketma-ketligini tijoratlashtirish uchun poyga boshida yurishgan ko'rinadi.[33][64]

Narxlarning ketma-ketligini pasayishi bilan bir qator kompaniyalar o'z uskunalari tez orada 1000 dollarlik genomga ega bo'lishini da'vo qila boshladilar: bu kompaniyalar Hayotiy texnologiyalar 2012 yil yanvar oyida,[65] Oxford Nanopore Technologies 2012 yil fevral oyida,[66] va Illumina 2014 yil fevral oyida.[67][68] 2015 yilda NHGRI butun genom ketma-ketligini olish xarajatlarini 1500 dollar atrofida deb taxmin qildi.[69] 2016 yilda, Veritas Genetika butun genomlar ketma-ketligini, shu jumladan sekvensiyadagi ba'zi ma'lumotlar to'g'risidagi hisobotni 999 dollarga sotishni boshladi.[70] 2019 yil yozida Veritas Genetics WGS narxini 599 dollarga tushirdi.[71] 2017 yilda BGI WGS-ni 600 dollarga taklif qila boshladi.[72]

Biroq, 2015 yilda ayrimlar butun genlar ketma-ketligini samarali ishlatish 1000 dollardan ko'proq xarajat qilishi mumkinligini ta'kidladilar.[73] Shuningdek, xabarlarga ko'ra, inson genomining 2017 yilgacha to'liq ketma-ketligi bo'lmagan qismlari qolmoqda.[74][75][76]

Boshqa texnologiyalar bilan taqqoslash

DNK mikroarraylari

To'liq genomlar ketma-ketligi genom haqida ma'lumot beradi, bu kattaligi buyurtma kattaroqdir DNK massivlari, genotiplash texnologiyasining oldingi rahbari.

Odamlar uchun DNK massivlari hozirda bir milliongacha genetik variant bo'yicha genotipik ma'lumot beradi,[77][78][79] to'liq genom sekvensiyasi esa inson genomidagi olti milliard asoslar yoki 3000 baravar ko'p ma'lumotlar haqida ma'lumot beradi. Shu sababli, genomning to'liq ketma-ketligi a deb hisoblanadi buzuvchi yangilik DNK massivlari bozorlariga, chunki ikkalasining ham aniqligi 99,98% dan 99,999% gacha (takrorlanmaydigan DNK mintaqalarida) va ularning sarflanadigan materiallari narxi 6 milliard baza jufti uchun 5000 AQSh dollar (ba'zi dasturlar uchun) DNK massivlari bilan raqobatbardosh (1 uchun 500 dollar) million taglik).[40]

Ilovalar

Mutatsion chastotalar

Butun genom ketma-ketligi mutatsiya butun inson genomlari uchun chastota. Odamlar uchun (ota-onadan bolaga) avlodlar orasidagi butun genomdagi mutatsion chastotasi bir avlod uchun taxminan 70 ta yangi mutatsiyani tashkil etadi.[80][81] 100 yoshga to'lgan yuz yoshli monozigotik (egizak egizaklar) juftlik uchun qon hujayralarida butun genom ketma-ketligini taqqoslaydigan o'zgarishning yanada past darajasi aniqlandi.[82] Faqat 8 ta somatik farq aniqlandi, ammo qon hujayralarining 20 foizidan kamrog'ida sodir bo'lgan somatik o'zgarish aniqlanmagan bo'lar edi.

Inson genomining maxsus oqsillarni kodlash hududlarida ota-ona / bola avlodlari orasidagi oqsillar ketma-ketligini o'zgartiradigan taxminan 0,35 mutatsiyalar mavjud (avlod uchun bitta mutatsiyalangan protein).[83]

Saraton kasalligida mutatsion chastotalar ancha yuqori genomning beqarorligi. Ushbu chastota bemorning yoshiga, DNKga zarar etkazuvchi vositalar ta'siriga (masalan, UV nurlanishi yoki tamaki tutunining tarkibiy qismlari) va DNKni tiklash mexanizmlarining faolligi / harakatsizligiga bog'liq bo'lishi mumkin.[iqtibos kerak ] Bundan tashqari, mutatsiya chastotasi saraton turlari orasida farq qilishi mumkin: germlin hujayralarida mutatsiya darajasi megabaza uchun taxminan 0,023 mutatsiyasida bo'ladi, ammo bu raqam ko'krak bezi saratonida (Mb uchun 1,18-1,66 somatik mutatsiyalar), o'pka saratonida (17,7) yoki melanomalarda (-33).[84] Gaploid odam genomi taxminan 3200 megabazadan iborat bo'lganligi sababli,[85] bu taxminan 74 ta mutatsiyaga aylanadi (asosan kodlash avlodlar) germline DNKda, lekin ko'krak bezi saratonida haploid genomiga 3,776-5,312 somatik mutatsiyalar, o'pka saratonida 56,640 va melanomalarda 105,600.

Somatik mutatsiyalarning inson genomida tarqalishi juda notekis,[86] genlarga boy, erta replikatsiya qilinadigan hududlar DNKning differentsial tuzatish faoliyati tufayli, ehtimol kam genlarga, kam takrorlanadigan heteroxromatinga nisbatan kamroq mutatsiyalar oladi.[87] Xususan, giston modifikatsiyasi H3K9me3 yuqori,[88] va H3K36me3 past mutatsion chastotalari bilan.[89]

Genom bo'yicha assotsiatsiyani o'rganish

Asosiy maqola: Genom bo'yicha assotsiatsiyani o'rganish

Tadqiqotda butun genomlar ketma-ketligini Genom-Wide Association Study (GWAS) - kasallik yoki boshqa biron bir fenotip bilan bog'liq bo'lgan genetik variant yoki variantlarni aniqlashga qaratilgan loyihada qo'llash mumkin.[90]

Diagnostik foydalanish

Qo'shimcha ma'lumotlar: Shaxsiy genomika, bashorat qiluvchi tibbiyot va tanlovli genetik va genomik test

2009 yilda, Illumina faqat tadqiqotlarda foydalanish va shifokorlardan farqli o'laroq klinik uchun tasdiqlangan birinchi butun genom sekvensiyalarini chiqardi akademik tibbiy markazlar standart yondashuvlar yordam bera olmagan odamlarning xatosini aniqlashga urinish uchun ularni jimgina ishlata boshladi.[91] 2009 yilda Stenford jamoasi boshchiligida Euan Eshli bioinjener Stiven Kvakning to'liq genomini klinik talqin qildi.[92] 2010 yilda Eshli jamoasi butun genom molekulyar otopsi haqida xabar berishdi[93] 2011 yilda esa Illumina platformasida ketma-ket birinchi oila bo'lgan G'arbiy oilaga izohlash tizimini kengaytirdi.[94] O'sha paytda genomni ketma-ketlashtirish narxi 19,500 AQSh dollarini tashkil etgan, bu bemorga hisob-kitob qilingan, ammo odatda tadqiqot granti hisobiga to'langan; o'sha paytda bir kishi o'z sug'urta kompaniyasidan qoplashni so'rab murojaat qilgan.[91] Masalan, bitta bolaga uch yoshga to'lgunga qadar 100 ga yaqin operatsiya kerak edi va uning shifokori muammoni aniqlash uchun butun genom sekansiga o'tdi; 12 kishidan iborat 30 kishilik jamoani talab qildi bioinformatika mutaxassislar, uchta sekvensiya bo'yicha mutaxassis, beshta shifokor, ikkita genetik maslahatchi va ikkita etika mutaxassislari noyob mutatsiyani aniqlash uchun XIAP bu keng tarqalgan muammolarni keltirib chiqarmoqda.[91][95][96]

Yaqinda xarajatlarning pasayishi tufayli (yuqoriga qarang) butun genomning ketma-ketligi DNK diagnostikasida real dasturga aylandi. 2013 yilda 3Gb-TEST konsortsiumi sog'liqni saqlash tizimini DNK diagnostikasidagi ushbu yangiliklarga tayyorlash uchun Evropa Ittifoqidan mablag 'oldi.[97][98] Sifatni baholash sxemalar, Sog'liqni saqlash texnologiyasini baholash va ko'rsatmalar joyida bo'lishi kerak. 3Gb-TEST konsortsiumi diagnostika jarayonidagi eng murakkab bosqich sifatida ketma-ketlik ma'lumotlarini tahlil qilish va talqin qilishni aniqladi.[99] 2014 yil sentyabr oyida Afinadagi Konsortsium yig'ilishida Konsortsium bu so'zni yaratdi genotranslyatsiya ushbu muhim qadam uchun. Ushbu qadam, deb nomlangan narsaga olib keladi genoreport. Ushbu hisobotlarning kerakli tarkibini aniqlash uchun ko'rsatmalar zarur.

Genomes2People (G2P), tashabbusi Brigham va ayollar shifoxonasi va Garvard tibbiyot maktabi 2011 yilda genomik sekvensiyaning kattalar va bolalarning klinik yordamiga qo'shilishini o'rganish uchun yaratilgan.[100] G2P direktori, Robert C. Green, ilgari REVEAL tadqiqotini olib borgan - Altsgeymer kasalligi uchun xavfni baholash va ta'lim - bemorlarning Altsgeymer uchun genetik xavfini bilishga bo'lgan munosabatini o'rganadigan bir qator klinik tadqiqotlar.[101][102]

2018 yilda San-Diego, Kaliforniya shtatidagi Rady Bolalar Genomik Tibbiyot Instituti tadqiqotchilari butun genomni tezkor sekvensiyalash (rWGS) genetik kasalliklarni o'z vaqtida tashxislashi mumkinligini aniqladilar o'tkir tibbiy yoki jarrohlik boshqaruvini o'zgartirish (klinik yordam) va o'tkir kasal chaqaloqlarda natijalarni yaxshilash . Tadqiqotchilar 2016 yil iyulidan 2017 yil martigacha viloyat bolalar shifoxonasida o'tkir kasal bo'lgan statsionar chaqaloqlarni retrospektiv kohort tadqiqoti haqida xabar berishdi. Qirq ikki oilaga genetik kasalliklarning etiologik diagnostikasi uchun rWGS berilgan. RWGS diagnostik sezgirligi standart genetik tekshiruvlar uchun 43% (42 go'dakning o'n sakkiztasi) va 10% (42 go'dakning to'rttasi) ni tashkil etdi (P = .0005). RWGS ning klinik foydaliligi darajasi (31%, 42 chaqaloqning o'n uchtasi) standart genetik testlarga qaraganda ancha yuqori (2%, 42 dan biri; P = .0015). RWGS diagnostikasi bo'lgan o'n bir (26%) chaqaloq kasallanishdan qochishdi, ulardan biri o'lim ehtimolligi 43% ga kamaydi va yana biri palliativ yordamni boshladi. O'n bitta chaqaloqning oltitasida menejmentdagi o'zgarishlar statsionar xarajatlarini 800000-2000.000 AQSh dollariga kamaytirdi. Ushbu topilmalar o'tkir kasal bo'lgan statsionar chaqaloqlarda rWGS ning klinik foydaliligini oldindan o'rganishni takrorlaydi va yaxshilangan natijalar va sog'liqni saqlashni tejashni namoyish etadi. rWGS ushbu parametrdagi birinchi darajali sinov sifatida ko'rib chiqishga loyiqdir.[103]

Noyob variant assotsiatsiyasini o'rganish

Butun genomlarni ketma-ketlik bo'yicha tadqiqotlar murakkab xususiyatlar, ham kodlash, ham kodlash o'rtasidagi bog'liqlikni baholashga imkon beradi noyob variantlar (kichik allel chastotasi (MAF) <1%) genom bo'ylab. Yagona variantli tahlillar odatda kam uchraydigan variantlar bilan assotsiatsiyani aniqlash uchun kam quvvatga ega va bir nechta noyob variantlar to'plamlarini ta'sirini birgalikda sinab ko'rish uchun variantlar to'plami sinovlari taklif qilingan.[104] SNP izohlari nodir funktsional variantlarni birinchi o'ringa qo'yishga yordam beradi va ushbu izohlarni kiritish butun genomlar ketma-ketligini o'rganish bo'yicha nodir variantlar genetik assotsiatsiyasining kuchini samarali ravishda oshirishi mumkin.[105]

Axloqiy muammolar

Butun genom sekvensiyasini joriy qilish axloqiy ta'sirga ega bo'lishi mumkin.[106] Bir tomondan, genetik tekshiruv genetik tekshiruvdan o'tayotgan shaxsda ham, ularning qarindoshlarida ham oldini olish mumkin bo'lgan kasalliklarni aniqlay oladi.[106] Boshqa tomondan, genetik test kabi potentsial minuslarga ega genetik kamsitish, maxfiylikni yo'qotish va kashf qilish kabi psixologik ta'sirlar otalikni bekor qilish.[107]

Ba'zi axloqshunoslar genetik tekshiruvdan o'tayotgan shaxslarning shaxsiy hayoti himoya qilinishi kerakligini ta'kidlaydilar.[106] Haqiqatdan ham, maxfiylik masalalar qachon alohida tashvishga solishi mumkin voyaga etmaganlar genetik tekshiruvdan o'tkaziladi.[108] Illuminaning bosh direktori Jey Flatley 2009 yil fevralida "2019 yilga kelib, ular tug'ilganda genlar xaritasini tuzish odatiy holga aylanadi" deb da'vo qilgan.[109] Genom sekvensiyasining ushbu potentsial ishlatilishi juda ziddiyatli, chunki u belgilanganiga ziddir axloqiy normalar bashorat qilish uchun genetik test sohalarida yaxshi o'rnatilgan asemptomatik voyaga etmaganlarning tibbiy genetika va genetik maslahat.[110][111][112][113] Genetika tekshiruvi bo'yicha an'anaviy ko'rsatmalar bir necha o'n yillar davomida kasallik bilan bog'liq bo'lgan genetik belgilarni sinash imkoniyati paydo bo'lganidan beri, iqtisodiy jihatdan har tomonlama genetik skrining paydo bo'lishidan oldin ishlab chiqilgan.

Shaxs butun genom sekvensiyasini boshdan kechirganda nafaqat o'zlarining DNK sekanslari, balki yaqin genetik qarindoshlarining DNK sekanslari haqida ham ma'lumot beradi.[106] Ushbu ma'lumot qarindoshlarning hozirgi va kelajakdagi sog'liq uchun xavf-xatarlari to'g'risida foydali taxminiy ma'lumotlarni yanada oshkor qilishi mumkin.[114] Shunday qilib, genetik tekshiruvdan o'tayotgan shaxslarning oila a'zolariga qanday majburiyatlar, agar ular mavjud bo'lsa, muhim savollar tug'iladi. G'arbiy / Evropa jamiyatida sinovdan o'tgan shaxslar har qanday genetik tashxis bo'yicha muhim ma'lumotlarni yaqin qarindoshlari bilan bo'lishishga da'vat etiladi, chunki nasl va boshqa yaqin qarindoshlar uchun genetik tashxisning ahamiyati odatda genetik tekshiruvni izlashning sabablaridan biridir. birinchi o'rin.[106] Shunga qaramay, bemorlar jiddiy genetik kasallik uchun tashxis qo'yilganligi to'g'risida ma'lumot berishdan bosh tortganlarida katta axloqiy nosozlik paydo bo'lishi mumkin, bu juda yuqori darajada oldini olish mumkin va shu kasallik mutatsiyasiga duchor bo'lgan qarindoshlar uchun katta xavf mavjud. Bunday sharoitda klinisyen qarindoshlari tashxisni bilishni afzalroq deb bilishi mumkin va shuning uchun klinisyen bemor-shifokor siriga nisbatan manfaatlar to'qnashuviga duch kelishi mumkin.[106]

Shaxsiy hayotga oid muammolar ilmiy tadqiqot ishlarida butun genom ketma-ketligidan foydalanilganda ham paydo bo'lishi mumkin. Tadqiqotchilar tez-tez bemorlarning genotiplari va fenotiplari to'g'risidagi ma'lumotlarni lokuslarga xos ma'lumotlar bazalari kabi jamoat ilmiy ma'lumotlar bazalariga kiritishlari kerak.[106] Garchi ma'lum bir ma'lumotlar bazalariga faqat noma'lum bemor ma'lumotlari yuborilgan bo'lsa-da, bemorlar qarindoshlari tomonidan kamdan-kam uchraydigan kasallik yoki kam uchraydigan mutansiyani aniqlashda aniqlanishi mumkin.[106] Ilg'or sud-tibbiyot metodlarini (masalan, ommaviy DNKning kelib chiqishi veb-saytlari va DNKni fenotiplash yondashuvlaridan foydalangan holda oilaviy izlash kabi) joriy etish bo'yicha jamoatchilik muhokamasi cheklangan, ajratilgan va yo'naltirilmagan. Sud genetikasi va tibbiy genetika genom sekvensiyasiga yaqinlashganda, genetik ma'lumotlar atrofidagi masalalar tobora bir-biriga bog'liq bo'lib, qo'shimcha huquqiy himoya choralarini ko'rish zarur bo'lishi mumkin.[115]

Jamiyat genomlari ketma-ketligi bo'lgan odamlar

Dastlabki deyarli to'liq inson genomlari asosan ikki amerikalik bo'lgan Shimoliy-g'arbiy Evropa ajdodlari 2007 yilda (J. Kreyg Venter 7,5 marta qamrov,[116][117][118] va Jeyms Uotson 7,4 baravar).[119][120][121] Buning ortidan 2008 yilda anonimning ketma-ketligi kuzatildi Xan xitoylari erkak (36 baravar),[122] a Yoruban odam Nigeriya (30 baravar),[123] ayol klinik genetik (Marjolein Krik ) Gollandiyadan (7 dan 8 baravargacha) va ayol kavkaz Leykemiya bemor (o'simta va normal to'qimalarni 33 va 14 marta qoplashda).[124] Stiv Jobs ularning genomini tartiblashtirgan dastlabki 20 kishidan biri bo'lgan, xabarlarga ko'ra 100000 dollar turadi.[125] 2012 yil iyun holatiga ko'ra, deyarli 69 deyarli to'liq inson genomlari mavjud edi.[126] 2013 yil noyabr oyida Ispaniyalik oila o'z shaxsiy genomik ma'lumotlarini a Creative Commons jamoat mulki litsenziyasi. Ish boshqarildi Manuel Korpas va tomonidan olingan ma'lumotlar iste'molchiga to'g'ridan-to'g'ri genetik test bilan 23 va men va Pekin Genomika instituti ). Bu birinchi shunday deb ishoniladi Ommaviy genomika butun oila uchun ma'lumotlar to'plami.[127]

Shuningdek qarang

Tartiblangan genomlar

Adabiyotlar

  1. ^ Alberts, Bryus; Jonson, Aleksandr; Lyuis, Julian; Raff, Martin; Roberts, Kit; Valter, Piter (2008). "8-bob". Hujayraning molekulyar biologiyasi (5-nashr). Nyu-York: Garland fani. p. 550. ISBN  978-0-8153-4106-2.
  2. ^ "Butun genom sekvensiyasining ta'rifi - NCI lug'ati saraton atamalari". Milliy saraton instituti. 2012-07-20. Olingan 2018-10-13.
  3. ^ Gilissen (2014 yil iyul). "Genomlar ketma-ketligi og'ir intellektual nogironlikning asosiy sabablarini aniqlaydi". Tabiat. 511 (7509): 344–7. Bibcode:2014 yil Noyabr. 511..344G. doi:10.1038 / tabiat13394. PMID  24896178. S2CID  205238886.
  4. ^ Nones, K; Vaddell, N; Uayt, N; Patch, AM; Beyli, P; Nyuell, F; Xolms, O; Fink, JL; Kvinn, MC; Tang, YH; Lampe, G; Quek, K; Loffler, KA; Manning, S; Idrisoglu, S; Miller, D; Xu, Q; Vaddell, N; Uilson, PJ; Bruxner, TJ; Masih, AN; Xarlivong, men; Nur, C; Nurbaxsh, E; Anderson, M; Kazakoff, S; Leonard, C; O'rmonlar; Simpson, PT; Reid, LE; Krauze, L; Xussi, DJ; Uotson, DI; Lord, RV; Nankarrow, D; Fillips, VA; Gotli, D; Smithers, BM; Whiteman, DC; Xeyvord, NK; Kempbell, PJ; Pearson, QK; Grimmond, SM; Barbour, AP (29 oktyabr 2014). "Genomik falokatlar qizilo'ngach adenokarsinomasida tez-tez paydo bo'lib, shish paydo bo'lishini keltirib chiqaradi". Tabiat aloqalari. 5: 5224. Bibcode:2014 yil NatCo ... 5.5224N. doi:10.1038 / ncomms6224. PMC  4596003. PMID  25351503.
  5. ^ van El, CG; Kornel, MC; Borri, P; Xastings, RJ; Fellmann, F; Xojson, SV; Xovard, HC; Kambon-Tomsen, A; Knoppers, BM; Meijers-Heijboer, H; Sheffer, H; Tranebyaerg, L; Dondorp, V; de Vert, GM (iyun 2013). "Sog'liqni saqlash sohasida butun genomlar ketma-ketligi. Evropa genetikasi jamiyatining tavsiyalari". Evropa inson genetikasi jurnali. 21 Qo'shimcha 1: S1-5. doi:10.1038 / ejhg.2013.46. PMC  3660957. PMID  23819146.
  6. ^ Mooney, Sean (2014 yil sentyabr). "Farmakogenomikani amaliyotga integratsiyalash bo'yicha taraqqiyot". Inson genetikasi. 134 (5): 459–65. doi:10.1007 / s00439-014-1484-7. PMC  4362928. PMID  25238897.
  7. ^ Kijk jurnali, 2009 yil 1-yanvar
  8. ^ "Psst, inson genomi hech qachon to'liq ketma-ketlikda bo'lmagan". STAT. 2017-06-20. Arxivlandi asl nusxasidan 2017-10-23 kunlari. Olingan 2017-10-23.
  9. ^ Marks, Vivien (2013 yil 11 sentyabr). "Keyingi avlod ketma-ketligi: Genom jumboqlari". Tabiat. 501 (7466): 263–268. Bibcode:2013 yil natur.501..263M. doi:10.1038 / 501261a. PMID  24025842.
  10. ^ al.], Bryus Alberts ... [et (2008). Hujayraning molekulyar biologiyasi (5-nashr). Nyu-York: Garland fani. p. 551. ISBN  978-0-8153-4106-2.
  11. ^ a b v Fleyshman, R .; Adams, M.; Oq, O; Kleyton, R .; Kirkness, E .; Kerlavage, A .; Bult, C .; Qabr, J .; Dougherty B.; Merrick, J .; al., e. (1995 yil 28-iyul). "Haemophilus influenzae Rd ning genogenom tasodifiy ketma-ketligi va yig'ilishi". Ilm-fan. 269 (5223): 496–512. Bibcode:1995 yilgi ... 269..496F. doi:10.1126 / science.7542800. PMID  7542800.
  12. ^ Eddi, Shon R. (2012 yil noyabr). "S qiymatidagi paradoks, keraksiz DNK va ENCODE". Hozirgi biologiya. 22 (21): R898-R899. doi:10.1016 / j.cub.2012.10.002. PMID  23137679.
  13. ^ Pellicer, Jume; FAY, Maykl F.; Leitch, Ilia J. (2010 yil 15 sentyabr). "Barchasining eng katta eukaryotik genomi?". Linnean Jamiyatining Botanika jurnali. 164 (1): 10–15. doi:10.1111 / j.1095-8339.2010.01072.x.
  14. ^ Inson genomini ketma-ketlashtirish konsortsiumi, Xalqaro (2004 yil 21 oktyabr). "Inson genomining evromatik ketma-ketligini tugatish". Tabiat. 431 (7011): 931–945. Bibcode:2004 yil natur.431..931H. doi:10.1038 / nature03001. PMID  15496913.
  15. ^ Goffo, A .; Barrel, B. G.; Bussi, X.; Devis, R. V.; Dyujon, B .; Feldmann, H.; Galibert, F.; Hoheisel, J. D .; Jak, C .; Jonston, M.; Louis, E. J.; Mewes, H. V.; Murakami, Y .; Filipppsen, P.; Tettelin, H.; Oliver, S. G. (25 oktyabr 1996). "6000 gen bilan hayot". Ilm-fan. 274 (5287): 546–567. Bibcode:1996Sci ... 274..546G. doi:10.1126 / science.274.5287.546. PMID  8849441. S2CID  16763139. Arxivlandi (PDF) asl nusxasidan 2016 yil 7 martda.
  16. ^ C. elegans Sequencing konsortsiumi (1998 yil 11-dekabr). "Nematod C. ning genom ketma-ketligi elegans: Biologiyani o'rganish platformasi". Ilm-fan. 282 (5396): 2012–2018. Bibcode:1998 yil ... 282.2012.. doi:10.1126 / science.282.5396.2012. PMID  9851916.CS1 maint: bir nechta ism: mualliflar ro'yxati (havola)
  17. ^ Alberts, Bryus (2008). Hujayraning molekulyar biologiyasi (5-nashr). Nyu-York: Garland fani. p. 552. ISBN  978-0-8153-4106-2.
  18. ^ Dunham, I. (1999 yil dekabr). "Inson xromosomasining DNK ketma-ketligi 22". Tabiat. 402 (6761): 489–495. Bibcode:1999 yil Natur.402..489D. doi:10.1038/990031. PMID  10591208.
  19. ^ Adams MD; Celniker SE; Xolt RA; va boshq. (2000-03-24). "Drosophila melanogasterning genom ketma-ketligi". Ilm-fan. 287 (5461): 2185–2195. Bibcode:2000Sci ... 287.2185.. CiteSeerX  10.1.1.549.8639. doi:10.1126 / science.287.5461.2185. PMID  10731132.
  20. ^ Arabidopsis genom tashabbusi (2000-12-14). "Arabidopsis thaliana gulli o'simlikning genom ketma-ketligini tahlil qilish". Tabiat. 408 (6814): 796–815. Bibcode:2000 yil Natur.408..796T. doi:10.1038/35048692. PMID  11130711.
  21. ^ Venter JC; Adams MD; Myers EW; va boshq. (2001-02-16). "Inson genomining ketma-ketligi". Ilm-fan. 291 (5507): 1304–1351. Bibcode:2001 yil ... 291.1304V. doi:10.1126 / science.1058040. PMID  11181995.
  22. ^ Waterston RH; Lindblad-Toh K; Birney E; va boshq. (2002-10-31). "Sichqoncha genomining dastlabki ketma-ketligi va qiyosiy tahlili". Tabiat. 420 (6915): 520–562. Bibcode:2002 yil natur.420..520W. doi:10.1038 / nature01262. PMID  12466850.
  23. ^ Xalqaro genom ketma-ketligini konsortsiumi (2004-09-07). "Inson genomining evromatik ketma-ketligini tugatish". Tabiat. 431 (7011): 931–945. Bibcode:2004 yil natur.431..931H. doi:10.1038 / nature03001. PMID  15496913.
  24. ^ Braslavskiy, Ido; va boshq. (2003). "Tartib ma'lumotlarini bitta DNK molekulalaridan olish mumkin". Proc Natl Acad Sci AQSh. 100 (7): 3960–3984. Bibcode:2003 PNAS..100.3960B. doi:10.1073 / pnas.0230489100. PMC  153030. PMID  12651960.
  25. ^ Xeger, Monika (2013 yil 2-oktabr). "Bir hujayrali ketma-ketlik klinikada saraton va PGD bilan birinchi qo'llaniladigan qadamlar". Klinik ketma-ketlik haqidagi yangiliklar.
  26. ^ Yurkievich, I. R .; Korf, B. R .; Lehmann, L. S. (2014). "Prenatal butun genom sekvensiyasi - bu homilaning kelajakdagi axloqiy holatini bilishga intilishmi?". Nyu-England tibbiyot jurnali. 370 (3): 195–7. doi:10.1056 / NEJMp1215536. PMID  24428465.
  27. ^ Staden R (1979 yil iyun). "Kompyuter dasturlaridan foydalangan holda DNK ketma-ketligi strategiyasi". Nuklein kislotalari rez. 6 (7): 2601–10. doi:10.1093 / nar / 6.7.2601. PMC  327874. PMID  461197.
  28. ^ Edvards, A; Caskey, T (1991). "Tasodifiy DNK sekvensiyasini yopish strategiyasi". Uslublar: Enzimologiyadagi usullarning sherigi. 3 (1): 41–47. doi:10.1016 / S1046-2023 (05) 80162-8.
  29. ^ Edvards A; Voss H; Guruch P; Civitello A; Stegemann J; Shvager C; Zimmermann J; Erfle H; Caskey CT; Ansorge V (1990 yil aprel). "Odamning HPRT lokusining avtomatlashtirilgan DNK sekvensiyasi". Genomika. 6 (4): 593–608. doi:10.1016 / 0888-7543 (90) 90493-E. PMID  2341149.
  30. ^ Roach JC; Boysen C; Vang K; Hood L (1995 yil mart). "Juftlik bilan yakuniy ketma-ketlik: genomik xaritalash va sekvensiyalashga yagona yondashuv". Genomika. 26 (2): 345–53. doi:10.1016 / 0888-7543 (95) 80219-C. PMID  7601461.
  31. ^ Fleischmann RD; Adams MD; Oq O; Kleyton RA; Kirkness EF; Kerlavage AR; Bult CJ; JF maqbarasi; Dougherty BA; Merrick JM; McKenney; Satton; Fitzhugh; Maydonlar; Gotsin; Skott; Sherli; Liu; Glodek; Kelley; Veydman; Fillips; Spriggs; Xedblom; Paxta; Utterback; Xanna; Nguyen; Saudek; va boshq. (1995 yil iyul). "Haemophilus influenzae Rd ning genogenom tasodifiy ketma-ketligi va yig'ilishi". Ilm-fan. 269 (5223): 496–512. Bibcode:1995 yilgi ... 269..496F. doi:10.1126 / science.7542800. PMID  7542800.
  32. ^ Adams, tibbiyot fanlari doktori; va boshq. (2000). "Drosophila melanogasterning genom ketma-ketligi". Ilm-fan. 287 (5461): 2185–95. Bibcode:2000Sci ... 287.2185.. CiteSeerX  10.1.1.549.8639. doi:10.1126 / science.287.5461.2185. PMID  10731132.
  33. ^ a b Mukhopadhyay R (2009 yil fevral). "DNK sekvensiyalari: keyingi avlod". Anal. Kimyoviy. 81 (5): 1736–40. doi:10.1021 / ac802712u. PMID  19193124.
  34. ^ Kvong, JK; Makkalum, N; Sintchenko, V; Xouden, BP (2015 yil aprel). "Klinik va sog'liqni saqlash mikrobiologiyasida barcha genomlar ketma-ketligi". Patologiya. 47 (3): 199–210. doi:10.1097 / pat.0000000000000235. PMC  4389090. PMID  25730631.
  35. ^ Striklend, Eliza (2015-10-14). "Yangi genetik texnologiyalar 26 soat ichida og'ir kasal chaqaloqlarni tashxislaydi - IEEE Spektri". Spectrum.ieee.org. Arxivlandi asl nusxasidan 2015-11-16 kunlari. Olingan 2016-11-11.
  36. ^ "Maqola: Butun genomni qisqartirish uchun poyga ketma-ketligi Genetik muhandislik va biotexnologiya yangiliklari - biotexnologiya dastgohdan biznesga". Genengnews.com. Arxivlandi asl nusxasi 2006-10-17 kunlari. Olingan 2009-02-23.
  37. ^ "Genomni ketma-ket ajratish xarajatlari pasayishda davom etmoqda". Eyeondna.com. Arxivlandi asl nusxasidan 2009-03-25. Olingan 2009-02-23.
  38. ^ Xarmon, Ketrin (2010-06-28). "Qolganlarimiz uchun genom ketma-ketligi". Ilmiy Amerika. Arxivlandi asl nusxasidan 2011-03-19. Olingan 2010-08-13.
  39. ^ San-Diego / Orange County texnologiyalari yangiliklari. "Uchinchi avlod nanoporlarga asoslangan yagona molekulalarni ketma-ketlik texnologiyasini ishlab chiqish uchun sekvenom". Freshnews.com. Arxivlandi asl nusxasi 2008-12-05 kunlari. Olingan 2009-02-24.
  40. ^ a b "Maqola: 24 soat ichida butun genom ketma-ketligi Genetik muhandislik va biotexnologiya yangiliklari - skameykadan biznesga biotexnologiya". Genengnews.com. Arxivlandi asl nusxasi 2006-10-17 kunlari. Olingan 2009-02-23.
  41. ^ "Pacific Bio o'zining yuqori tezlikdagi genomini ketma-ketlashtirish harakatida pardani ko'taradi". VentureBeat. 2008-02-10. Arxivlandi asl nusxasidan 2009-02-20. Olingan 2009-02-23.
  42. ^ "Bio-IT World". Bio-IT dunyosi. 2008-10-06. Arxivlandi asl nusxasidan 2009-02-17. Olingan 2009-02-23.
  43. ^ "Yangi mashina yordamida Helicos shaxsiy genomni ketma-ket ketma-ket keltiradi". Iqtisodiyot. 2008-04-22. Arxivlandi asl nusxasidan 2011-01-02. Olingan 2011-01-28.
  44. ^ "Barcha genomlarni tartiblashtirish xarajatlari pasayishda davom etmoqda: 2003 yilda 300 million dollar, 2007 yilda 1 million dollar, hozirda 60 ming dollar, yil oxiriga kelib 5000 dollar". Nextbigfuture.com. 2008-03-25. Arxivlandi asl nusxasidan 2010-12-20. Olingan 2011-01-28.
  45. ^ "Xan Caoning nanofluid chipi DNKning sekvensiya xarajatlarini keskin kamaytirishi mumkin". Texnologiyalarni ko'rib chiqish. Arxivlandi asl nusxasi 2011-03-29.
  46. ^ Julia Karow (2015 yil 26 oktyabr). "BGI Xitoyda Desktop Sequencer-ni ishga tushirmoqda; CFDA-da platformani ro'yxatdan o'tkazishni rejalashtirmoqda". GenomeWeb. Olingan 2 dekabr 2018.
  47. ^ "BGI Xitoyda yangi ish stoli Sequencer-ni ishga tushirdi, CFDA bilan katta versiyasini ro'yxatdan o'tkazdi". 360Dx. GenomeWeb. 2016 yil 11-noyabr. Olingan 2 dekabr 2018.
  48. ^ Monika Xeger (2018 yil 26 oktyabr). "BGI mijozlarga avvalgi asboblardan olingan ma'lumotlar to'g'risida hisobot berganligi sababli yangi sekvensionni ishga tushirdi". GenomeWeb. Olingan 2 dekabr 2018.
  49. ^ Jon Kerol (2008-07-14). "Pacific Bioscience texnologiyani ketma-ketligi uchun 100 million dollar oladi". FierceBiotech. Arxivlandi asl nusxasidan 2009-05-01. Olingan 2009-02-23.
  50. ^ Sibley, Liza (2009-02-08). "To'liq Genomika xarajatlarni tubdan pasayishiga olib keladi". Silikon vodiysi / San-Xose biznes jurnali. Sanjose.bizjournals.com. Olingan 2009-02-23.
  51. ^ Sara Nevill (2018 yil 5-mart). "DNKni arzonlashtirish sekvensiyasi noyob kasalliklarning sirlarini ochib beradi". Financial Times. Olingan 2 dekabr 2018.
  52. ^ Karlson, Rob (2007-01-02). "Genomni tezkor ketma-ketligi va Arxon mukofoti - sintez to'g'risida ozgina fikrlar". Sintez.cc. Arxivlandi asl nusxasidan 2009-08-08. Olingan 2009-02-23.
  53. ^ "PRIZE Umumiy Tasdiq: Genomika bo'yicha Archon X PRIZE".
  54. ^ Diamandis, Piter. "Innovatsiyalardan ustunlik: XPRIZEni bekor qilish". Huffington Post. Arxivlandi asl nusxasidan 2013-08-25.
  55. ^ Aldhous, Piter. "Genomlar uchun X mukofoti boshlanishidan oldin bekor qilindi". Arxivlandi asl nusxasidan 2016-09-21.
  56. ^ "SOLiD System - DNKning navbatdagi navbati platformasi e'lon qilindi". Gizmag.com. 2007-10-27. Arxivlandi asl nusxasidan 2008-07-19. Olingan 2009-02-24.
  57. ^ "1000 dollarlik Genom: Yaqinda?". Dddmag.com. 2010-04-01. Arxivlandi asl nusxasidan 2011-04-15. Olingan 2011-01-28.
  58. ^ "Shaxsiy genomlar ketma-ketligi - Illumina, Inc". Everygenome.com. Arxivlandi asl nusxasi 2011-10-19 kunlari. Olingan 2011-01-28.
  59. ^ "Illumina shaxsiy genomlarni sekvensiya xizmatini 48 ming dollarga ishga tushirdi: Genetik kelajak". Scienceblogs.com. Arxivlandi asl nusxasi 2009 yil 16 iyunda. Olingan 2011-01-28.
  60. ^ Veyd, Nikolay (2009-08-11). "Genomni dekodlash qiymati pasaytirildi". The New York Times. Arxivlandi asl nusxasidan 2013-05-21. Olingan 2010-05-03.
  61. ^ "Texnologiya indeksi". ABC News. Asl nusxasidan arxivlandi 2016 yil 15 may. Olingan 29 aprel 2018.CS1 maint: BOT: original-url holati noma'lum (havola)
  62. ^ Drmanac R, Sparks AB, Callow MJ va boshq. (2010). "Zanjirsiz tayanch yordamida odam genomini ketma-ketligi o'z-o'zidan yig'iladigan DNK nanoarralar haqida o'qiydi". Ilm-fan. 327 (5961): 78–81. Bibcode:2010Sci ... 327 ... 78D. doi:10.1126 / science.1181498. PMID  19892942. S2CID  17309571.
  63. ^ "Illumina 5000 dollarlik Genom narxini e'lon qildi - Bio-IT World". Arxivlandi asl nusxasi 2011-05-17.
  64. ^ "NHGRI mukofotlari DNKning ketma-ketligini aniqlash texnologiyasini rivojlantirish uchun 50 million dollardan ko'proq mablag '". Genom veb. 2009. Arxivlandi asl nusxasidan 2011-07-03.
  65. ^ "Life Technologies benchtop Ion Proton ™ Sequencer-ni taqdim etadi; inson genomini bir kunda 1000 dollarga dekodlash uchun mo'ljallangan" (Matbuot xabari). Arxivlandi asl nusxasi 2012 yil 23 dekabrda. Olingan 30 avgust, 2012.
  66. ^ ANDREW POLLACK (2012-02-17). "Oksford Nanoporasi DNKning ketma-ketligini aniqlash uchun kichik qurilmani namoyish qildi - The New York Times". The New York Times. Arxivlandi asl nusxasidan 2013-01-07. Olingan 2016-11-11.
  67. ^ "Illumina Sequencer 1000 dollarlik genomni taqdim etadi". Yangiliklar: Genomika va Proteomika. General Eng. Biotexnol. Yangiliklar (qog'oz). 34 (4). 15 Fevral 2014. p. 18.
  68. ^ Hayden, Erika-ni tekshiring (2014 yil 15-yanvar). "1000 dollarlik genom haqiqiymi?". Tabiat. doi:10.1038 / tabiat.2014.14530.
  69. ^ "Inson genomini sekvensiyalash narxi". www.genome.gov. Arxivlandi asl nusxasidan 2016-11-25.
  70. ^ "999 dollarlik butun genomni tartiblashtirish xizmati bilan Veritas DNK ma'lumotlarini demokratlashtirish maqsadiga kirishdi".
  71. ^ Endryu, Djo (2019-07-01). "23andMe raqobatchisi Veritas Genetics butun genom ketma-ketligini 40% dan 600 dollargacha pasaytirmoqda". CNBC. Olingan 2019-09-02.
  72. ^ Megan Molteni (2017 yil 18-may). "Xitoylik genom giganti eng yaxshi Sequencer-ga e'tibor qaratmoqda". Simli. Olingan 2 dekabr 2018.
  73. ^ Fillips, K. A; Pletcher, M. J; Ladabaum, U (2015). "" $ 1000 Genom "chindan ham $ 1000mi? Genomik ketma-ketlikning to'liq foydalari va xarajatlarini tushunish". Texnologiya va sog'liqni saqlash. 23 (3): 373–379. doi:10.3233 / THC-150900. PMC  4527943. PMID  25669213.
  74. ^ "Blog: inson genomining haqiqiy hajmi | Veritas genetikasi".
  75. ^ "Psst, inson genomi hech qachon to'liq ketma-ketlikda bo'lmagan". statnews.com. 2017-06-20.
  76. ^ "Eshitganingizga qaramay, inson genomining to'liq sekvensiyasi mavjud emas". geneticliteracyproject.org. 2017-06-23.
  77. ^ "Genomika yadrosi". Gladstone.ucsf.edu. Arxivlandi asl nusxasi 2010 yil 30 iyunda. Olingan 2009-02-23.
  78. ^ Nishida N; Koike A; Tajima A; Ogasavara Y; Ishibashi Y; Uehara Y; Inoue I; Tokunaga K (2008). "Affymetrix SNP Array 6.0 platformasining ishlashini 400 yaponiyalik shaxs bilan baholash". BMC Genomics. 9 (1): 431. doi:10.1186/1471-2164-9-431. PMC  2566316. PMID  18803882.
  79. ^ Petrone, Jastin. "Illumina, DeCode Build 1M SNP Chip; Affy-ning 6.0 SNP massivini chiqarish bilan tasodifan 2-chorani boshlash | BioArray yangiliklari | Array". GenomeWeb. Arxivlandi asl nusxasidan 2011-07-16. Olingan 2009-02-23.
  80. ^ Roach JC; Glusman G; Smit AF; va boshq. (2010 yil aprel). "Butun genomlar ketma-ketligi bo'yicha oilaviy kvartetdagi genetik merosni tahlil qilish". Ilm-fan. 328 (5978): 636–9. Bibcode:2010Sci ... 328..636R. doi:10.1126 / science.1186802. PMC  3037280. PMID  20220176.
  81. ^ Kempbell CD; Chong JX; Malig M; va boshq. (2012 yil noyabr). "Ta'sischi populyatsiyada autozigotlik yordamida odamning mutatsion darajasini baholash". Nat. Genet. 44 (11): 1277–81. doi:10.1038 / ng.2418. PMC  3483378. PMID  23001126.
  82. ^ Ye K; Beekman M; Lameijer EW; Chjan Y; Moed MH; van den Akker EB; Deelen J; Houwing-Duistermaat JJ; Kremer D; Anvar SY; Laros JF; Jons D; Reyn K; Blackburne B; Potluri S; Uzoq Q; Guryev V; van der Breggen R; Westendorp RG; Hoen PA; den Dunnen J; van Ommen GJ; Willemsen G; Pitts SJ; Cox DR; Ning Z; Boomsma DI; Slagboom PE (2013 yil dekabr). "Qarish somatik variantlarning tezlashtirilgan to'planishi sifatida: asrlik va o'rta yoshli monozigotik egizak juftlarning butun genom sekvensiyasi". Twin Res Hum Genet. 16 (6): 1026–32. doi:10.1017 / thg.2013.73. PMID  24182360.
  83. ^ Keightley PD (February 2012). "Rates and fitness consequences of new mutations in humans". Genetika. 190 (2): 295–304. doi:10.1534/genetics.111.134668. PMC  3276617. PMID  22345605.
  84. ^ Tuna M; Amos CI (November 2013). "Saraton kasalligida genomik sekvensiya". Saraton Lett. 340 (2): 161–70. doi:10.1016 / j.canlet.2012.11.004. PMC  3622788. PMID  23178448.
  85. ^ Moran, Laurence A. (24 March 2011). "Sandwalk: How Big Is the Human Genome?". sandwalk.blogspot.com. Arxivlandi asl nusxasidan 2017 yil 1 dekabrda. Olingan 29 aprel 2018.
  86. ^ Hodgkinson, Alan; Chen, Ying; Eyre-Walker, Adam (January 2012). "The large-scale distribution of somatic mutations in cancer genomes". Inson mutatsiyasi. 33 (1): 136–143. doi:10.1002/humu.21616. ISSN  1098-1004. PMID  21953857.
  87. ^ Supek, Fran; Lehner, Ben (2015-05-07). "DNKning nomuvofiqligini differentsial ravishda tuzatish, inson genomidagi mutatsiya darajasi o'zgarishiga asoslanadi". Tabiat. 521 (7550): 81–84. Bibcode:2015 yil 521 ... 81S. doi:10.1038 / tabiat14173. ISSN  0028-0836. PMC  4425546. PMID  25707793.
  88. ^ Shuster-Bokler, Benjamin; Lehner, Ben (2012-08-23). "Chromatin organization is a major influence on regional mutation rates in human cancer cells". Tabiat. 488 (7412): 504–507. Bibcode:2012Natur.488..504S. doi:10.1038/nature11273. ISSN  1476-4687. PMID  22820252. S2CID  205229634.
  89. ^ Supek, Fran; Lehner, Ben (2017-07-27). "Klasterli mutatsion imzolar DNKni tuzatishda faol genlarning mutatsiyasiga qaratilganligini aniqlaydi". Hujayra. 170 (3): 534-547.e23. doi:10.1016 / j.cell.2017.07.003. hdl:10230/35343. ISSN  1097-4172. PMID  28753428.
  90. ^ Yano, K; Yamamoto, E; Aya, K; Takeuchi, H; Lo, PC; Hu, L; Yamasaki, M; Yoshida, S; Kitano, H; Hirano, K; Matsuoka, M (August 2016). "Genome-wide association study using whole-genome sequencing rapidly identifies new genes influencing agronomic traits in rice". Tabiat genetikasi. 48 (8): 927–34. doi:10.1038/ng.3596. PMID  27322545. S2CID  22427006.
  91. ^ a b v Abbott, Phil (2010). "US clinics quietly embrace whole-genome sequencing : Nature News". Tabiat. doi:10.1038/news.2010.465. Arxivlandi asl nusxasidan 2017-04-16. Olingan 2016-11-11.
  92. ^ Ashley, EA; Butte, AJ; Wheeler, MT; Chen, R; Klein, TE; Dewey, FE; Dudley, JT; Ormond, KE; Pavlovic, A; Morgan, AA; Pushkarev, D; Neff, NF; Hudgins, L; Gong, L; Hodges, LM; Berlin, DS; Thorn, CF; Sangkuhl, K; Hebert, JM; Woon, M; Sagreiya, H; Vali, R; Knowles, JW; Chou, MF; Thakuria, JV; Rosenbaum, AM; Zaranek, AW; Church, GM; Greely, HT; Quake, SR; Altman, RB (1 May 2010). "Clinical assessment incorporating a personal genome". Lanset. 375 (9725): 1525–35. doi:10.1016/S0140-6736(10)60452-7. PMID  20435227.
  93. ^ Dewey, Frederick E.; Wheeler, Matthew T.; Cordero, Sergio; Perez, Marco V.; Pavlovic, Aleks; Pushkarev, Dmitriy; Freeman, James V.; Quake, Steve R.; Ashley, Euan A. (April 2011). "MOLECULAR AUTOPSY FOR SUDDEN CARDIAC DEATH USING WHOLE GENOME SEQUENCING". Amerika kardiologiya kolleji jurnali. 57 (14): E1159. doi:10.1016/S0735-1097(11)61159-5.
  94. ^ Dewey, Frederick E.; Chen, Rong; Cordero, Sergio P.; Ormond, Kelly E.; Caleshu, Colleen; Karczewski, Konrad J.; Whirl-Carrillo, Michelle; Wheeler, Matthew T.; Dudley, Joel T.; Byorns, Jeyk K .; Cornejo, Omar E.; Knowles, Joshua W.; Woon, Mark; Sangkuhl, Katrin; Gong, Li; Thorn, Caroline F.; Hebert, Joan M.; Capriotti, Emidio; David, Sean P.; Pavlovic, Aleksandra; West, Anne; Thakuria, Joseph V.; Ball, Madeleine P.; Zaranek, Alexander W.; Rehm, Heidi L.; Cherch, Jorj M.; West, John S.; Bustamante, Karlos D.; Snayder, Maykl; Altman, Rass B.; Klein, Teri E.; Butte, Atul J.; Ashley, Euan A. (15 September 2011). "Phased Whole-Genome Genetic Risk in a Family Quartet Using a Major Allele Reference Sequence". PLoS Genetika. 7 (9): e1002280. doi:10.1371/journal.pgen.1002280.
  95. ^ "One In A Billion: A boy's life, a medical mystery". Jsonline.com. Arxivlandi asl nusxasidan 2013-10-05. Olingan 2016-11-11.
  96. ^ Mayer AN, Dimmock DP, Arca MJ, et al. (2011 yil mart). "A timely arrival for genomic medicine". Genet. Med. 13 (3): 195–6. doi:10.1097/GIM.0b013e3182095089. PMID  21169843. S2CID  10802499.
  97. ^ "Introducing diagnostic applications of '3Gb-testing' in human genetics". Arxivlandi from the original on 2014-11-10.
  98. ^ Boccia S, Mc Kee M, Adany R, Boffetta P, Burton H, Cambon-Thomsen A, Cornel MC, Gray M, Jani A, Knoppers BM, Khoury MJ, Meslin EM, Van Duijn CM, Villari P, Zimmern R, Cesario A, Puggina A, Colotto M, Ricciardi W (August 2014). "Beyond public health genomics: proposals from an international working group". Eur J jamoat salomatligi. 24 (6): 877–879. doi:10.1093/eurpub/cku142. PMC  4245010. PMID  25168910.
  99. ^ "RD-Connect News 18 July 2014". Rd-connect.eu. Arxivlandi asl nusxasidan 2016 yil 10 oktyabrda. Olingan 2016-11-11.
  100. ^ "Genomes2People: A Roadmap for Genomic Medicine". www.frontlinegenomics.com. Arxivlandi asl nusxasidan 2017 yil 14 fevralda. Olingan 29 aprel 2018.
  101. ^ "The Risk Evaluation and Education for Alzheimer's Disease (REVEAL) Study - HBHE Genetics Research Group". hbhegenetics.sph.umich.edu. Arxivlandi asl nusxasidan 2017 yil 29 sentyabrda. Olingan 29 aprel 2018.
  102. ^ "Risk Evaluation and Education for Alzheimer's Disease (REVEAL) II - Full Text View - ClinicalTrials.gov". kliniktrials.gov. Arxivlandi asl nusxasidan 2017 yil 14 fevralda. Olingan 29 aprel 2018.
  103. ^ Farnaes L; Hildreth A; Sweeney NM; Clark MM; Chowdhury S; Nahas S; Cakici JA; Benson W; Kaplan RH; Kronick R; Bainbridge MN; Friedman J; Gold JJ; Ding Y; Veeraraghavan N; Dimmock D; Kingsmore SF (2018). "Rapid whole-genome sequencing decreases infant morbidity and cost of hospitalization". NPJ Genomic Medicine. 3: 10. doi:10.1038/s41525-018-0049-4. PMC  5884823. PMID  29644095.
  104. ^ Li, Seunggeung; Abekazis, Gonsalo R.; Boehke, Maykl; Lin, Xihong (2014 yil iyul). "Noyob-Variantlar assotsiatsiyasi tahlili: tadqiqotlarning dizayni va statistik testlar". Amerika inson genetikasi jurnali. 95 (1): 5–23. doi:10.1016 / j.ajhg.2014.06.009. ISSN  0002-9297. PMC  4085641. PMID  24995866.
  105. ^ Li, Sixao; Li, Zilin; Chjou, Xufen; Gaynor, Sheila M.; Liu, Yaovu; Chen, Xan; Quyosh, Rayan; Dey, Rounak; Arnett, Donna K.; Aslibekyan, Stella; Ballantyne, Christie M.; Bielak, Lourens F.; Blangero, Jon; Bervinkl, Erik; Bowden, Donald V.; Brom, Jay G; Konomos, Metyu P; Korrea, Adolfo; Cupples, L. Adrienne; Curran, Joanne E.; Fridman, Barri I .; Guo, Syutsin; Xindiy, Jorj; Irvin, Margerit R.; Kardia, Sharon L. R.; Kathiresan, sekar; Xan, Alyna T.; Kooperberg, Charlz L.; Laurie, Keti C.; Lyu, X. Shirli; Mahaney, Maykl S.; Manichaiku, Ani V.; Martin, Liza V.; Matias, Rasika A.; McGarvey, Stiven T.; Mitchell, Braxton D.; Montasser, may oyi; Mur, Jill E.; Morrison3, Alanna S.; O'Konnel, Jeffri R.; Palmer, Nikolet D.; Pampana, Axil; Peralta, Xuan M.; Peyser, Patrisiya A.; Psaty, Bryus M.; Redlin, Syuzan; Rays, Kennet M.; Boy, Stiven S.; Smit, Jennifer A.; Tivari, Xemant K.; Tsay, Maykl Y.; Vasan, Ramachandran S.; Vang, Fey Fey; Haftalar, Daniel E.; Veng, Zhiping; Uilson, Jeyms G.; Yanek, Liza R.; NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) konsortsiumi; TOPMed Lipidlar ishchi guruhi; Nil, Benjamin M.; Sunyaev, Shamil R.; Abekazis, Gonsalo R.; Rotter, Jerom I.; Viller, Kristen J.; Peloso, Jina M.; Natarajan, Pradeep; Lin, Xihong (2020 yil sentyabr). "Ko'p sonli silikon funktsional izohlarda dinamik ravishda qo'shilishi yirik genomlar ketma-ketligini o'rganish bo'yicha nodir variantlar assotsiatsiyasini tahlil qilishga imkon beradi". Tabiat genetikasi. 52 (9): 969–983. doi:10.1038 / s41588-020-0676-4. ISSN  1061-4036. PMC  7483769. PMID  32839606.
  106. ^ a b v d e f g h Sijmons, R.H.; Van Langen, I.M (2011). "A clinical perspective on ethical issues in genetic testing". Accountability in Research: Policies and Quality Assurance. 18 (3): 148–162. Bibcode:2013ARPQ...20..143D. doi:10.1080/08989621.2011.575033. PMID  21574071. S2CID  24935558.
  107. ^ Ayday E; De Cristofaro E; Hubaux JP; Tsudik G (2015). "The Chills and Thrills of Whole Genome Sequencing". arXiv:1306.1264 [cs.CR ].
  108. ^ Borry, P.; Evers-Kiebooms, G.; Cornel, MC; Clarke, A; Dierickx, K; Public Professional Policy Committee (PPPC) of the European Society of Human Genetics (ESHG) (2009). "Genetic testing in asymptomatic minors Background considerations towards ESHG Recommendations". Eur J Hum Genet. 17 (6): 711–9. doi:10.1038/ejhg.2009.25. PMC  2947094. PMID  19277061.
  109. ^ Henderson, Mark (2009-02-09). "Genetic mapping of babies by 2019 will transform preventive medicine". London: Times Online. Arxivlandi asl nusxasidan 2009-05-11. Olingan 2009-02-23.
  110. ^ McCabe LL; McCabe ER (June 2001). "Postgenomic medicine. Presymptomatic testing for prediction and prevention". Klinik Perinatol. 28 (2): 425–34. doi:10.1016/S0095-5108(05)70094-4. PMID  11499063.
  111. ^ Nelson RM; Botkjin JR; Kodish ED; va boshq. (Iyun 2001). "Ethical issues with genetic testing in pediatrics". Pediatriya. 107 (6): 1451–5. doi:10.1542/peds.107.6.1451. PMID  11389275.
  112. ^ Borry P; Fryns JP; Schotsmans P; Dierickx K (February 2006). "Carrier testing in minors: a systematic review of guidelines and position papers". Yevro. J. Xum. Genet. 14 (2): 133–8. doi:10.1038/sj.ejhg.5201509. PMID  16267502.
  113. ^ Borry P; Stultiens L; Nys H; Cassiman JJ; Dierickx K (November 2006). "Presymptomatic and predictive genetic testing in minors: a systematic review of guidelines and position papers". Klinika. Genet. 70 (5): 374–81. doi:10.1111/j.1399-0004.2006.00692.x. PMID  17026616. S2CID  7066285.
  114. ^ McGuire, Amy, L; Kolfild, Timoti (2008). "Science and Society: Research ethics and the challenge of whole-genome sequencing". Genetika haqidagi sharhlar. 9 (2): 152–156. doi:10.1038/nrg2302. PMC  2225443. PMID  18087293.
  115. ^ Kertis, Keytlin; Hereward, James; Mangelsdorf, Marie; Hussey, Karen; Devereux, John (18 December 2018). "Protecting trust in medical genetics in the new era of forensics". Tibbiyotdagi genetika. 21 (7): 1483–1485. doi:10.1038/s41436-018-0396-7. PMC  6752261. PMID  30559376.
  116. ^ Wade, Nicholas (September 4, 2007). "In the Genome Race, the Sequel Is Personal". Nyu-York Tayms. Arxivlandi asl nusxasidan 2009 yil 11 aprelda. Olingan 22 fevral, 2009.
  117. ^ Ledford, Heidi (2007). "Access : All about Craig: the first 'full' genome sequence". Tabiat. 449 (7158): 6–7. Bibcode:2007Natur.449....6L. doi:10.1038/449006a. PMID  17805257.
  118. ^ Levy S, Sutton G, Ng PC, Feuk L, Halpern AL, Walenz BP, Axelrod N, Huang J, Kirkness EF, Denisov G, Lin Y, MacDonald JR, Pang AW, Shago M, Stockwell TB, Tsiamouri A, Bafna V, Bansal V, Kravitz SA, Busam DA, Beeson KY, McIntosh TC, Remington KA, Abril JF, Gill J, Borman J, Rogers YH, Frazier ME, Scherer SW, Strausberg RL, Venter JC (September 2007). "Individual odamning диплоидli genom ketma-ketligi". PLOS Biol. 5 (10): e254. doi:10.1371 / journal.pbio.0050254. PMC  1964779. PMID  17803354.
  119. ^ Wade, Wade (June 1, 2007). "DNA pioneer Watson gets own genome map". International Herald Tribune. Arxivlandi asl nusxasi 2008 yil 27 sentyabrda. Olingan 22 fevral, 2009.
  120. ^ Veyd, Nikolay (2007 yil 31 may). "Genome of DNA Pioneer Is Deciphered". Nyu-York Tayms. Arxivlandi from the original on June 20, 2011. Olingan 21 fevral, 2009.
  121. ^ Wheeler DA; Srinivasan M; Egholm M; Shen Y; Chen L; McGuire A; He W; Chen YJ; Makhijani V; Roth GT; Gomes X; Tartaro K; Niazi F; Turcotte CL; Irzyk GP; Lupski JR; Chinault C; Song XZ; Liu Y; Yuan Y; Nazareth L; Qin X; Muzny DM; Margulies M; Weinstock GM; Gibbs RA; Rothberg JM (2008). "DNKning massiv parallel ravishda ketma-ket ketma-ket ketma-ketligi bilan jismoniy shaxsning to'liq genomi". Tabiat. 452 (7189): 872–6. Bibcode:2008 yil natur.452..872W. doi:10.1038 / nature06884. PMID  18421352.
  122. ^ Vang J; Vang, Vey; Li, Ruiqiang; Li, Yingrui; Tian, ​​Geng; Gudman, Lori; Fan, Vey; Chjan, Tsuntsin; Li, Jun; Zhang, Juanbin, Juanbin; Guo, Yiran, Yiran; Feng, Binxiao, Binxiao; Li, Heng, Heng; Lu, Yao, Yao; Fang, Xiaodong, Xiaodong; Liang, Huiqing, Huiqing; Du, Zhenglin, Zhenglin; Li, Dong, Dong; Zhao, Yiqing, Yiqing; Hu, Yujie, Yujie; Yang, Zhenzhen, Zhenzhen; Zheng, Hancheng, Hancheng; Hellmann, Ines, Ines; Inouye, Michael, Michael; Pool, John, John; Yi, Xin, Xin; Zhao, Jing, Jing; Duan, Jinjie, Jinjie; Zhou, Yan, Yan; va boshq. (2008). "Osiyolik kishining diploid genom ketma-ketligi". Tabiat. 456 (7218): 60–65. Bibcode:2008 yil natur.456 ... 60W. doi:10.1038 / nature07484. PMC  2716080. PMID  18987735.
  123. ^ Bentley DR; Balasubramanian S; va boshq. (2008). "Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry". Tabiat. 456 (7218): 53–9. Bibcode:2008Natur.456...53B. doi:10.1038/nature07517. PMC  2581791. PMID  18987734.
  124. ^ Ley TJ; Mardis ER; Ding L; Fulton B; McLellan MD; Chen K; Dooling D; Dunford-Shore BH; McGrath S; Hickenbotham M; Cook L; Abbott R; Larson DE; Koboldt DC; Pohl C; Smith S; Hawkins A; Abbott S; Locke D; Xillier LW; Miner T; Fulton L; Magrini V; Wylie T; Glasscock J; Conyers J; Sander N; Shi X; Osborne JR; va boshq. (2008). "DNA sequencing of a cytogenetically normal acute myeloid leukaemia genome". Tabiat. 456 (7218): 66–72. Bibcode:2008Natur.456...66L. doi:10.1038/nature07485. PMC  2603574. PMID  18987736.
  125. ^ Lohr, Steve (2011-10-20). "New Book Details Jobs's Fight Against Cancer". The New York Times. Arxivlandi asl nusxasidan 2017-09-28.
  126. ^ "Complete Human Genome Sequencing Datasets to its Public Genomic Repository". Arxivlandi asl nusxasi on June 10, 2012.
  127. ^ Corpas M, Cariaso M, Coletta A, Weiss D, Harrison AP, Moran F, Yang H (November 12, 2013). "A Complete Public Domain Family Genomics Dataset". bioRxiv  10.1101/000216.

Tashqi havolalar